GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)b-GlcNAc | 474639-84-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)b-GlcNAc
• 英文别名: (2S,3S,4S,5R,6R)-6-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-6-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-6-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-6-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-6-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-2-carboxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-2-carboxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-2-carboxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-2-carboxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid
• CAS: 474639-84-4
• 化学式: C₇₀H₁₀₇N₅O₅₆
• 分子量: 1914.62
• InChiKey: LSEDXWWDQCFYSU-BWWCNVOMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -17.9
• 重原子数：
  131
• 可旋转键数：
  33
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  952
• 氢给体数：
  32
• 氢受体数：
  56

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  hyaluronic acid 在 bovine testicular hyaluronidase type I-S 作用下， 反应 5.0h， 生成 GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)GlcNAc(b1-4)GlcA(b1-3)b-GlcNAc
  参考文献：
  名称：

  通过使用NMR残留偶极偶合和MD模拟了解透明质酸的构象性质

  摘要：

  透明质酸是一种具有重要生物学特性的重要多糖，其构象特征已通过核磁共振（NMR）光谱学和分子建模技术的结合使用来确定。透明质酸钠（HA）的十糖片段以明确的水环境形式经历了3.5 ns的分子动力学。通过透明质酸酶消化制备相同的十糖用于实验研究。该方法包括对NMR残留偶极偶合（RDC）的测量，该测量用于通过保留与实验观察结果一致的结构来过滤分子动力学数据。进一步分析新的一致性套件（HA RDC）并将分子相对于它们的总长度进行聚类，产生了七个代表性结构，这些结构是按照其次级图案（即最合适的螺旋几何形状）进行描述的。结果，该方案允许评估透明质酸可以采用两种不同的排列方式，这些排列方式可以用三折或四折的左手螺旋来描​​述，而第一个螺旋的发生率更高。

  DOI：

  10.1093/glycob/cwq067

文献信息

• Insights on the conformational properties of hyaluronic acid by using NMR residual dipolar couplings and MD simulations
  作者：V. Gargiulo、M. A. Morando、A. Silipo、A. Nurisso、S. Perez、A. Imberty、F. J. Canada、M. Parrilli、J. Jimenez-Barbero、C. De Castro

  DOI：10.1093/glycob/cwq067

  日期：2010.10.1

  combined used of nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy and molecular modeling techniques. A decasaccharide fragment of sodium hyaluronate (HA) was submitted to 3.5 ns of molecular dynamics in explicit water environment form. The same decasaccharide was prepared by hyaluronidase digestion for the experimental study. The approach consisted in the measurements of NMR residual dipolar coupling (RDC)

  透明质酸是一种具有重要生物学特性的重要多糖，其构象特征已通过核磁共振（NMR）光谱学和分子建模技术的结合使用来确定。透明质酸钠（HA）的十糖片段以明确的水环境形式经历了3.5 ns的分子动力学。通过透明质酸酶消化制备相同的十糖用于实验研究。该方法包括对NMR残留偶极偶合（RDC）的测量，该测量用于通过保留与实验观察结果一致的结构来过滤分子动力学数据。进一步分析新的一致性套件（HA RDC）并将分子相对于它们的总长度进行聚类，产生了七个代表性结构，这些结构是按照其次级图案（即最合适的螺旋几何形状）进行描述的。结果，该方案允许评估透明质酸可以采用两种不同的排列方式，这些排列方式可以用三折或四折的左手螺旋来描​​述，而第一个螺旋的发生率更高。