Kanamycin-Tobramycin

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Kanamycin-Tobramycin
• 英文别名: (2R,3S,4S,5R,6R)-2-(aminomethyl)-6-[(1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-3-[(2S,3R,4S,5S,6S)-4-amino-6-[2-[2-[2-[2-[[(2S,3S,4S,5R,6S)-4-amino-6-[(1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,5S,6R)-3-amino-6-(aminomethyl)-5-hydroxyoxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-3,5-dihydroxyoxan-2-yl]methylsulfanyl]ethoxy]ethyldisulfanyl]ethoxy]ethylsulfanylmethyl]-3,5-dihydroxyoxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxyoxane-3,4,5-triol
• 化学式: C₄₄H₈₇N₉O₂₀S₄
• 分子量: 1190.49
• InChiKey: PUVOKBYYDUAPKF-HOUZIVQFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -11.4
• 重原子数：
  77
• 可旋转键数：
  27
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  630
• 氢给体数：
  19
• 氢受体数：
  33

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  C₈₉H₁₅₉N₉O₃₈S₄ 在 Amberlite-400 resin 、 三氟乙酸 作用下， 生成 Kanamycin-Tobramycin
  参考文献：
  名称：

  二聚氨基糖苷的RNA结合增强。

  摘要：

  氨基糖苷类抗生素最近已成为一个有趣的RNA结合分子家族，它们已成为设计新型RNA配体的主要结构。氨基糖苷-RNA识别现象的去神秘化是开发高级结合剂所必需的。为了探索大RNA分子中多个结合位点的存在，我们合成了共价连接的对称和非对称二聚氨基糖苷。将这些非天然衍生物与它们的天然“单体”对应物在抑制四膜虫核酶方面的能力进行了比较。二聚氨基糖苷比其天然母体化合物更有效地抑制核酶功能20到1.2 x 10（3）倍。二聚氨基糖苷的抑制曲线具有特征性形状，表明在核酶的三维折叠中存在至少两个高亲和力结合位点。提出了二聚氨基糖苷与RNA分子的两个互补位点的相互作用。这种结合基序可能对靶向细菌和病毒病原体的关键RNA分子的新药物的开发有影响。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(99)00071-1

文献信息

• Enhanced RNA binding of dimerized aminoglycosides
  作者：Katja Michael、Hai Wang、Yitzhak Tor

  DOI：10.1016/s0968-0896(99)00071-1

  日期：1999.7

  symmetrical and nonsymmetrical dimeric aminoglycosides. These unnatural derivatives were compared to their natural "monomeric" counterparts in their ability to inhibit the Tetrahymena ribozyme. The dimeric aminoglycosides inhibit ribozyme function 20 to 1.2 x 10(3) fold more effectively than their natural parent compounds. The inhibition curves of dimeric aminoglycosides have characteristic shapes suggesting

  氨基糖苷类抗生素最近已成为一个有趣的RNA结合分子家族，它们已成为设计新型RNA配体的主要结构。氨基糖苷-RNA识别现象的去神秘化是开发高级结合剂所必需的。为了探索大RNA分子中多个结合位点的存在，我们合成了共价连接的对称和非对称二聚氨基糖苷。将这些非天然衍生物与它们的天然“单体”对应物在抑制四膜虫核酶方面的能力进行了比较。二聚氨基糖苷比其天然母体化合物更有效地抑制核酶功能20到1.2 x 10（3）倍。二聚氨基糖苷的抑制曲线具有特征性形状，表明在核酶的三维折叠中存在至少两个高亲和力结合位点。提出了二聚氨基糖苷与RNA分子的两个互补位点的相互作用。这种结合基序可能对靶向细菌和病毒病原体的关键RNA分子的新药物的开发有影响。