tert-butyl (2S)-2-amino-5-[[amino-[(2,2,4,6,7-pentamethyl-3H-1-benzofuran-5-yl)-sulfonylamino]methylidene]amino]pentanoate hydrochloride | 1217317-67-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: tert-butyl (2S)-2-amino-5-[[amino-[(2,2,4,6,7-pentamethyl-3H-1-benzofuran-5-yl)-sulfonylamino]methylidene]amino]pentanoate hydrochloride
• 英文别名: H-Arg(Pbf)-OtBu*HCl；Arg(Pbf)-OtBu•HCl；tert-Butyl Nw-((2,2,4,6,7-pentamethyl-2,3-dihydrobenzofuran-5-yl)sulfonyl)-L-argininate hydrochloride；tert-butyl (2S)-2-amino-5-[[amino-[(2,2,4,6,7-pentamethyl-3H-1-benzofuran-5-yl)sulfonylamino]methylidene]amino]pentanoate;hydrochloride
• CAS: 1217317-67-3
• 化学式: C₂₃H₃₈N₄O₅S*ClH
• 分子量: 519.105
• InChiKey: WKCFBQLFXPHSBQ-LMOVPXPDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.79
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  155
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (2S)-2-amino-5-[[amino-[(2,2,4,6,7-pentamethyl-3H-1-benzofuran-5-yl)-sulfonylamino]methylidene]amino]pentanoate hydrochloride 在 N-甲基吗啉 、 4-二甲氨基吡啶 、 茴香硫醚 、 1,2-乙二硫醇 、 苯甲醚 、 三氟乙酸 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 3-(N-succinylargininyl)bufotalin
  参考文献：
  名称：

  五种丁二烯内酯的统一全合成

  摘要：

  我们报告了五个bufadienolides的统一总合成：bufalin（1），bufogenin B（2），bufotalin（3），vulgarobufotoxin（4）和3-（N-琥珀酰精氨酰基）bufotalin（5）。甾体ABCD环8产生后，D环与2-吡喃酮部分交叉偶联并立体选择性环氧化生成6。TMSOTf促进了立体定向的1,2-氢化物从6转变为19的β定向2-吡喃酮。从官能团操作19提供1 - 5，可有效抑制癌细胞的生长。

  DOI：

  10.1021/acs.orglett.0c03251

文献信息

• Establishment of Molecular Design Strategy To Obtain Activatable Fluorescent Probes for Carboxypeptidases
  作者：Yugo Kuriki、Mako Kamiya、Hidemasa Kubo、Toru Komatsu、Tasuku Ueno、Ryo Tachibana、Kento Hayashi、Kenjiro Hanaoka、Suguru Yamashita、Takeaki Ishizawa、Norihiro Kokudo、Yasuteru Urano

  DOI：10.1021/jacs.7b11014

  日期：2018.2.7

  strategy to obtain activatable fluorescent probes for CPs by utilizing intramolecular spirocyclization of rhodamine to translate the "aliphatic carboxamide to aliphatic carboxylate" structural conversion catalyzed by CPs into dynamic fluorescence activation. Based on this novel strategy, we developed probes for carboxypeptidases A and B. One of these probes was able to detect pancreatic juice leakage

  羧肽酶 (CP) 是一类水解酶，可从肽或蛋白质的 C 端切割一个或多个氨基酸。然而，监测 CP 活动的方法并不完善。在这里，我们提出了第一个通用设计策略，通过利用罗丹明的分子内螺环化将 CP 催化的“脂肪族羧酰胺转化为脂肪族羧酸盐”结构转化转化为动态荧光激活，从而获得 CP 的可激活荧光探针。基于这种新策略，我们开发了羧肽酶 A 和 B 的探针。其中一种探针能够检测离体小鼠的胰液渗漏，表明其适用于胰瘘的术中诊断。这种设计策略应该广泛适用于 CP，
• Fluorescence Probes for Imaging Basic Carboxypeptidase Activity in Living Cells with High Intracellular Retention
  作者：Hirohisa Iwaki、Mako Kamiya、Minoru Kawatani、Ryosuke Kojima、Tatsuya Yamasoba、Yasuteru Urano

  DOI：10.1021/acs.analchem.0c04793

  日期：2021.2.23

  Basic carboxypeptidases (basic CPs) cleave the C-terminal basic amino acid of peptides, and their activity is upregulated in some types of cancers. Therefore, detecting the activity of basic CPs in living cells would be important not only for studying the physiological functions of these enzymes but also for visualization of cancerous tissues. Here, we report two fluorescein diacetate (FDA)-based activatable fluorescence probes, named 5ArgAF-FDA and 5LysAF-FDA, in which the substrate amino acid arginine or lysine is conjugated to the benzene moiety via an azoformyl linker. In live-cell fluorescence imaging of CPM, one of the seven basic CPs, 5ArgAF-FDA showed a larger intracellular fluorescence increase than did 5LysAF-FDA within a few minutes. This increase was inhibited by coincubation with 2-mercaptomethyl-3-guanidinoethylthiopropanoic acid (MGTA), an inhibitor of basic CPs. When 5ArgAF-FDA was applied to a coculture of two breast cancer cell lines with different CPM activities, the fluorescence increase in individual cells was correlated with the expression level of CPM, suggesting that 5ArgAF-FDA has the ability to distinguish cell lines having different levels of CPM activity, owing to its high intracellular retention. We believe these probes will be useful for imaging cancers with upregulated basic CP activity.

  碱性羧肽酶（碱性 CPs）能裂解肽的 C 端碱性氨基酸，在某些类型的癌症中，碱性 CPs 的活性会升高。因此，检测活细胞中碱性羧肽酶的活性不仅对研究这些酶的生理功能很重要，而且对癌症组织的可视化也很重要。在这里，我们报告了两种基于双乙酸荧光素（FDA）的可激活荧光探针，分别命名为 5ArgAF-FDA 和 5LysAF-FDA，其中底物氨基酸精氨酸或赖氨酸通过偶氮甲酰基连接物与苯分子共轭。在七种基本 CPs 之一 CPM 的活细胞荧光成像中，5ArgAF-FDA 在几分钟内显示出比 5LysAF-FDA 更大的细胞内荧光增加。与碱性氯化石蜡抑制剂 2-巯甲基-3-胍基乙基硫代丙酸（MGTA）同时使用可抑制这种增加。当将 5ArgAF-FDA 应用于两种具有不同 CPM 活性的乳腺癌细胞系的共培养时，单个细胞的荧光增加与 CPM 的表达水平相关，这表明 5ArgAF-FDA 由于其在细胞内的高滞留性，能够区分具有不同 CPM 活性水平的细胞系。我们相信，这些探针将有助于对基本 CP 活性上调的癌症进行成像。
• Cysteine-Based Mimic of Arginylation Reproduces Neuroprotective Effects of the Authentic Post-Translational Modification on α-Synuclein
  作者：Buyan Pan、Marie Shimogawa、Jun Zhao、Elizabeth Rhoades、Anna Kashina、E. James Petersson

  DOI：10.1021/jacs.2c02499

  日期：2022.5.4

  arginylated αS. We find that, consistent with authentically arginylated αS, mimic-arginylated αS does not perturb the protein’s native function but alters aggregation kinetics and monomer incorporation. Both mimic and authentically modified αS suppress aggregation in neuronal cells. Our results provide further insight into the neuroprotective effects of αS arginylation, and our alternative strategy to generate

  精氨酰化是一种正在研究的翻译后修饰 (PTM)，涉及将精氨酸转移到蛋白质中的天冬氨酸或谷氨酸侧链。该 PTM 的目标之一是 α-突触核蛋白 (αS)，一种参与调节突触小泡的神经元蛋白。 αS 的聚集与神经退行性疾病有关，特别是帕金森病，而精氨酰化已被发现可以防止这种病理过程。精酰化 αS 已通过涉及多部分天然化学连接 (NCL) 的半合成进行了研究，但这可能非常劳动密集型且产量低。在这里，我们提出了一种简便的方法，将精氨酰化修饰的模拟物引入感兴趣的蛋白质中，与荧光团等标签的正交安装兼容。我们合成溴乙酰精氨酸并将其与αS的重组、位点特异性半胱氨酸突变体反应。我们通过测试模拟精酰化 αS 的囊泡结合亲和力及其聚集动力学和单体掺入原纤维来验证模拟，并将这些结果与通过 NCL 产生的真正精氨酸化 αS 的结果进行比较。在培养的神经元中，我们比较了携带少量精氨酸 αS 的预形成原纤维的原纤维播种能力。我们发现，与真正的精氨酰化
• Modular Design Platform for Activatable Fluorescence Probes Targeting Carboxypeptidases Based on ProTide Chemistry
  作者：Yugo Kuriki、Mari Sogawa、Toru Komatsu、Minoru Kawatani、Hiroyoshi Fujioka、Kyohhei Fujita、Tasuku Ueno、Kenjiro Hanaoka、Ryosuke Kojima、Rumi Hino、Hiroki Ueo、Hiroaki Ueo、Mako Kamiya、Yasuteru Urano

  DOI：10.1021/jacs.3c10086

  日期：2024.1.10

  position P1 enabled us to precisely optimize the reactivity for target CPs. As a proof-of-concept, we constructed probes for carboxypeptidase M (CPM) and prostate-specific membrane antigen (also known as glutamate carboxypeptidase II). The developed probes were applicable for the imaging of CP activities in live cells and in clinical specimens from patients. This design strategy should be useful in

  羧肽酶（CP）是一类水解酶，可从肽或蛋白质的C端裂解一个或多个氨基酸，在各种生理和病理过程中发挥着不可或缺的作用。然而，目前仅报道了一些高度可激活的CP荧光探针，因此需要一个灵活可调的分子设计平台来为生物和医学研究提供一系列CP荧光探针。在这里，我们重点研究了基于ProTide的前药的独特激活机制，并建立了基于ProTide化学的CP靶向荧光探针的模块化设计平台。在该设计中，通过改变四个探针模块，例如荧光发射波长、反应性/稳定性和目标CP，可以轻松调整和优化探针特性：荧光团、磷原子上的取代基、P1位置的连接氨基酸，以及 P1' 位的底物氨基酸。特别是，转换 P1 位点的连接氨基酸使我们能够精确优化目标 CP 的反应性。作为概念验证，我们构建了羧肽酶 M (CPM) 和前列腺特异性膜抗原（也称为谷氨酸羧肽酶 II）的探针。开发的探针适用于活细胞和患者临床标本中 CP 活性的成像。这种设计策略应该有助于研究
• Parallel Synthesis of An Oligomeric Imidazole-4,5-dicarboxamide Library
  作者：Zhigang Xu、John C. DiCesare、Paul W. Baures

  DOI：10.1021/cc1000105

  日期：2010.3.8

  A library of oligomeric compounds was synthesized based on the imidazole-4,5-dicarboxylic acid scaffold along, with amino acid esters and chiral diamines derived from amino acids. The final compounds incorporate nonpolar amino acids (Leu, Phe, Trp), polar amino acids (Ser, Asp, Arg), and neutral amino acids (Gly, Ala), and were designed to be useful in screening for inhibitors of protein-protein interactions. Many of the protected and deprotected oligomers show evidence of conformational isomers persistent at room temperature in aqueous solution. A total of 317 final oligomers, out of 441 targeted compounds, were obtained in high analytical purity and of sufficient quantity to submit them for high-throughput screening as part of the NIH Roadmap.