YYDPETGTWY | 1073283-71-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: YYDPETGTWY
• 英文别名: CLN025；Tyr-Tyr-Asp-Pro-Glu-Thr-Gly-Thr-Trp-Tyr；H-Tyr-Tyr-Asp-Pro-Glu-Thr-Gly-Thr-Trp-Tyr-OH；(4S)-4-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-3-carboxypropanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-5-[[(2S,3R)-1-[[2-[[(2S,3R)-1-[[(2S)-1-[[(1S)-1-carboxy-2-(4-hydroxyphenyl)ethyl]amino]-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid
• CAS: 1073283-71-2
• 化学式: C₆₂H₇₅N₁₁O₂₀
• 分子量: 1294.34
• InChiKey: WCFSSPKSYZSRQD-NQVSDHCCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.9
• 重原子数：
  93
• 可旋转键数：
  33
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  508
• 氢给体数：
  18
• 氢受体数：
  21

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-O-叔丁基-L-谷氨酸 、 Fmoc-甘氨酸 、 Fmoc-O-叔丁基-L-酪氨酸 、 Fmoc-L-脯氨酸 、 Fmoc-L-天冬氨酸 beta-叔丁酯 、 Fmoc-L-色氨酸(Boc)-OH 、 Fmoc-O-叔丁基-L-苏氨酸 、 在 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 哌啶 、 1-羟基苯并三唑 、 三异丙基硅烷 、 水 、 三氟乙酸 作用下， 反应 2.22h， 生成 YYDPETGTWY
  参考文献：
  名称：

  β-发夹形成小蛋白 CLN025 在各种溶剂中的 VCD 光谱特性。

  摘要：

  电子和振动圆二色性常用于确定蛋白质的二级结构，因为每个二级结构都有独特的光谱。对β-发夹的振动圆二向色光谱特征知之甚少。在这项研究中，确定了十肽 YYDPETGTWY (CLN025) 的 VCD 光谱特征，它形成稳定的 β-发夹，通过分子内弱极性相互作用和氢键稳定。分子动力学模拟和 ECD 光谱偏振法用于确认 CLN025 在水、TFE、MeOH 和 DMSO 中采用 β-发夹，并检查二级结构、氢键和弱极性相互作用的差异。CLN025 是通过微波辅助固相肽合成与 N(α)-Fmoc 保护的氨基酸合成的。VCD 光谱显示了一个 (-,+,-) 模式，带在 1640 到 1656 cm(-1)、1667 到 1687 cm(-1) 和 1679 到 1686 cm(-1)频率负耦合和更高频率的正耦合。在 1647 至 1663 cm(-1) 处观察到最大 IR 吸光度，在 1630 cm(-1)、1646

  DOI：

  10.1002/bip.21356

文献信息

• VCD spectroscopic properties of the β-hairpin forming miniprotein CLN025 in various solvents
  作者：Marcus P. D. Hatfield、Richard F. Murphy、Sándor Lovas

  DOI：10.1002/bip.21356

  日期：2010.5

  vibrational circular dichroic spectroscopic features of the beta-hairpin. In this study, the VCD spectral features of a decapeptide, YYDPETGTWY (CLN025), which forms a stable beta-hairpin that is stabilized by intramolecular weakly polar interactions and hydrogen bonds were determined. Molecular dynamics simulations and ECD spectropolarimetry were used to confirm that CLN025 adopts a beta-hairpin in water

  电子和振动圆二色性常用于确定蛋白质的二级结构，因为每个二级结构都有独特的光谱。对β-发夹的振动圆二向色光谱特征知之甚少。在这项研究中，确定了十肽 YYDPETGTWY (CLN025) 的 VCD 光谱特征，它形成稳定的 β-发夹，通过分子内弱极性相互作用和氢键稳定。分子动力学模拟和 ECD 光谱偏振法用于确认 CLN025 在水、TFE、MeOH 和 DMSO 中采用 β-发夹，并检查二级结构、氢键和弱极性相互作用的差异。CLN025 是通过微波辅助固相肽合成与 N(α)-Fmoc 保护的氨基酸合成的。VCD 光谱显示了一个 (-,+,-) 模式，带在 1640 到 1656 cm(-1)、1667 到 1687 cm(-1) 和 1679 到 1686 cm(-1)频率负耦合和更高频率的正耦合。在 1647 至 1663 cm(-1) 处观察到最大 IR 吸光度，在 1630 cm(-1)、1646