Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-6)[GlcNAc(b1-2)Man(a1-3)]Man(b1-4)b-GlcNAc

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-6)[GlcNAc(b1-2)Man(a1-3)]Man(b1-4)b-GlcNAc
• 英文别名: N-[(2R,3R,4R,5S,6R)-5-[(2S,3S,4S,5R,6R)-4-[(2R,3S,4S,5S,6R)-3-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-[[(2S,3S,4S,5S,6R)-3-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,5-dihydroxyoxan-2-yl]oxy-2,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide
• 化学式: C₄₈H₈₁N₃O₃₆
• 分子量: 1276.17
• InChiKey: WVTJFIQAUQHZKU-WIVVTURSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -13.8
• 重原子数：
  87
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.94
• 拓扑面积：
  612
• 氢给体数：
  23
• 氢受体数：
  36

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Gal(b1-4)GlcNAc(b1-2)Man(a1-6)[GlcNAc(b1-2)Man(a1-3)]Man(b1-4)b-GlcNAc 在 2-氯-1,3-二甲基氯化咪唑啉 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  使用合成同位素标记标准品对血清 IgG 糖肽进行简化的亚类特异性绝对定量

  摘要：

  绝对糖蛋白组学定量由于其在生物标志物发现和临床实施方面的前景而引起了极大的关注，但由于普遍缺乏合适的重同位素标记的糖肽标准品而受到阻碍。在这项研究中，我们设计了一种简便的化学酶策略来合成总共 36 种带有明确糖型的人 IgG 糖肽，其中包括 15 种同位素标记的糖肽，其质量比其天然对应物增加了 6 Da。将这些标准品掺入人血清中，能够以亚类特异性方式对 IgG 糖肽进行简化、稳健且精确的绝对定量。此外，绝对定量方法的实施揭示了结肠癌样本中血清 IgG 半乳糖基化和唾液酸化的亚类依赖性改变。

  DOI：

  10.1021/acs.analchem.0c04462

文献信息

• Streamlined Subclass-Specific Absolute Quantification of Serum IgG Glycopeptides Using Synthetic Isotope-Labeled Standards
  作者：Shuaishuai Wang、Ding Liu、Jingyao Qu、He Zhu、Congcong Chen、Christopher Gibbons、Harmon Greenway、Peng Wang、Roni J. Bollag、Kebin Liu、Lei Li

  DOI：10.1021/acs.analchem.0c04462

  日期：2021.3.16

  isotope-labeled ones with a mass increment of 6 Da to their native counterparts. Spiking of these standards into human sera enabled simplified, robust, and precise absolute quantification of IgG glycopeptides in a subclass-specific fashion. Additionally, the implementation of the absolute quantification approach revealed subclass-dependent alteration of serum IgG galactosylation and sialylation in colon

  绝对糖蛋白组学定量由于其在生物标志物发现和临床实施方面的前景而引起了极大的关注，但由于普遍缺乏合适的重同位素标记的糖肽标准品而受到阻碍。在这项研究中，我们设计了一种简便的化学酶策略来合成总共 36 种带有明确糖型的人 IgG 糖肽，其中包括 15 种同位素标记的糖肽，其质量比其天然对应物增加了 6 Da。将这些标准品掺入人血清中，能够以亚类特异性方式对 IgG 糖肽进行简化、稳健且精确的绝对定量。此外，绝对定量方法的实施揭示了结肠癌样本中血清 IgG 半乳糖基化和唾液酸化的亚类依赖性改变。