Galb1-4GlcNAcb1-6(Fuca1-2Galb1-3GlcNAcb1-3)Galb1-4Glc

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Galb1-4GlcNAcb1-6(Fuca1-2Galb1-3GlcNAcb1-3)Galb1-4Glc
• 英文别名: N-[(2R,3R,4R,5S,6R)-2-[[(2R,3S,4S,5R,6S)-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4-[(2R,3R,4S,5R,6R)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-[(2S,3S,4R,5S,6S)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-[(2R,3S,4R,5R)-4,5,6-trihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxyoxan-2-yl]methoxy]-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-3-yl]acetamide
• 化学式: C₄₆H₇₈N₂O₃₅
• 分子量: 1219.12
• InChiKey: DCGBXXFQFZBARZ-VRZFXKFKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -13.3
• 重原子数：
  83
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.96
• 拓扑面积：
  583
• 氢给体数：
  22
• 氢受体数：
  35

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  guanosine-5'-diphospho-β-L-fucose 、 D-Galβ1-3-D-GlcNAcβ1-3(D-Galβ1-4-D-GlcNAcβ1-6)-D-Galβ1-4-D-Glc 在 recombinant Helicobacter pylori NCTC11639 α1,2-fucosyltransferase 、 manganese(ll) chloride 作用下， 生成 Galb1-4GlcNAcb1-6(Fuca1-2Galb1-3GlcNAcb1-3)Galb1-4Glc
  参考文献：
  名称：

  幽门螺杆菌α1,2-岩藻糖基转移酶的表征，用于酶促合成肿瘤相关抗原。

  摘要：

  来自幽门螺杆菌的α1,2-岩藻糖基转移酶（α1,2-FucT）催化末端Galβ单元的C2-OH上受体寡糖的岩藻糖基化。评价了来自菌株NCTC11639的酶合成癌症相关抗原的能力。经测定，α1,2-FucT在4.0至8.0的pH范围内具有活性，最适在pH 5.0时发生。尽管催化不需要二价金属离子辅助因子，但在添加Mn 2+后可检测到酶活性的增强。。详细的底物特异性分析表明，α1,2-FucT可以催化多种寡糖底物的岩藻糖基化。与包含2型结构（Galβ1-4GlcNAc）的聚糖相比，优选地，所述α1,2-FucT包含岩藻糖基化的1型结构（Galβ1-3GlcNAc）的聚糖。发现路易斯A三糖[Galβ1-3（Fucα1-4）GlcNAc]是最好的受体。唯一的例外是Lewis x五糖LNFP III [Galβ1-4（Fucα1-3）GlcNAcβ1-3Galβ1-4Glc]优于Lewis a类似物LNFP

  DOI：

  10.1002/adsc.200800435

文献信息

• Characterization of<i>Helicobacter pylori</i>α1,2-Fucosyltransferase for Enzymatic Synthesis of Tumor-Associated Antigens
  作者：Daniel B. Stein、Yu-Nong Lin、Chun-Hung Lin

  DOI：10.1002/adsc.200800435

  日期：2008.10.6

  Helicobacter pylori catalyzes the fucosylation of acceptor oligosaccharides at the C2-OH of terminal Galβ units. The enzyme from strain NCTC11639 was evaluated for its ability to synthesize cancer-associated antigens. The α1,2-FucT was determined to be active over a pH range between 4.0 and 8.0 with the optimum occurring at pH 5.0. Although a divalent metal ion cofactor was not required for catalysis, enhancement

  来自幽门螺杆菌的α1,2-岩藻糖基转移酶（α1,2-FucT）催化末端Galβ单元的C2-OH上受体寡糖的岩藻糖基化。评价了来自菌株NCTC11639的酶合成癌症相关抗原的能力。经测定，α1,2-FucT在4.0至8.0的pH范围内具有活性，最适在pH 5.0时发生。尽管催化不需要二价金属离子辅助因子，但在添加Mn 2+后可检测到酶活性的增强。。详细的底物特异性分析表明，α1,2-FucT可以催化多种寡糖底物的岩藻糖基化。与包含2型结构（Galβ1-4GlcNAc）的聚糖相比，优选地，所述α1,2-FucT包含岩藻糖基化的1型结构（Galβ1-3GlcNAc）的聚糖。发现路易斯A三糖[Galβ1-3（Fucα1-4）GlcNAc]是最好的受体。唯一的例外是Lewis x五糖LNFP III [Galβ1-4（Fucα1-3）GlcNAcβ1-3Galβ1-4Glc]优于Lewis a类似物LNFP