(Fuc(α1-3))(Gal(β1-4))GlcNAc(β1-3)Gal(β1-4)Glc

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (Fuc(α1-3))(Gal(β1-4))GlcNAc(β1-3)Gal(β1-4)Glc
• 英文别名: [Gal(β1-4)][Fuc(α1-3)]GlcNAc(β1-3)Gal(β1-4)Glc；Galβ1-4GlcNAc(Fucα1,3)β1-3Galβ1-4Glc；LNF III；D-Fuc(a1-3)[Gal(b1-4)]GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)Glc；N-[(2S,3R,4R,5S,6R)-2-[(2R,3S,4S,5R,6S)-3,5-dihydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-[(2R,3S,4R,5R)-4,5,6-trihydroxy-2-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]oxyoxan-4-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-[(2R,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxyoxan-3-yl]acetamide
• 化学式: C₃₂H₅₅NO₂₅
• 分子量: 853.78
• InChiKey: CMQZRJBJDCVIEY-IWPSQXCJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -9.6
• 重原子数：
  58
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.97
• 拓扑面积：
  416
• 氢给体数：
  16
• 氢受体数：
  25

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (Fuc(α1-3))(Gal(β1-4))GlcNAc(β1-3)Gal(β1-4)Glc 、 碘甲烷 在 sodium hydroxide 作用下， 生成
  参考文献：
  名称：

  使用顺序串联质谱对全甲基化寡糖亚基进行结构分配。

  摘要：

  在对全甲基化寡糖的系统研究中，已经探索了四极杆离子阱仪器提供的顺序串联质谱（MSn）功能。在碰撞诱导的离解下，以电喷雾电离模式产生的质子化分子物种产生简单且可预测的质谱。关于序列，分支和在某种程度上糖苷间键的信息可以从糖苷键裂解产生的片段中推导出来。已经建立了碳水化合物的结构分配的简单规则，以使质子化的物种及其亚单位的片段化，并通过18 O-标记实验得到了证实。此外，序列串联质谱法通过将未知的碳水化合物部分的CID光谱与一组参考文献的CID光谱进行比较，可以对未知的碳水化合物部分进行简单的结构表征。由于碰撞引起的解离模式不取决于先前的串联质谱步骤的数量，因此可以通过光谱匹配来明确分配结构。这些发现建立了在四极离子阱仪器上进行MSn分析的基础，该仪器用于阐明大型碳水化合物的结构，这些碳水化合物实际上可以在质谱仪中一步或几步降解为较小的实体。这项功能强大的技术已与特定的CD3标记结合使用，用于

  DOI：

  10.1021/ac980443+

文献信息

• Post-source decay mass spectrometry: optimized calibration procedure and structural characterization of permethylated oligosaccharides
  作者：Nelly Viseux、Catherine E. Costello、Bruno Domon

  DOI：10.1002/(sici)1096-9888(199904)34:4<364::aid-jms787>3.0.co;2-p

  日期：1999.4

  exclusively from cleavage of glycosidic bonds, preferentially at N-acetylhexosamine residues. A systematic study was carried out on a series of permethylated oligosaccharides to allow rationalization of the fragmentation processes. Fragments originating from both the reducing and the non-reducing ends of the oligosaccharide yield information on sequence and branching. Moreover, glycosyl residues linked in position

  使用后级衰减（PSD）模式下的反射电子飞行时间仪，通过基质辅助激光解吸/电离质谱（MALDI / MS）分析全甲基化低聚糖。在这些电离条件下，此类衍生物会产生与钠或钾阳离子化分子种类相对应的强信号。PSD光谱中观察到的片段仅由糖苷键的裂解产生，优先于N-乙酰基己糖胺残基。对一系列过甲基化的寡糖进行了系统的研究，以使裂解过程合理化。来自寡糖的还原和非还原端的片段产生有关序列和分支的信息。而且，HexNAc单元第3位连接的糖基残基引起高度特异性的消除过程，该过程可明确分配（1-3）糖苷间键。特别注意带有常见的岩藻糖基和唾液酸基端盖的寡糖的结构分析。在唾液酸化残基的情况下，开发了一种靶向方法，该方法涉及脱唾液酸化和新生的游离羟基的特异性CD3标记，以标记唾液酸残基沿寡糖骨架的初始位置。由于碎片离子的精确质量确定对于它们的分配至关重要，因此将介绍用于PSD模式下校准的简化协议。该过程允许确定处理采