(1S,3R)-N-(3,5-bis(trifluoromethyl)benzyl)-3-((2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)amino)-1-isopropylcyclopentanecarboxamide | 693247-71-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (1S,3R)-N-(3,5-bis(trifluoromethyl)benzyl)-3-((2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)amino)-1-isopropylcyclopentanecarboxamide
• 英文别名: N-(3,5-bis(trifluoromethyl)benzyl)-3-((2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)amino)-1-isopropylcyclopentane-1-carboxamide；(1S,3R)-N-(3,5-bis(trifluoromethyl)benzyl)-3-(2,3-dihydro-1H-inden-1-ylamino)-1-isopropylcyclopentanecarboxamide；(1S,3R)-N-[[3,5-bis(trifluoromethyl)phenyl]methyl]-3-(2,3-dihydro-1H-inden-1-ylamino)-1-propan-2-ylcyclopentane-1-carboxamide
• CAS: 693247-71-1
• 化学式: C₂₇H₃₀F₆N₂O
• 分子量: 512.538
• InChiKey: YYRQKVPZQIKPRY-KYPFDINASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.3
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  41.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (1S,3R)-3-((tert-butoxycarbonyl)amino)-1-isopropylcyclopentane-1-carboxylic acid 在 4-二甲氨基吡啶 、 三乙酰氧基硼氢化钠 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 、 bromo-tris(1-pyrrolidinyl)phosphonium hexafluorophosphate 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 43.0h， 生成 (1S,3R)-N-(3,5-bis(trifluoromethyl)benzyl)-3-((2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)amino)-1-isopropylcyclopentanecarboxamide
  参考文献：
  名称：

  结构动力学关系-命中优化中一个被忽略的参数：环戊胺作为趋化因子受体2拮抗剂的案例

  摘要：

  炎症性疾病（例如神经性疼痛，类风湿性关节炎和多发性硬化症）的临床前模型已指出趋化因子受体2（CCR2）和趋化因子配体2（CCL2）的关键作用。但是，CCR2高亲和力抑制剂的最大问题之一是它们在临床试验中缺乏功效。我们报告了一种新的方法来设计高亲和力和长时间驻留的CCR2拮抗剂。我们开发了一种新的CCR2竞争关联分析，使我们能够研究配体的结构与其受体停留时间的关系[即结构-动力学关系（SKR）]，而不是传统的结构-亲和关系（SAR）。 。通过运用SAR和SKR的综合知识，我们能够重新评估作为CCR2拮抗剂的环戊胺的先导过程。1具有良好的结合力（K i = 6.8 nM），但停留时间却很短（2.4分钟）。但是，当优化还基于停留时间时，先导过程会产生化合物22a，这是一种新型的高亲和力CCR2拮抗剂（3.6 nM），停留时间为135分钟。

  DOI：

  10.1021/jm4011737

文献信息

• Design, synthesis, and structure–activity relationship of novel CCR2 antagonists
  作者：Shankaran Kothandaraman、Karla L. Donnely、Gabor Butora、Richard Jiao、Alexander Pasternak、Gregori J. Morriello、Stephen D. Goble、Changyou Zhou、Sander G. Mills、Malcolm MacCoss、Pasquale P. Vicario、Julia M. Ayala、Julie A. DeMartino、Mary Struthers、Margaret A. Cascieri、Lihu Yang

  DOI：10.1016/j.bmcl.2008.12.050

  日期：2009.3

  A series of novel 1-aminocyclopentyl-3-carboxyamides incorporating substituted tetrahydropyran moieties have been synthesized and subsequently evaluated for their antagonistic activity against the human CCR2 receptor. Among them analog 59 was found to posses potent antagonistic activity. (C) 2009 Published by Elsevier Ltd.
• Structure–Kinetic Relationships—An Overlooked Parameter in Hit-to-Lead Optimization: A Case of Cyclopentylamines as Chemokine Receptor 2 Antagonists
  作者：Maris Vilums、Annelien J. M. Zweemer、Zhiyi Yu、Henk de Vries、Julia M. Hillger、Hannah Wapenaar、Ilse A. E. Bollen、Farhana Barmare、Raymond Gross、Jeremy Clemens、Paul Krenitsky、Johannes Brussee、Dean Stamos、John Saunders、Laura H. Heitman、Adriaan P. IJzerman

  DOI：10.1021/jm4011737

  日期：2013.10.10

  pointed to a critical role of the chemokine receptor 2 (CCR2) and chemokine ligand 2 (CCL2). However, one of the biggest problems of high-affinity inhibitors of CCR2 is their lack of efficacy in clinical trials. We report a new approach for the design of high-affinity and long-residence-time CCR2 antagonists. We developed a new competition association assay for CCR2, which allows us to investigate the relation

  炎症性疾病（例如神经性疼痛，类风湿性关节炎和多发性硬化症）的临床前模型已指出趋化因子受体2（CCR2）和趋化因子配体2（CCL2）的关键作用。但是，CCR2高亲和力抑制剂的最大问题之一是它们在临床试验中缺乏功效。我们报告了一种新的方法来设计高亲和力和长时间驻留的CCR2拮抗剂。我们开发了一种新的CCR2竞争关联分析，使我们能够研究配体的结构与其受体停留时间的关系[即结构-动力学关系（SKR）]，而不是传统的结构-亲和关系（SAR）。 。通过运用SAR和SKR的综合知识，我们能够重新评估作为CCR2拮抗剂的环戊胺的先导过程。1具有良好的结合力（K i = 6.8 nM），但停留时间却很短（2.4分钟）。但是，当优化还基于停留时间时，先导过程会产生化合物22a，这是一种新型的高亲和力CCR2拮抗剂（3.6 nM），停留时间为135分钟。