1-methyl-5-formyluracil | 21579-19-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-methyl-5-formyluracil
• 英文别名: 5-Pyrimidinecarboxaldehyde, 1,2,3,4-tetrahydro-1-methyl-2,4-dioxo-；1-methyl-2,4-dioxopyrimidine-5-carbaldehyde
• CAS: 21579-19-1
• 化学式: C₆H₆N₂O₃
• 分子量: 154.125
• InChiKey: DODHKMVRKWNKKX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  66.5
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-methyl-5-formyluracil 在 盐酸 、 三乙胺 、 sodium hydroxide 、 sodium nitrite 作用下， 以 氘代二甲亚砜 、 乙醇 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 19.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  D-α-(尿嘧啶-5-基)甘氨酸衍生物的对映选择性合成及其无外消旋化并入模型肽

  摘要：

  描述了使用固定化 D-乙内酰脲酶 (D-Hyd-1) 对 D,L-乙内酰脲中间体进行酶促动态动力学拆分的 D-α-(尿嘧啶-5-基) 甘氨酸衍生物的有效不对称合成。此外，还发现了使用 Fmoc 策略进行无外消旋化固相肽合成 (SPPS) 的温和条件。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201500914
• 作为产物：
  描述：

  以 水 为溶剂， 生成 1-methyl-5-formyluracil
  参考文献：
  名称：

  5-甲酰胞嘧啶水合的 pH 依赖性：实验和理论研究

  摘要：

  结合 NMR 和质谱测量以及理论研究，已对 5-甲酰胞嘧啶及其尿嘧啶衍生物的水合物含量进行了鉴定和定量。我们报告了 5 fC 和 5 fU 的水合反应的水合自由能。在 5 fC 的情况下，酸化导致水溶液中的水合物含量增加高达 0.5%。

  DOI：

  10.1002/cbic.202100651

文献信息

• Oxidation of Thymines and Uracils with Sodium Peroxodisulfate
  作者：Toshio Itahara、Reiko Ebihara、Yukiko Fujii、Miki Tada

  DOI：10.1246/cl.1986.1319

  日期：1986.8.5

  Reaction of thymines with Na2S2O8 in water resulted in selective oxidation of the methyl group at 5-position of thymines. Oxidation of thymines with Na2S2O8 in hydrochloric acid gave 5-chloro-6-hydroxy-5,6-dihydrothymines and in acetic acid containing NaCl gave 6-acetoxy-5-chloro-5,6-dihydrothymines which were converted to 6-alkoxy-5-chloro-5,6-dihydrothymines with alcohols. The reaction of uracils also gave similar products together with 5-chlorouracils.

  胸腺嘧啶与Na2S2O8在水中的反应导致了胸腺嘧啶5位甲基基团的选择性氧化。在盐酸中用Na2S2O8氧化胸腺嘧啶生成5-氯-6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶，而在含NaCl的醋酸中则生成6-乙氧基-5-氯-5,6-二氢胸腺嘧啶，这些化合物可以与醇转化为6-烷氧基-5-氯-5,6-二氢胸腺嘧啶。尿嘧啶的反应也产生了类似的产物，同时伴随着5-氯尿嘧啶的生成。
• Unprecedented reactivity of polyamines with aldehydic DNA modifications: structural determinants of reactivity, characterization and enzymatic stability of adducts
  作者：Eka Putra Gusti Ngurah Putu、Laurent Cattiaux、Thomas Lavergne、Yves Pommier、Sophie Bombard、Anton Granzhan

  DOI：10.1093/nar/gkad837

  日期：2023.11.10

  Apurinic/apyrimidinic (AP) sites, 5-formyluracil (fU) and 5-formylcytosine (fC) are abundant DNA modifications that share aldehyde-type reactivity. Here, we demonstrate that polyamines featuring at least one secondary 1,2-diamine fragment in combination with aromatic units form covalent DNA adducts upon reaction with AP sites (with concomitant cleavage of the AP strand), fU and, to a lesser extent, fC residues. Using small-molecule mimics of AP site and fU, we show that reaction of secondary 1,2-diamines with AP sites leads to the formation of unprecedented 3′-tetrahydrofuro[2,3,4-ef]-1,4-diazepane (‘ribodiazepane’) scaffold, whereas the reaction with fU produces cationic 2,3-dihydro-1,4-diazepinium adducts via uracil ring opening. The reactivity of polyamines towards AP sites versus fU and fC can be tuned by modulating their chemical structure and pH of the reaction medium, enabling up to 20-fold chemoselectivity for AP sites with respect to fU and fC. This reaction is efficient in near-physiological conditions at low-micromolar concentration of polyamines and tolerant to the presence of a large excess of unmodified DNA. Remarkably, 3′-ribodiazepane adducts are chemically stable and resistant to the action of apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 (APE1) and tyrosyl-DNA phosphoesterase 1 (TDP1), two DNA repair enzymes known to cleanse a variety of 3′ end-blocking DNA lesions.

  摘要 嘌呤/嘧啶（AP）位点、5-甲酰基尿嘧啶（fU）和 5-甲酰基胞嘧啶（fC）是具有醛类反应活性的大量 DNA 修饰物。在这里，我们证明了具有至少一个次级 1,2-二胺片段的多胺与芳香族单元结合后，在与 AP 位点（同时 AP 链断裂）、fU 以及（在较小程度上）fC 残基反应时会形成共价 DNA 加合物。利用 AP 位点和 fU 的小分子模拟物，我们发现仲1,2-二胺与 AP 位点反应会形成前所未有的 3′-四氢呋喃并[2,3,4-ef]-1,4-二氮杂环庚烷（"核二氮杂环庚烷"）支架，而与 fU 反应则会通过尿嘧啶开环产生阳离子 2,3-二氢-1,4-二氮杂环庚烷加合物。通过调节多胺的化学结构和反应介质的 pH 值，可以调整多胺对 AP 位点与 fU 和 fC 的反应活性，从而使 AP 位点对 fU 和 fC 的化学选择性高达 20 倍。在接近生理的条件下，这种反应在多胺的低微摩尔浓度下就能有效进行，并能耐受大量过量的未修饰 DNA 的存在。值得注意的是，3′-核二氮杂环庚烷加合物化学性质稳定，对嘌呤/嘧啶内切酶 1（APE1）和酪氨酰-DNA 磷酸酯酶 1（TDP1）的作用具有抗性，这两种 DNA 修复酶已知可清除各种 3′末端阻断 DNA 病变。
• ITAHARA TOSHIO; EBIHARA REIKO; FUJII YUKIKO; TADA MIKI, CHEM. LETT.,(1986) N 8, 1319-1322
  作者：ITAHARA TOSHIO、 EBIHARA REIKO、 FUJII YUKIKO、 TADA MIKI

  DOI：——

  日期：——
• ITAHARA, TOSHIO;FUJII, YUKIKO;TADA, MIKI, J. ORG. CHEM., 53,(1988) N 15, 3421-3424
  作者：ITAHARA, TOSHIO、FUJII, YUKIKO、TADA, MIKI

  DOI：——

  日期：——
• US7696210B2
  申请人：——

  公开号：US7696210B2

  公开（公告）日：2010-04-13