Cyanine 5 Monofunctional Hexanoic Acid Dye, Succinimidyl Ester, Potassium Salt

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: Cyanine 5 Monofunctional Hexanoic Acid Dye, Succinimidyl Ester, Potassium Salt
• 英文别名: potassium;2-[(2E,4E)-5-[1-[6-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfonatoindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
• 化学式: C₃₇H₄₂N₃O₁₀S₂*K
• 分子量: 791.985
• InChiKey: QQDIITGSRBDWEC-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.86
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  201
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Cyanine 5 Monofunctional Hexanoic Acid Dye, Succinimidyl Ester, Potassium Salt 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 在 三乙胺 、 三异丙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  Fluorescence Enhancement through Enzymatic Cleavage of Internally Quenched Dendritic Peptides: A Sensitive Assay for the AspN Endoproteinase

  摘要：

  DOI：

  10.1002/1521-3773(20020902)41:17<3233::aid-anie3233>3.0.co;2-e

文献信息

• High Affinity Host–Guest FRET Pair for Single-Vesicle Content-Mixing Assay: Observation of Flickering Fusion Events
  作者：Bokyoung Gong、Bong-Kyu Choi、Jae-Yeol Kim、Dinesh Shetty、Young Ho Ko、Narayanan Selvapalam、Nam Ki Lee、Kimoon Kim

  DOI：10.1021/jacs.5b05385

  日期：2015.7.22

  release/mixing. Here, we report a new, reliable, and efficient single-vesicle content-mixing assay using a high affinity, fluorophore tagged host-guest pair, cucurbit[7]uril-Cy3 and adamantane-Cy5 as a fluorescence resonance energy transfer (FRET) pair. The power of these probes is demonstrated by the first successful observation of flickering dynamics of the fusion pore by in vitro assay using neuronal

  基于荧光的单囊泡融合分析为研究 SNARE（可溶性 N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体）介导的囊泡融合和神经递质释放的复杂生物过程的机制提供了一种强大的方法。这些测定的一个关键要素是荧光探针能够可靠地检测融合孔打开和内容释放/混合的关键中间事件。在这里，我们报告了一种新的、可靠的、高效的单囊泡内容混合分析，使用高亲和力、荧光团标记的宿主-客体对、葫芦 [7] uril-Cy3 和金刚烷-Cy5 作为荧光共振能量转移 (FRET)一对。
• Squaraine Rotaxanes: Superior Substitutes for Cy-5 in Molecular Probes for Near-Infrared Fluorescence Cell Imaging
  作者：James R. Johnson、Na Fu、Easwaran Arunkumar、W. Matthew Leevy、Seth T. Gammon、David Piwnica-Worms、Bradley D. Smith

  DOI：10.1002/anie.200701491

  日期：2007.7.16