N-pent-4-ynyl-2-thienyl-pyrrole | 1233533-18-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯
• 英文名称: N-pent-4-ynyl-2-thienyl-pyrrole
• 英文别名: N-(pent-4-ynyl)-2-(2-thienyl)pyrrole；1-Pent-4-ynyl-2-thiophen-2-ylpyrrole；1-pent-4-ynyl-2-thiophen-2-ylpyrrole
• CAS: 1233533-18-0
• 化学式: C₁₃H₁₃NS
• 分子量: 215.319
• InChiKey: AXOOSNFMSKZLPR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.9
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  33.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-pent-4-ynyl-2-thienyl-pyrrole 、 3,6-bis(2-azidoacetamido)-10-methylacridin-10-ium iodide 在 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 、 三[(1-苄基-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基]胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲醇 、 水 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 0.17h， 以95%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  单击二叠氮基A啶嵌入剂的修饰：一条通向装饰性DNA纳米结构的多功能路线

  摘要：

  3,6-二氨基amino啶（原黄酮）的重氮基衍生物插入DNA中，并通过点击化学作用进行功能化，以形成具有氧化还原活性，导电纳米线和荧光特性的1D纳米结构。这种分为两步的方法，即插入和单击修饰，可实现对DNA纳米结构的受控装饰。

  DOI：

  10.1002/chem.201501836
• 作为产物：
  描述：

  2-(2-噻吩基)吡咯 、 5-氯戊炔 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 以70%的产率得到N-pent-4-ynyl-2-thienyl-pyrrole
  参考文献：
  名称：

  Pyrrolyl-, 2-(2-thienyl)pyrrolyl- and 2,5-bis(2-thienyl)pyrrolyl-nucleosides: synthesis, molecular and electronic structure, and redox behaviour of C5-thymidine derivatives

  摘要：

  通过钯催化交叉偶联，在N-烷基-炔基官能化的吡咯基（py）、2-(2-噻吩基)吡咯基（tp）或2,5-双(2-噻吩基)吡咯基（tpt）基团与5-碘-2′-脱氧尿苷之间，制备了一系列基于胸苷的修饰核苷。连接核苷和含吡咯基单元的烷基链长度（N(CH2)nCC-核苷，其中n = 1-3）也各不相同。通过1H NMR、ES-MS、UV-vis、循环伏安法（CV）以及某些情况下的单晶X射线衍射，对化合物进行了表征。循环伏安法研究表明，所有py、tp和tpt-炔基衍生物1-7都可以电化学聚合形成导电材料。研究发现，在这种情况下，增加N-烷基链长度只会导致氧化电位发生微小变化。tp和tpt修饰核苷9-12也表现出相同的行为；然而，py衍生物8产生的导电材料效果不佳。对带有tp或tpt修饰核苷的单电子氧化阳离子进行DFT计算表明，在所有情况下，自旋密度都位于吡咯基和

  DOI：

  10.1039/c0ob00466a

文献信息

• Synthesis and binding of proflavine diazides as functional intercalators for directed assembly on DNA
  作者：Shahrbanou MoradpourHafshejani、Joseph H. Hedley、Alexandra O. Haigh、Andrew R. Pike、Eimer M. Tuite

  DOI：10.1039/c3ra43090a

  日期：——

  Proflavine diazide (PD) with amido-azide substituents on the amine groups and its N-methylated analogue (MePD) bind strongly to DNA by nearest-neighbour intercalation with little sequence selectivity, presenting reactive azide groups in the major groove. PD is neutral in aqueous solution but experiences binding-coupled protonation on interaction with DNA with an apparent pKa shift of 2.5 units. MePD can be click modified in situ on DNA with alkyne-functionalised thienyl-pyrrole as a precursor for conducting polymer synthesis, and remains intercalated after reaction with the substituents aligned in the groove.

  带有氨基取代的腺嘌呤二嗪（PD）及其N-甲基化的类似物（MePD）通过最近邻插层强烈结合DNA，几乎没有序列选择性，且在主要槽中呈现出反应性叠氮基团。PD在水溶液中是中性的，但在与DNA相互作用时经历结合耦合质子化，表观pKa值偏移了2.5个单位。MePD可以在DNA上进行即时点击修饰，使用功能化的炔烃取代噻吩-吡咯作为导体聚合物合成的前驱体，并在与取代基反应后仍然保持插层状态。
• Click Modification of Diazido Acridine Intercalators: A Versatile Route towards Decorated DNA Nanostructures
  作者：Shahrbanou Moradpour Hafshejani、Scott M. D. Watson、Eimer M. Tuite、Andrew R. Pike

  DOI：10.1002/chem.201501836

  日期：2015.9.1

  Diazido derivatives of 3,6‐diamino acridine (proflavine) intercalate into DNA and undergo functionalization through click chemistry to form 1D nanostructures with redox active, conductive nanowire, and fluorescent properties. This two‐step approach, intercalation followed by click modification allows for the controlled decoration of DNA nanostructures.

  3,6-二氨基amino啶（原黄酮）的重氮基衍生物插入DNA中，并通过点击化学作用进行功能化，以形成具有氧化还原活性，导电纳米线和荧光特性的1D纳米结构。这种分为两步的方法，即插入和单击修饰，可实现对DNA纳米结构的受控装饰。
• Pyrrolyl-, 2-(2-thienyl)pyrrolyl- and 2,5-bis(2-thienyl)pyrrolyl-nucleosides: synthesis, molecular and electronic structure, and redox behaviour of C5-thymidine derivatives
  作者：Miguel A. Galindo、Jennifer Hannant、Ross W. Harrington、William Clegg、Benjamin R. Horrocks、Andrew R. Pike、Andrew Houlton

  DOI：10.1039/c0ob00466a

  日期：——

  A series of modified nucleosides based on thymidine have been prepared by Pd-catalysed cross-coupling between N-alkyl-alkynyl functionalised pyrrolyl- (py), 2-(2-thienyl)pyrrolyl- (tp) or 2,5-bis(2-thienyl)pyrrolyl (tpt) groups with 5-iodo-2′-deoxyuridine. The length of the alkyl chain linking the nucleoside and pyrrolyl-containing unit, N(CH2)nCC-nucleoside (where n = 1–3) was also varied. The compounds have been characterised by 1H NMR, ES-MS, UV–vis, cyclic voltammetry (CV) and, in some cases, single-crystal X-ray diffraction. Cyclic voltammetry studies demonstrated that all the py-, tp- and tpt-alkynyl derivatives 1–7 can be electrochemically polymerised to form conductive materials. It was found that increasing the N-alkyl chain length in these cases resulted in only minor changes in the oxidation potential. The same behaviour was observed for the tp- and tpt-modified nucleosides 9–12; however, the py-derivative, 8, produced a poorly conducting material. DFT calculations on the one-electron oxidised cation of the modified nucleosides bearing tp or tpt showed that spin density is located on the pyrrolyl and thienyl units in all cases and that the coplanarity of adjacent rings increases upon oxidation. In contrast, in the corresponding pyrrolyl cases the spin density is distributed over the whole molecule, suggesting that polymerisation does not occur solely at the pyrrolyl-Cα position and the conjugation is interrupted.

  通过钯催化交叉偶联，在N-烷基-炔基官能化的吡咯基（py）、2-(2-噻吩基)吡咯基（tp）或2,5-双(2-噻吩基)吡咯基（tpt）基团与5-碘-2′-脱氧尿苷之间，制备了一系列基于胸苷的修饰核苷。连接核苷和含吡咯基单元的烷基链长度（N(CH2)nCC-核苷，其中n = 1-3）也各不相同。通过1H NMR、ES-MS、UV-vis、循环伏安法（CV）以及某些情况下的单晶X射线衍射，对化合物进行了表征。循环伏安法研究表明，所有py、tp和tpt-炔基衍生物1-7都可以电化学聚合形成导电材料。研究发现，在这种情况下，增加N-烷基链长度只会导致氧化电位发生微小变化。tp和tpt修饰核苷9-12也表现出相同的行为；然而，py衍生物8产生的导电材料效果不佳。对带有tp或tpt修饰核苷的单电子氧化阳离子进行DFT计算表明，在所有情况下，自旋密度都位于吡咯基和