(3R)-N(1)-Z-N(2)-Fmoc-piperazic acid | 138774-95-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (3R)-N(1)-Z-N(2)-Fmoc-piperazic acid
• 英文别名: (3R)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl)-1-phenylmethoxycarbonyldiazinane-3-carboxylic acid
• CAS: 138774-95-5
• 化学式: C₂₈H₂₆N₂O₆
• 分子量: 486.524
• InChiKey: XFZYTCAEXYGMMD-RUZDIDTESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  96.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3R)-N(1)-Z-N(2)-Fmoc-piperazic acid 在 silver cyanide 、 草酰氯 、 双(2-氧代-3-恶唑烷基)次磷酰氯 、 二乙胺 、 三乙胺 、 三氟乙酸 、 苯酚 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 、 苯 为溶剂， 反应 4.88h， 生成 benzyl (3R)-2-[(2S,3S)-4-methyl-3-[2-[methyl-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]amino]acetyl]oxy-2-(2,2,2-trichloroethoxycarbonylamino)pentanoyl]-3-[[2-[methyl-[2-[[2-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]hydrazinyl]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]amino]-2-oxoethyl]-phenylmethoxycarbamoyl]diazinane-1-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  A Synthetic Strategy for the Cyclodepsipeptide Core of the Antitumor Antibiotic Verucopeptin

  摘要：

  [GRAPHICS]An efficient [2 + 2 + 2]-fragment condensation strategy is described for obtaining the cyclodepsipeptide core of verucopeptin. The 19-membered macrocycle was established through a Carpino HATU mediated macrolactamization, which proceeded in good yield under high-dilution conditions.

  DOI：

  10.1021/ol016440s
• 作为产物：
  描述：

  (3R)-hexahydropyridazine-3-carboxylic acid trifluoroacetic acid 在 三甲基氯硅烷 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 甲苯 为溶剂， 反应 33.0h， 生成 (3R)-N(1)-Z-N(2)-Fmoc-piperazic acid
  参考文献：
  名称：

  JBIR-39的全合成和结构解析：具有哌嗪酸和γ-羟基哌嗪酸残基的线性六肽

  摘要：

  据报道，JBIR-39的总合成和立体化学结构阐明了四个非蛋白生成的哌嗪酸（Piz）残基。合成过程包括Sc（OTf）3催化Piz（γ-OTBS）衍生物与哌嗪酰氯的酰化反应，以高收率提供所需的Piz-Piz（γ-OTBS）二肽，而无需差向异构化。在N端组装两个额外的Piz部分和（S）-异亮氨酸后，在C端与（R）-α-甲基丝氨酸酯酰胺化，然后脱保护得到所需的（2 R，8 S）-六肽，这是JBIR‐39的假定结构。尽管（2 R，8 S）-六肽与JBIR-39不同，进一步合成三种立体异构体证实JBIR-39的立体化学结构为（2 S，6 S，8 S，11 R，16 S，21 R，26 S，27 S）。

  DOI：

  10.1002/chem.201406020

文献信息

• Total Synthesis of Hytramycin V, an Antibiotic Cyclopeptide
  作者：Tetsuya Inaba、Yoshimasa Ishizaki、Masayuki Igarashi、Masahito Yoshida、Hideo Kigoshi

  DOI：10.1246/bcsj.20210170

  日期：2021.7.15

  The total synthesis of the piperazic acid-containing antibiotic cyclic peptide, hytramycin V, has been achieved. Unexpected cleavage of the peptide bond was observed during the synthesis of a pentapeptide, then we successfully found that the addition of 2,6-di-tert-butylpyridine (2,6-DTBP) was effective to prevent the cleavage upon acylation with an acyl chloride, leading to a pentapeptide in excellent

  已实现含哌嗪酸抗生素环肽hytramycin V的全合成。在五肽的合成过程中观察到肽键的意外断裂，然后我们成功地发现添加 2,6-二叔丁基吡啶 (2,6-DTBP) 可有效防止在用酰基酰化时发生断裂氯化物，以极好的收率产生五肽。六肽的合成，随后保护基团的整体脱保护提供了环化前体。最后，使用 T3P ®对前体进行大环内酰胺化在高稀释条件下提供了所需的天然产物 hytramycin V。 也实现了 hytramycin V 的对映异构体的合成，并且在评估它们对分枝杆菌菌株的抗菌活性时没有观察到对映异构体之间的差异，导致事实是该活性的效力不依赖于环肽骨架的手性。
• Synthetic studies on the azinothricin family of antibiotics. 3. Enantioselective synthesis of a hexapeptide precursor for antitumour antibiotic A83586C
  作者：Karl J. Hale、Vern M. Delisser、Li-Kuan Yeh、S.Andrew Peak、Soraya Manaviazar、Gurpreet S. Bhatia

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)78375-4

  日期：1994.10

  A “3+2+1” fragment condensation strategy to a precursor of the hexapeptide found in antibiotic A83586C is described.

  描述了对在抗生素A83586C中发现的六肽前体的“ 3 + 2 + 1”片段缩合策略。
• Synthesis of Piperazic Acid‐Containing Cyclodepsipeptide Core of Verucopeptin
  作者：Yuanjun Sun、Wenhao Tang、Mei Wang、Huxin Ni、Ya‐Qiu Long

  DOI：10.1002/cjoc.202300106

  日期：2023.9

  the easily-accessible N1,N2-diCbz-piperazic acid is used as the synthetic module. We employ this selective-deprotection strategy to achieve an efficient synthesis of piperazic acid-containing cyclodepsipeptide core of verucopeptin with an overall yield of 21% from commercially/readily available building blocks. The key steps include late stage coupling of piperazic acid with 3-hydroxyleucine derivatives

  从化学角度来看，哌嗪酸的 N1 氮比 N2 氮更具亲核性，但主要在 N2 氮上形成的酰胺键在含哌嗪酸的天然产物中普遍存在，只有桑非菌素例外。因此，常采用两个正交的氮保护基来实现N2氮的选择性偶联，导致合成步骤增加，合成效率低。然而，我们开发了从含N1,N2-diCbz-哌嗪酸的肽中选择性脱保护N2-Cbz以专门形成N2酰胺，避免了当容易获得的N1,N2-diCbz时通常采用的繁琐的正交保护策略。 -哌嗪酸用作合成模块。我们采用这种选择性去保护策略，实现了含有哌嗪酸的维鲁肽核心的环缩酚肽核心的有效合成，从商业/现成的构建模块中总产率为 21%。关键步骤包括哌嗪酸与 3-羟基亮氨酸衍生物的后期偶联，以及 HATU 介导的 19 元大环 N9 和 C10 的大环内酰胺化。后期从N1,N2-diCbz-哌嗪酸中选择性脱保护N2-Cbz将极大地促进具有生物学意义的含哌嗪酸环缩肽的全合成。以及 HATU
• Total Synthesis of Incarnatapeptins A and B
  作者：Feipeng Han、Jie Li、Shupeng Li、Zhuo Wang、Yian Guo、Tao Ye

  DOI：10.1002/anie.202317636

  日期：2024.2.26

  Harnessing the photoredox-mediated decarboxylative 1,4-addition reaction and the unusual use of silver carbonate to promote N-acylation, the first total synthesis of incarnatapeptins A and B has been achieved, which unambiguously confirmed the structure of these natural products.

  利用光氧化还原介导的脱羧1,4-加成反应和不寻常地使用碳酸银促进N-酰化，首次实现了incarnatapeptins A和B的全合成，明确证实了这些天然产物的结构。
• Total Synthesis of (+)-Azinothricin and (+)-Kettapeptin
  作者：Karl J. Hale、Soraya Manaviazar、Jonathan H. George、Marcus A. Walters、Stephen M. Dalby

  DOI：10.1021/ol802817t

  日期：2009.2.5

  Asymmetric total syntheses of (+)-azinothricin and (+)-kettapeptin have been completed through a common new pathway that exploits a highly chemoselective coupling reaction between the fully elaborated cyclodepsipeptide 5 and the glycal activated esters 3 and 4 at the final stages of both respective syntheses.