methyl 5-propyl-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carboxylate | 197315-78-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: methyl 5-propyl-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carboxylate
• 英文别名: methyl 2,4-dioxo-5-propyl-1H-pyrimidine-6-carboxylate
• CAS: 197315-78-9
• 化学式: C₉H₁₂N₂O₄
• 分子量: 212.205
• InChiKey: BFTGNIZOHQCJQF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  84.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 5-propyl-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carboxylate 在 氢氧化钾 、 tetraphosphorus decasulfide 、 溶剂黄146 、 锌 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 trans-2-oxo-5-propyl-6-thioxo-1,2,3,6-hexahydropyridmidine-4-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  5-烷基-2-氧代-6-硫代氧代基1,2,3,6-六氢嘧啶-4-羧酸的合成与交换反应

  摘要：

  提出了一种改进的2-氧代-6-硫代氧代-1,2,3,6-六氢嘧啶-4-羧酸3的制备方法，它是一种有效的二氢乳清酶抑制剂。通过用Lawesson试剂对5-烷基二氢乳清酸的对甲氧基苄基酯进行亚硫酰化，然后进行脱保护，合成了反式-5-烷基-2-氧代-6-硫代六氢嘧啶-4-羧酸12a-c。相应的顺式异构体是通过在乙酸中用锌还原5-烷基-6-硫代邻苯二酸而制备的。通过紫外和1 H nmr光谱研究了12a-c在生理条件下的稳定性和交换反应。尝试合成16，还给出了3的稠合环戊基衍生物。

  DOI：

  10.1002/jhet.5570340444
• 作为产物：
  描述：

  5-iodo methyl orotate 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 氢气 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 methyl 5-propyl-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidine-4-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  基于结构的药物设计的开放式诱导方法。

  摘要：

  许多药物靶标的开放形式 (OF) 结构是通过分析与抑制剂的共晶后验获得的。因此，先验地获得药物靶标的OF结构将加速有效抑制剂的开发。除了其小活性位点外，克氏锥虫二氢乳清酸脱氢酶 (TcDHODH) 在其单体形式下功能齐全，这使得针对活性位点和蛋白质-蛋白质相互作用的药物设计方法变得不切实际。因此，开发了一种新的先验方法来确定 OF 中的 TcDHODH 活性位点。这种方法包括生成一个“OF 诱导剂”（在计算机中预测）来结合目标并导致空间排斥与靠近活性位点的柔性区域迫使它打开。我们通过预测和结晶 TcDHODH 与 OF 诱导剂的复合物，提供了该方法的第一个概念验证，从而先验地获得 OF，随后将其用于设计强效和选择性抑制剂。本文介绍了 TcDHODH 与设计的抑制剂的十四个共晶结构。这种方法有可能鼓励针对分子靶点是具有小 AS 体积的困难蛋白质的疾病进行药物设计。这种方法可以扩展到研究一般的

  DOI：

  10.1371/journal.pone.0167078

文献信息

• Synthesis and exchange reactions of 5-alkyl-2-oxo-6-thioxo-1,2,3,6-hexahydropyrimidine-4-carboxylic acids
  作者：Craig A. Batty、Michael K. Manthey、Julie Kirk、Monika Manthey、Richard I. Christopherson、Trevor Hambley

  DOI：10.1002/jhet.5570340444

  日期：1997.7

  5-alkyldihydroorotic acids with Lawesson's reagent followed by subsequent de-protection. The corresponding cisisomers were prepared by reduction of 5-alkyl-6-thioxoorotic acids with zinc in acetic acid. The stability and exchange reactions of 12a-c under physiological conditions were investigated by ultra-violet and 1H nmr spectroscopy. The attempted synthesis of 16, a fused cyclopentyl derivative of 3

  提出了一种改进的2-氧代-6-硫代氧代-1,2,3,6-六氢嘧啶-4-羧酸3的制备方法，它是一种有效的二氢乳清酶抑制剂。通过用Lawesson试剂对5-烷基二氢乳清酸的对甲氧基苄基酯进行亚硫酰化，然后进行脱保护，合成了反式-5-烷基-2-氧代-6-硫代六氢嘧啶-4-羧酸12a-c。相应的顺式异构体是通过在乙酸中用锌还原5-烷基-6-硫代邻苯二酸而制备的。通过紫外和1 H nmr光谱研究了12a-c在生理条件下的稳定性和交换反应。尝试合成16，还给出了3的稠合环戊基衍生物。
• The Open Form Inducer Approach for Structure-Based Drug Design
  作者：Daniel Ken Inaoka、Maiko Iida、Toshiyuki Tabuchi、Teruki Honma、Nayoung Lee、Satoshi Hashimoto、Shigeru Matsuoka、Takefumi Kuranaga、Kazuhito Sato、Tomoo Shiba、Kimitoshi Sakamoto、Emmanuel Oluwadare Balogun、Shigeo Suzuki、Takeshi Nara、Josmar Rodrigues da Rocha、Carlos Alberto Montanari、Akiko Tanaka、Masayuki Inoue、Kiyoshi Kita、Shigeharu Harada

  DOI：10.1371/journal.pone.0167078

  日期：——

  in complex with an OF inducer, thereby obtaining the OF a priori with its subsequent use in designing potent and selective inhibitors. Fourteen co-crystal structures of TcDHODH with the designed inhibitors are presented herein. This approach has potential to encourage drug design against diseases where the molecular targets are such difficult proteins possessing small AS volume. This approach can be

  许多药物靶标的开放形式 (OF) 结构是通过分析与抑制剂的共晶后验获得的。因此，先验地获得药物靶标的OF结构将加速有效抑制剂的开发。除了其小活性位点外，克氏锥虫二氢乳清酸脱氢酶 (TcDHODH) 在其单体形式下功能齐全，这使得针对活性位点和蛋白质-蛋白质相互作用的药物设计方法变得不切实际。因此，开发了一种新的先验方法来确定 OF 中的 TcDHODH 活性位点。这种方法包括生成一个“OF 诱导剂”（在计算机中预测）来结合目标并导致空间排斥与靠近活性位点的柔性区域迫使它打开。我们通过预测和结晶 TcDHODH 与 OF 诱导剂的复合物，提供了该方法的第一个概念验证，从而先验地获得 OF，随后将其用于设计强效和选择性抑制剂。本文介绍了 TcDHODH 与设计的抑制剂的十四个共晶结构。这种方法有可能鼓励针对分子靶点是具有小 AS 体积的困难蛋白质的疾病进行药物设计。这种方法可以扩展到研究一般的