Towards a Mechanistic Understanding of Factors Controlling the Stereoselectivity of Transketolase
作者:Anna Baierl、Axel Theorell、Ursula Mackfeld、Philipp Marquardt、Friederike Hoffmann、Stephanie Moers、Katharina Nöh、Patrick C. F. Buchholz、Jürgen Pleiss、Martina Pohl
DOI:10.1002/cctc.201800299
日期:2018.6.21
relevant amino acids of TKs from different species, a standard numbering scheme was developed. Using this concept, H26, H261, and F434 were identified as the key residues which mediate stereoselectivity, where two main factors influenced the arrangement of ThDP‐bound donor and acceptor prior to carboligation: the relative orientation of the substrate side chains and the orientation of the acceptor carbonyl
建立了硫胺二磷酸(ThDP)依赖性转酮酶(TK)的结构模型,以分析氨基酸交换对这种重要合成酶的立体选择性的影响。在这项研究中,研究了3-羟基丙酮酸作为供体和丙醛以及戊醛的碳结。基于文献数据和使用大肠杆菌的其他诱变研究TK是一种四态模型,旨在通过在形成CC键之前在活性位点中供体和受体底物的相对取向来解释TK的立体选择性。为了能够对不同物种的TK的相关氨基酸进行功能比较,开发了一种标准的编号方案。使用这个概念,H26,H261和F434被确定为介导立体选择性的关键残基,其中两个主要因素影响碳键化之前ThDP结合的供体和受体的排列:底物侧链的相对方向和受体羰基朝向供体羟基。该模型提供了第一个框架,用于了解传统知识与立体选择性之间的结构-功能关系。