摘要:
我们称之为“Pocket-to-Lead”策略的一种新的先导识别策略被证明使用 HIV-1 蛋白酶作为模型目标。有时,由于难以满足复杂的药效团特征,因此难以获得命中化合物。在这项研究中,一个虚拟片段命中与所有药效团特征不匹配,但具有关键的相互作用和可以成长为剩余药效团特征的载体,在 silico中进行了优化。设计的化合物9表现出微弱但明显的抑制活性(IC 50 = 54 μM),设计理念得到了共晶结构的证明。然后,基于结构的药物设计迅速得到化合物14 (IC 50= 0.0071 μM,EC 50 = 0.86 μM),活性比9提高了近 10,000 倍。设计分子的结构被证明是新颖的,具有很高的合成可行性,表明该策略可用于处理具有复杂药效团的棘手目标。