(1S,3R,4S)-3-Hydroxymethyl-1-(uracil-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane | 307306-34-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: (1S,3R,4S)-3-Hydroxymethyl-1-(uracil-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
• 英文别名: 1-[(1S,3R,4S)-3-(hydroxymethyl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 307306-34-9
• 化学式: C₁₀H₁₂N₂O₅
• 分子量: 240.216
• InChiKey: VGZQCDCRVMKSNZ-PJKMHFRUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1S,3R,4S)-3-Hydroxymethyl-1-(uracil-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane 以80%的产率得到(1S,3R,4S)-1-(Cytosin-1-yl)-3-hydroxymethyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and anti-HIV-1 activity of novel bicyclic nucleoside analogues restricted to an S-type conformation

  摘要：

  (1S,3R,4S)-3-羟甲基-1-(尿嘧啶-1-基)-2,5-二氧杂环[2.2.1]庚烷 9 和相应的胞嘧啶衍生物 10 是具有新型双环核苷结构 3 的核苷类似物，由已知的 1-(3′-脱氧-β-D-二十呋喃糖基)尿嘧啶 4 通过几个步骤合成。NOE 实验验证了双环核苷仅限于预期的 S 型呋喃糖构象，而核碱基则处于反构象。事实证明，这两种核苷在 MT-4 细胞中都没有抗 HIV 活性，这进一步证实了一个假设，即核苷类似物中呋喃糖环的构象灵活性是获得细胞内 5′-三磷酸化和抑制 HIV-1 逆转录酶的必要条件。

  DOI：

  10.1039/b004774k
• 作为产物：
  描述：

  1-[3'-Deoxy-6'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-1'-O-(p-tolylsulfonyl)-β-D-psicofuranosyl]uracil 在 sodium hydride 、 溶剂黄146 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 72.67h， 生成 (1S,3R,4S)-3-Hydroxymethyl-1-(uracil-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and anti-HIV-1 activity of novel bicyclic nucleoside analogues restricted to an S-type conformation

  摘要：

  (1S,3R,4S)-3-羟甲基-1-(尿嘧啶-1-基)-2,5-二氧杂环[2.2.1]庚烷 9 和相应的胞嘧啶衍生物 10 是具有新型双环核苷结构 3 的核苷类似物，由已知的 1-(3′-脱氧-β-D-二十呋喃糖基)尿嘧啶 4 通过几个步骤合成。NOE 实验验证了双环核苷仅限于预期的 S 型呋喃糖构象，而核碱基则处于反构象。事实证明，这两种核苷在 MT-4 细胞中都没有抗 HIV 活性，这进一步证实了一个假设，即核苷类似物中呋喃糖环的构象灵活性是获得细胞内 5′-三磷酸化和抑制 HIV-1 逆转录酶的必要条件。

  DOI：

  10.1039/b004774k

文献信息

• Synthesis and anti-HIV-1 activity of novel bicyclic nucleoside analogues restricted to an S-type conformation
  作者：Lisbet Kvrnø、Claus Nielsen、Richard H. Wightman

  DOI：10.1039/b004774k

  日期：——

  (1S,3R,4S)-3-Hydroxymethyl-1-(uracil-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane 9 and the corresponding cytosine derivative 10, nucleoside analogues with a novel bicyclic nucleoside structure 3, were synthesized in a few steps from the known 1-(3′-deoxy-β-D-psicofuranosyl)uracil 4. NOE experiments verified the bicyclic nucleosides to be restricted to the expected S-type furanose conformation while the nucleobase is in an anti-conformation. Both nucleosides proved to be devoid of anti-HIV activity in MT-4 cells, which further supports the hypothesis that conformational flexibility of the furanose ring in a nucleoside analogue is necessary to obtain both intracellular 5′-triphosphorylation and inhibition of HIV-1 reverse transcriptase.

  (1S,3R,4S)-3-羟甲基-1-(尿嘧啶-1-基)-2,5-二氧杂环[2.2.1]庚烷 9 和相应的胞嘧啶衍生物 10 是具有新型双环核苷结构 3 的核苷类似物，由已知的 1-(3′-脱氧-β-D-二十呋喃糖基)尿嘧啶 4 通过几个步骤合成。NOE 实验验证了双环核苷仅限于预期的 S 型呋喃糖构象，而核碱基则处于反构象。事实证明，这两种核苷在 MT-4 细胞中都没有抗 HIV 活性，这进一步证实了一个假设，即核苷类似物中呋喃糖环的构象灵活性是获得细胞内 5′-三磷酸化和抑制 HIV-1 逆转录酶的必要条件。

表征谱图