作者:Prestwood, Peri R.、Yang, Mo、Lewis, Grace V.、Balaratnam, Sumirtha、Yazdani, Kamyar、Schneekloth, John S.
DOI:10.1021/acsmedchemlett.3c00574
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RNAs are increasingly considered valuable therapeutic targets, and the development of methods to identify and validate both RNA targets and ligands is more important than ever. Here, we utilized a bioinformatic approach to identify a hairpin-containing RNA G-quadruplex (rG4) in the 5′ untranslated region (5′ UTR) of DHX15 mRNA. By using a novel competitive small molecule microarray (SMM) approach,
RNA 越来越被认为是有价值的治疗靶点,开发识别和验证 RNA 靶点和配体的方法比以往任何时候都更加重要。在这里,我们利用生物信息学方法鉴定了DHX15 mRNA 5' 非翻译区 (5' UTR) 中包含发夹的 RNA G 四链体 (rG4)。通过使用新型竞争性小分子微阵列 (SMM) 方法,我们鉴定了一种与DHX15 rG4 特异性结合的化合物 ( K D = 12.6 ± 1.0 μM)。该 rG4 直接影响DHX15报告基因 mRNA 的体外翻译,并且我们的化合物 ( F1 ) 与该结构的结合可抑制翻译高达 57%(IC 50 = 22.9 ± 3.8 μM)。这种方法使我们能够在没有已知抑制剂的情况下识别和靶向癌症相关解旋酶的 mRNA。我们的靶点识别方法和新颖的筛选方法使我们的工作为未来开发针对 RNA 靶点的新型小分子癌症疗法提供了信息。