((1S,2S,4R)-1-Benzyl-2-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxy)-4-{[(1H-indol-2-yl)-phenyl-methyl]-carbamoyl}-5-phenyl-pentyl)-carbamic acid tert-butyl ester | 1027975-83-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: ((1S,2S,4R)-1-Benzyl-2-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxy)-4-{[(1H-indol-2-yl)-phenyl-methyl]-carbamoyl}-5-phenyl-pentyl)-carbamic acid tert-butyl ester
• 英文别名: tert-butyl N-[(2S,3S,5R)-5-benzyl-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-6-[[1H-indol-2-yl(phenyl)methyl]amino]-6-oxo-1-phenylhexan-2-yl]carbamate
• CAS: 1027975-83-2
• 化学式: C₄₅H₅₇N₃O₄Si
• 分子量: 732.051
• InChiKey: ICNCFCVMCCPXEH-QYFPGZMNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.15
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  92.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ((1S,2S,4R)-1-Benzyl-2-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxy)-4-{[(1H-indol-2-yl)-phenyl-methyl]-carbamoyl}-5-phenyl-pentyl)-carbamic acid tert-butyl ester 在 四丁基氟化铵 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 22.0h， 生成 (2R,4S,5S)-5-amino-2-benzyl-4-hydroxy-N-[1H-indol-2-yl(phenyl)methyl]-6-phenylhexanamide
  参考文献：
  名称：

  HIV蛋白酶的新型C末端抑制剂的基于晶体结构的设计和合成。

  摘要：

  描述了基于X射线晶体结构的设计，合成，计算评估和新型HIV蛋白酶抑制剂的活性。通过将已知羟基乙烯抑制剂的C端Val-Val-OCH3的取代基建模到已报道的与MVT-101结合的HIV蛋白酶晶体结构的活性位点中，来设计初始铅化合物2和3。发现铅化合物2是适度的抑制剂，Ki ＝1.67μM。解决了与HIV蛋白酶复合的化合物2的X射线晶体结构，并将其用于后续设计。发现前导化合物3是更有效的抑制剂，Ki = 0.2 microM，并且其与HIV蛋白酶复合的结构也被解析并用于后续设计。吲哚3的C-末端和N-末端的修饰均导致Ki ＝ 30nM的化合物。以HIV蛋白酶为起点的化合物2和3的晶体结构，将热力学循环扰动分子动力学方法应用于一组选定的化合物，以便在一系列密切相关的化合物中测试此类计算的准确性。

  DOI：

  10.1021/jm00041a005
• 作为产物：
  描述：

  5(S)-(Boc-amino)-4(S)-hydroxy-6-phenyl-2(R)-phenylmethylhexanoic acid 在 咪唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 30.0h， 生成 ((1S,2S,4R)-1-Benzyl-2-(tert-butyl-dimethyl-silanyloxy)-4-{[(1H-indol-2-yl)-phenyl-methyl]-carbamoyl}-5-phenyl-pentyl)-carbamic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  HIV蛋白酶的新型C末端抑制剂的基于晶体结构的设计和合成。

  摘要：

  描述了基于X射线晶体结构的设计，合成，计算评估和新型HIV蛋白酶抑制剂的活性。通过将已知羟基乙烯抑制剂的C端Val-Val-OCH3的取代基建模到已报道的与MVT-101结合的HIV蛋白酶晶体结构的活性位点中，来设计初始铅化合物2和3。发现铅化合物2是适度的抑制剂，Ki ＝1.67μM。解决了与HIV蛋白酶复合的化合物2的X射线晶体结构，并将其用于后续设计。发现前导化合物3是更有效的抑制剂，Ki = 0.2 microM，并且其与HIV蛋白酶复合的结构也被解析并用于后续设计。吲哚3的C-末端和N-末端的修饰均导致Ki ＝ 30nM的化合物。以HIV蛋白酶为起点的化合物2和3的晶体结构，将热力学循环扰动分子动力学方法应用于一组选定的化合物，以便在一系列密切相关的化合物中测试此类计算的准确性。

  DOI：

  10.1021/jm00041a005