(2R)-N-[3-(2-acetylsulfanylethylimino)-3-oxidopropyl]-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonatooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanimidate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: (2R)-N-[3-(2-acetylsulfanylethylimino)-3-oxidopropyl]-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonatooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanimidate
• 化学式: C23H34N7O17P3S-4
• 分子量: 805.5
• InChiKey: ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-J

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.9
• 重原子数：
  51
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  400
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  22

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R)-N-[3-(2-acetylsulfanylethylimino)-3-oxidopropyl]-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonatooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanimidate 生成 acetoacetyl-CoA(4-) 、 coenzyme A
  参考文献：
  名称：

  人类线粒体乙酰乙酰辅酶A硫解酶的晶体学和动力学研究：钾和氯离子对其结构和功能的重要性。

  摘要：

  硫醇酶是依赖于CoA的酶，可在Claisen缩合步骤中催化碳-碳键的形成及其通过硫解降解机理的逆反应。线粒体乙酰乙酰辅酶A（CoA）硫解酶（T2）在合成和降解酮体以及降解2-甲基乙酰乙酰辅酶A的途径中很重要。已在60多名患者中发现了人类T2缺乏症。T2的独特性质是它被钾离子激活。据报道，载脂蛋白形式和CoA络合物具有和不具有结合的钾离子，都具有高分辨率的人类T2晶体结构。钾离子结合在CoA结合位点和催化位点附近。钾离子在此低亲和力结合位点的结合导致CoA结合环和活性位点环的刚性化。出乎意料的是，还已经确定了氯离子的高亲和力结合位点。氯离子被共纯化，其结合位点位于二个催化环附近的二聚体界面。T2的独特属性是它可以使用2-甲基支链的乙酰乙酰基-CoA作为底物，而其他结构特征化的硫磺酶则不能利用2-甲基化的化合物。动力学测量表明，T 2可以以相似的催化效率降解乙酰乙酰辅酶A和2-甲基乙酰乙酰辅酶A。对于两种底物，当钾离子浓度从0

  DOI：

  10.1021/bi6026192
• 作为产物：
  描述：

  3-(4-hydroxyphenyl)-3-hydroxy-propionyl-CoA 生成 对羟基苯甲醛 、 (2R)-N-[3-(2-acetylsulfanylethylimino)-3-oxidopropyl]-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonatooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanimidate
  参考文献：
  名称：

  Biochemical and Genetic Analyses of Ferulic Acid Catabolism in Pseudomonas sp. Strain HR199

  摘要：

  摘要 基因位点 fcs 编码阿魏酰辅酶 A（阿魏酰-CoA）合成酶、 ech 编码烯酰辅酶 A（阿魏酰辅酶 A）合成酶，ech aat 编码β-酮硫醇酶，它们参与阿魏酸和丁香酚在假单胞菌中的分解代谢。 假单胞菌 菌株 HR199（DSM7063）中参与阿魏酸和丁香酚分解代谢的 DNA 区域上。 Eco RI 片段（E230 和 E94）所覆盖的 DNA 区域上。 假单胞菌 菌株 HR199 基因组文库中克隆的宇宙片段 pVK100。测定了 E230 和 E94 片段的部分核苷酸序列，揭示了上述基因的排列。为了证实结构基因 fcs 和 ech 克隆并在 大肠杆菌 .含有这两个基因的重组菌株能够将阿魏酸转化为香兰素。阿魏酰-CoA 合成酶和烯酰-CoA 水合酶/醛酸酶的活性与 fcs 和 ech 基因产物的阿魏酰-CoA 合成酶和烯酰-CoA 水合酶/醛酸酶活性分别通过光度测定和高压液相色谱分析得到了证实。为了证明 fcs , ech 和 aat 基因在阿魏酸和丁香酚分解代谢中的作用 假单胞菌 菌株 HR199 中分解阿魏酸和丁香酚的 ech 和 aat 基因。相应的突变体 假单胞菌 菌株 HR fcs ΩGm和 假单胞菌 菌株 HR ech ΩKm不能在阿魏酸或丁香酚上生长，而突变体 假单胞菌 菌株 HR aat ΩKm 与野生型一样表现出阿魏酸和丁香酚阳性表型。总之，证实了丁香酚通过阿魏酸降解的途径以及阿魏酸活化为相应 CoA 酯的必要性。该 aat 基因产物没有参与这种分解，因此排除了阿魏酸的β-氧化类似降解途径。此外，阿魏酸的 ech 基因产物作为烯酰-CoA 水合酶/醛醇酶的功能表明，阿魏酸在假单胞菌中的降解途径是 假单胞菌 菌株 HR199 中阿魏酸的降解途径与最近描述的 荧光假单胞菌 AN103.

  DOI：

  10.1128/aem.65.11.4837-4847.1999

文献信息

• Analysis of the cercosporin polyketide synthase CTB1 reveals a new fungal thioesterase function
  作者：Adam G. Newman、Anna L. Vagstad、Katherine Belecki、Jonathan R. Scheerer、Craig A. Townsend

  DOI：10.1039/c2cc36010a

  日期：——

  The polyketide synthase CTB1 is demonstrated to catalyze pyrone formation thereby expanding the known biosynthetic repertoire of thioesterase domains in iterative, non-reducing polyketide synthases.

  多酮合成酶 CTB1 可催化吡喃酮的形成，从而扩大了迭代非还原多酮合成酶硫酯酶结构域的已知生物合成范围。
• Enantioselective Phenol Coupling by Laccases in the Biosynthesis of Fungal Dimeric Naphthopyrones
  作者：Sebastian Obermaier、Wiebke Thiele、Leon Fürtges、Michael Müller

  DOI：10.1002/anie.201903759

  日期：2019.7

  that are often formed by dimerization through oxidative phenol coupling. Hindered rotation around the biaryl bond can cause axial chirality. In nature, dimerizations are catalyzed by oxidative enzymes such as laccases. This class of enzymes is known for non‐specific oxidase reactions while inherent enantioselectivity is hitherto unknown. Here, we describe four related fungal laccases that catalyze γ‐naphthopyrone

  联芳基化合物是普遍存在的代谢产物，通常是通过氧化苯酚偶合通过二聚作用形成的。绕联芳基键的旋转受阻会引起轴向手性。在自然界中，二聚作用是由诸如漆酶的氧化酶催化的。这类酶因非特异性氧化酶反应而闻名，而固有的对映选择性迄今仍是未知的。在这里，我们描述了四个相关的真菌漆酶，它们以区域和阻转选择性的方式催化γ-萘并吡喃二聚体。体外测定表明，三种酶具有很高的P选择性（ee > 95％），而一种酶则显示出显着的柔韧性。对M-或P的选择性预配置的二聚体根据反应条件而有所不同。例如，较低的酶浓度主要产生（P）-类芥子碱A，而 较高浓度的M阻转异构体受到青睐。这些结果证明了以前被认为仅包含非选择性氧化酶的一类酶的固有对映选择性。
• Thioesterase-Like Role for Fungal PKS-NRPS Hybrid Reductive Domains
  作者：James W. Sims、Eric W. Schmidt

  DOI：10.1021/ja803078z

  日期：2008.8.1

  release reduced pyrrolidine-2-one intermediates en route to the tetramic acids. To determine the enzymatic basis of pyrrolidine-2-one diversity, we overexpressed equisetin synthetase (EqiS) R domains and analyzed their reactivity with synthetic substrate analogs. We show that the EqiS R domain does not perform a reducing function and does not bind reducing cofactors. Instead, the EqiS R catalyzes a Dieckmann

  尽管它们由非常相似的酶合成，但真菌还原的聚酮化合物具有探索广泛的化学空间区域的不同结构。许多真菌聚酮化合物被多种氨基酸衍生的五元环、特特拉姆酸和相关的 2-吡咯烷酮封端。真菌中已知的特特拉姆酸合成酶包含 C 端还原 (R) 结构域，建议在生成特特拉姆酸的途中释放还原的 pyrrolidine-2-one 中间体。为了确定 pyrrolidine-2-one 多样性的酶学基础，我们过表达木贼素合成酶 (EqiS) R 结构域并分析它们与合成底物类似物的反应性。我们表明 EqiSR 域不执行还原功能并且不结合还原辅因子。相反，EqiS R 催化迪克曼缩合，估计 kcat 大约为 15 s(-1)。这种作用不同于通常由短链脱氢酶/还原酶超家族酶催化的氧化还原反应。
• Chemo-enzymatic synthesis of equisetin
  作者：Xiaojun Li、Qingfei Zheng、Jun Yin、Wen Liu、Shuanhu Gao

  DOI：10.1039/c7cc01929g

  日期：——

  We here report that the biosynthesis of equisetin, a fungal tetramate natural product with potent anti-infectious activity, relies on Fsa2, a Diels-Alderase that constructs the trans-decalin system of the molecule...

  我们在这里报告称，具有强大的抗感染活性的真菌四甲酸酯天然产物Equisetin的生物合成依赖于Fsa2（一种构成分子的反式decalin系统的Diels-Alderase）。
• Molecular identification of aspartate N-acetyltransferase and its mutation in hypoacetylaspartia
  作者：Elsa Wiame、Donatienne Tyteca、Nathalie Pierrot、François Collard、Mustapha Amyere、Gaëtane Noel、Jonathan Desmedt、Marie-Cécile Nassogne、Miikka Vikkula、Jean-Noël Octave、Marie-Françoise Vincent、Pierre J. Courtoy、Eugen Boltshauser、Emile van Schaftingen

  DOI：10.1042/bj20091024

  日期：2010.1.1

  The brain-specific compound NAA (N-acetylaspartate) occurs almost exclusively in neurons, where its concentration reaches approx. 20 mM. Its abundance is determined in patients by MRS (magnetic resonance spectroscopy) to assess neuronal density and health. The molecular identity of the NAT (N-acetyltransferase) that catalyses NAA synthesis has remained unknown, because the enzyme is membrane-bound and difficult to purify. Database searches indicated that among putative NATs (i.e. proteins homologous with known NATs, but with uncharacterized catalytic activity) encoded by the human and mouse genomes two were almost exclusively expressed in brain, NAT8L and NAT14. Transfection studies in HEK-293T [human embryonic kidney-293 cells expressing the large T-antigen of SV40 (simian virus 40)] indicated that NAT8L, but not NAT14, catalysed the synthesis of NAA from L-aspartate and acetyl-CoA. The specificity of NAT8L, its Km for aspartate and its sensitivity to detergents are similar to those described for brain Asp-NAT. Confocal microscopy analysis of CHO (Chinese-hamster ovary) cells and neurons expressing recombinant NAT8L indicates that it is associated with the ER (endoplasmic reticulum), but not with mitochondria. A mutation search in the NAT8L gene of the only patient known to be deficient in NAA disclosed the presence of a homozygous 19 bp deletion, resulting in a change in reading frame and the absence of production of a functional protein. We conclude that NAT8L, a neuron-specific protein, is responsible for NAA synthesis and is mutated in primary NAA deficiency (hypoacetylaspartia). The molecular identification of this enzyme will lead to new perspectives in the clarification of the function of this most abundant amino acid derivative in neurons and for the diagnosis of hypoacetylaspartia in other patients.

  大脑特异性化合物 NAA（N-乙酰天冬氨酸）几乎只存在于神经元中，其浓度约为 20 mM。通过 MRS（磁共振波谱）测定患者体内 NAA 的含量，以评估神经元的密度和健康状况。催化 NAA 合成的 NAT（N-乙酰转移酶）的分子特性一直不为人知，因为这种酶是膜结合的，难以纯化。数据库搜索表明，在人类和小鼠基因组编码的推定 NAT（即与已知 NAT 同源但催化活性未定性的蛋白质）中，有两种几乎只在大脑中表达，即 NAT8L 和 NAT14。在 HEK-293T [表达 SV40（猿猴病毒 40）大 T 抗原的人类胚胎肾脏-293 细胞]中进行的转染研究表明，NAT8L 可催化 L-天门冬氨酸和乙酰-CoA合成 NAA，而 NAT14 则不行。NAT8L 的特异性、对天冬氨酸的 Km 值及其对去垢剂的敏感性与脑 Asp-NAT 的描述相似。对表达重组 NAT8L 的 CHO（中国仓鼠卵巢）细胞和神经元进行的共聚焦显微镜分析表明，NAT8L 与 ER（内质网）相关，但与线粒体无关。对已知唯一缺乏 NAA 的患者的 NAT8L 基因进行突变搜索后发现，该基因存在一个 19 bp 的同源缺失，导致阅读框发生变化，无法产生功能蛋白。我们的结论是，NAT8L是一种神经元特异性蛋白，负责NAA的合成，在原发性NAA缺乏症（低乙酰天冬氨酸症）中发生突变。这种酶的分子鉴定将为阐明神经元中这种最丰富的氨基酸衍生物的功能以及诊断其他患者的低乙酰天冬氨酸症提供新的视角。