5,6-二羟基-2-异丙基嘧啶-4-甲酸甲酯 | 954241-01-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 5,6-二羟基-2-异丙基嘧啶-4-甲酸甲酯
• 英文名称: methyl 5-hydroxy-2-isopropyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-4-carboxylate
• 英文别名: methyl 5-hydroxy-2-isopropyl-6-oxo-1,6-dihydroxypyrimidine-4-carboxylate；Methyl 5,6-dihydroxy-2-isopropylpyrimidine-4-carboxylate；methyl 5-hydroxy-6-oxo-2-propan-2-yl-1H-pyrimidine-4-carboxylate
• CAS: 954241-01-1
• 化学式: C₉H₁₂N₂O₄
• mdl: MFCD09701378
• 分子量: 212.205
• InChiKey: PZFXKDHJXBNUPU-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  317.3±52.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.37±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.444
• 拓扑面积：
  88
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5,6-二羟基-2-异丙基嘧啶-4-甲酸甲酯 在 吡啶 、 caesium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 72.33h， 生成 methyl 5-(benzoyloxy)-2-isopropyl-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-4-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  用于人类免疫缺陷病毒 1 整合酶捕获的基于 Raltegravir 的光亲和标记探针的开发

  摘要：

  光亲和标记 (PAL) 是分子识别领域即将到来的强大工具之一。它包括动态参数的确定，例如目标蛋白的识别和定位以及药物结合位点。在这项研究中，按照 FDA 批准的药物 Raltegravir 的结构，设计并合成了一种用于全长人类免疫缺陷病毒 1 整合酶 (HIV-1 IN) 捕获的光亲和标记探针。发现该光探针与其母体分子相比保留了 HIV IN 抑制潜力，并证明了标记 HIV-1 IN 蛋白的能力。在蛋白质消化与质量和分子建模分析相结合后，然后确定催化位点附近的假定光探针/抑制剂结合位点。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.0c00009
• 作为产物：
  描述：

  dimethyl 2-(1-amino-2-methylpropylideneaminoxy)but-2-endioate 以 邻二甲苯 为溶剂， 反应 48.0h， 以55%的产率得到5,6-二羟基-2-异丙基嘧啶-4-甲酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  用于人类免疫缺陷病毒 1 整合酶捕获的基于 Raltegravir 的光亲和标记探针的开发

  摘要：

  光亲和标记 (PAL) 是分子识别领域即将到来的强大工具之一。它包括动态参数的确定，例如目标蛋白的识别和定位以及药物结合位点。在这项研究中，按照 FDA 批准的药物 Raltegravir 的结构，设计并合成了一种用于全长人类免疫缺陷病毒 1 整合酶 (HIV-1 IN) 捕获的光亲和标记探针。发现该光探针与其母体分子相比保留了 HIV IN 抑制潜力，并证明了标记 HIV-1 IN 蛋白的能力。在蛋白质消化与质量和分子建模分析相结合后，然后确定催化位点附近的假定光探针/抑制剂结合位点。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.0c00009

文献信息

• Dihydroxypyrimidine-4-carboxamides as Novel Potent and Selective HIV Integrase Inhibitors
  作者：Paola Pace、M. Emilia Di Francesco、Cristina Gardelli、Steven Harper、Ester Muraglia、Emanuela Nizi、Federica Orvieto、Alessia Petrocchi、Marco Poma、Michael Rowley、Rita Scarpelli、Ralph Laufer、Odalys Gonzalez Paz、Edith Monteagudo、Fabio Bonelli、Daria Hazuda、Kara A. Stillmock、Vincenzo Summa

  DOI：10.1021/jm070027u

  日期：2007.5.1

  chemotherapeutic intervention in the treatment of AIDS that has also recently been confirmed in the clinical setting. We report here on the design and synthesis of N-benzyl-5,6-dihydroxypyrimidine-4-carboxamides as a class of agents which exhibits potent inhibition of the HIV-integrase-catalyzed strand transfer process. In the current study, structural modifications on these molecules were made in order

  人类免疫缺陷病毒1型（HIV-1）整合酶是复制所需的三种组成型病毒酶之一，是化学疗法干预AIDS的合理靶标，最近在临床环境中也得到了证实。我们在这里报告的N-苄基5,6-二羟基嘧啶-4-羧酰胺的设计和合成作为一类药物，对HIV整合酶催化的链转移过程具有有效的抑制作用。在当前的研究中，对这些分子进行了结构修饰，以检查其对HIV整合酶抑制效能的影响。该系列中最有趣的化合物之一是2- [1-（二甲基氨基）-1-甲基乙基] -N-（4-氟苄基）-5,6-二羟基嘧啶-4-羧酰胺38，CIC95为78 nM。在血清蛋白存在下进行基于细胞的测定。
• Investigating the Role of Metal Chelation in HIV-1 Integrase Strand Transfer Inhibitors
  作者：Alessia Bacchi、Mauro Carcelli、Carlotta Compari、Emilia Fisicaro、Nicolino Pala、Gabriele Rispoli、Dominga Rogolino、Tino W. Sanchez、Mario Sechi、Valentina Sinisi、Nouri Neamati

  DOI：10.1021/jm200851g

  日期：2011.12.22

  HIV-1 integrase (IN) has been validated as an attractive target for the treatment of HIV/AIDS. Several studies have confirmed that the metal binding function is a crucial feature in many of the reported IN inhibitors. To provide new insights on the metal chelating mechanism of IN inhibitors, we prepared a series of metal complexes of two ligands (HL1 and HL2), designed as representative models of the clinically used compounds raltegravir and elvitegravir. Potentiometric measurements were conducted for HL2 in the presence of Mg(II), Mn(II), Co(II), and Zn(II) in order to delineate a metal speciation model. We also determined the X-ray structures of both of the ligands and of three representative metal complexes. Our results support the hypothesis that several selective strand transfer inhibitors preferentially chelate one cation in solution and that the metal complexes can interact with the active site of the enzyme.
• Development of a Raltegravir-based Photoaffinity-Labeled Probe for Human Immunodeficiency Virus-1 Integrase Capture
  作者：Nicolino Pala、Francesca Esposito、Enzo Tramontano、Pankaj Kumar Singh、Vanna Sanna、Mauro Carcelli、Lisa D. Haigh、Sandro Satta、Mario Sechi

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.0c00009

  日期：2020.10.8

  Photoaffinity labeling (PAL) is one of the upcoming and powerful tools in the field of molecular recognition. It includes the determination of dynamic parameters, such as the identification and localization of the target protein and the site of drug binding. In this study, a photoaffinity-labeled probe for full-length human immunodeficiency virus-1 integrase (HIV-1 IN) capture was designed and synthesized

  光亲和标记 (PAL) 是分子识别领域即将到来的强大工具之一。它包括动态参数的确定，例如目标蛋白的识别和定位以及药物结合位点。在这项研究中，按照 FDA 批准的药物 Raltegravir 的结构，设计并合成了一种用于全长人类免疫缺陷病毒 1 整合酶 (HIV-1 IN) 捕获的光亲和标记探针。发现该光探针与其母体分子相比保留了 HIV IN 抑制潜力，并证明了标记 HIV-1 IN 蛋白的能力。在蛋白质消化与质量和分子建模分析相结合后，然后确定催化位点附近的假定光探针/抑制剂结合位点。