alpha-氨基-epsilon-氧代-庚二酸 | 75650-93-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: alpha-氨基-epsilon-氧代-庚二酸
• 英文名称: L-α-amino-ε-ketopimelate
• 英文别名: (S)-2-amino-6-oxopimelic acid；(2S)-2-amino-6-oxoheptanedioic acid
• CAS: 75650-93-0
• 化学式: C₇H₁₁NO₅
• 分子量: 189.168
• InChiKey: UKCSFKLWNHUBDY-BYPYZUCNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.3
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (2R,6S)-2,6-diaminoheptanedioic acid 在 Porphyromonas gingivalis strain W₈₃ meso-2,6-diaminopimelate dehydrogenase 、 nicotinamide adenine dinucleotide phosphate 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 alpha-氨基-epsilon-氧代-庚二酸
  参考文献：
  名称：

  Identification of Small-Molecule Inhibitors against Meso-2, 6-Diaminopimelate Dehydrogenase from Porphyromonas gingivalis

  摘要：

  物种特异性抗菌疗法有可能应对日益严重的抗生素耐药性威胁和人类微生物组的改变。因此，我们着手以牙周病病原体牙龈卟啉单胞菌为模型，展示病原体选择性药物发现方法的开端。通过对代谢网络和重要基因的了解，我们发现了一个 "可药物治疗 "的重要靶点--中二氨基庚二酸脱氢酶，这种酶存在于数量有限的物种中。我们在 ZINC 化学文库中采用高通量虚拟筛选方法，选出了一组潜在的小分子抑制剂。我们首先在大肠杆菌中表达和纯化了牙龈脓杆菌的中二氨基庚二酸脱氢酶，然后对其进行了酶抑制剂筛选研究。含有磺酰胺核心和芳香取代基的几种类似结构支架的抑制剂显示出剂量依赖性抑制作用。对这些化合物进行了进一步测定，显示出合理的全细胞活性，并确定了其抑制机制。我们的结论是，这一靶点的确立和筛选策略为未来开发新的抗菌药物提供了一个模型。

  DOI：

  10.1371/journal.pone.0141126

文献信息

• BIOLOGICAL SYNTHESIS OF DIFUNCTIONAL HEXANES AND PENTANES FROM CARBOHYDRATE FEEDSTOCKS
  申请人：Baynes Brian M.

  公开号：US20120301950A1

  公开（公告）日：2012-11-29

  Provided herein are methods for the production of difunctional alkanes in microorganisms. Also provided are enzymes and nucleic acids encoding such enzymes, associated with the difunctional alkane production from carbohydrates feedstocks in microorganisms. The invention also provides recombinant microorganisms and metabolic pathways for the production of difunctional alkanes.

  本文提供了在微生物中生产双官能基烷烃的方法。同时还提供了编码这种酶的核酸和酶，与从碳水化合物饲料中生产双官能基烷烃相关。本发明还提供了重组微生物和代谢途径，用于生产双官能基烷烃。
• Biological Synthesis of Difunctional Hexanes and Pentanes from Carbohydrate Feedstocks
  申请人：Baynes Brain M.

  公开号：US20130017593A1

  公开（公告）日：2013-01-17

  Provided herein are methods for the production of difunctional alkanes in microorganisms. Also provided are enzymes and nucleic acids encoding such enzymes, associated with the difunctional alkane production from carbohydrates feedstocks in microorganisms. The invention also provides recombinant microorganisms and metabolic pathways for the production of difunctional alkanes.

  本文提供了在微生物中生产二官能烷的方法。同时还提供了编码这些酶的酶和核酸，这些酶与从碳水化合物饲料中生产二官能烷有关。本发明还提供了重组微生物和代谢途径，用于生产二官能烷。
• METHODS OF PRODUCING 6-CARBON CHEMICALS USING 2,6-DIAMINOPIMELATE AS PRECURSOR TO 2-AMINOPIMELATE
  申请人：INVISTA North America S.á r.l.

  公开号：US20150361462A1

  公开（公告）日：2015-12-17

  This document describes biochemical pathways for producing 2-aminopimelate from 2,6-diaminopimelate, and methods for converting 2-aminopimelate to one or more of adipic acid, adipate semialdehyde, caprolactam, 6-aminohexanoic acid, 6-hexanoic acid, hexamethylenediamine, or 1,6-hexanediol by decarboxylating 2-aminopimelate into a six carbon chain aliphatic backbone and enzymatically forming one or two terminal functional groups, comprised of carboxyl, amine or hydroxyl group, in the backbone.

  本文件描述了从2,6-二氨基戊二酸生产2-氨基戊二酸的生化途径，并且提供了将2-氨基戊二酸转化为脂肪二酸、脂肪酸半醛、己内酰胺、6-氨基己酸、6-己酸、六亚甲基二胺或1,6-己二醇的方法，通过将2-氨基戊二酸脱羧成为六碳链脂肪骨架，并在骨架中酶催化形成一个或两个端基官能团，包括羧基、氨基或羟基。
• COMPOSITIONS AND METHODS FOR MODULATING LYSINE PRODUCTION
  申请人：Gilvarg Charles

  公开号：US20090158455A1

  公开（公告）日：2009-06-18

  Compositions and methods which modulate LL-diaminopimelate aminotransferase are disclosed. Also provided are compositions and methods for enhancing lysine biosynthesis in a cell.

  本发明揭示了调节LL-二氨基己内酸氨基转移酶的组合物和方法。还提供了增强细胞中赖氨酸生物合成的组合物和方法。
• D TYPE AMINO ACID DEHYDROGENASE
  申请人：Kureha Corporation

  公开号：EP3666894A1

  公开（公告）日：2020-06-17

  An enzyme having the following characteristics (a) and (b): (a) the enzyme has an activity of reversible dehydrogenation of D-amino acids; (b) the enzyme is a hexamer of polypeptides having an amino acid sequence having 80% or greater identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.

  具有以下特征(a)和(b)的酶： (a) 酶具有 D-氨基酸的可逆脱氢活性； (b) 酶是多肽的六聚体，其氨基酸序列与 SEQ ID NO: 2 的氨基酸序列具有 80% 或更大的同一性。