Met-Ala-Ser

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Met-Ala-Ser
• 英文别名: MAS；(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-azaniumyl-4-methylsulfanylbutanoyl]amino]propanoyl]amino]-3-hydroxypropanoate
• 化学式: C₁₁H₂₁N₃O₅S
• 分子量: 307.371
• InChiKey: WXHHTBVYQOSYSL-FXQIFTODSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.4
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  167
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  、 Met-Ala-Ser 在 盐酸 、 sodium hydroxide 、 potassium hexacyanoferrate(III) 作用下， 以 水 、 重水 为溶剂， 反应 0.33h， 以75%的产率得到C₁₉H₃₂N₆O₉S
  参考文献：
  名称：

  水中化学选择性氨基腈偶联的肽连接

  摘要：

  酰胺键的形成是化学和生物学中最重要的反应之一 1-4，但目前还没有化学方法可以在水中实现 α-肽连接，从而耐受肽连接位点的所有 20 种蛋白质氨基酸。通用遗传密码确立了肽的生物学作用早于生命最后一个普遍的共同祖先，并且肽在生命起源中发挥了重要作用5-9。硫在柠檬酸循环、非核糖体肽合成和聚酮化合物生物合成中的重要作用指向在生命进化过程中，硫酯依赖性肽连接先于 RNA 依赖性蛋白质合成 5,9-13。然而，尚未证明氨酰基硫酯形成的稳健机制。在这里，我们报告了一种化学选择性，高产 α-氨基腈连接，仅利用益生元合理的分子——硫化氢、硫代乙酸盐 12,14 和铁氰化物 12,14-17 或氰基乙炔 8,14——在水中产生 α-肽。这种连接对 α-氨基腈偶联具有极高的选择性，并能耐受所有 20 个蛋白质氨基酸残基。两个基本特征使肽能够在水中连接：α-氨基腈的反应性和 pKaH 使它们与中性 pH 值的

  DOI：

  10.1038/s41586-019-1371-4
• 作为产物：
  描述：

  N-formylmethionine-alanine-serine 在 Staphylococcus aureus peptide deformylase 、 β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 作用下， 以 various solvent(s) 为溶剂， 生成 Met-Ala-Ser
  参考文献：
  名称：

  Macrolactin N, a new peptide deformylase inhibitor produced by Bacillus subtilis

  摘要：

  A new 24-membered ring lactone, macrolactin N, was isolated from a culture broth of Bacillus subtilis and its structure was established by various spectral analysis. Macrolactin N inhibited Staphylococcus aureus peptide deformylase with an IC50 value of 7.5 mu M and also showed antibacterial activity against Escherichia coli and S. aureus. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2006.06.058

文献信息

• Macrolactin N, a new peptide deformylase inhibitor produced by Bacillus subtilis
  作者：Jung-Sung Yoo、Chang-Ji Zheng、Sangku Lee、Jin-Hwan Kwak、Won-Gon Kim

  DOI：10.1016/j.bmcl.2006.06.058

  日期：2006.9

  A new 24-membered ring lactone, macrolactin N, was isolated from a culture broth of Bacillus subtilis and its structure was established by various spectral analysis. Macrolactin N inhibited Staphylococcus aureus peptide deformylase with an IC50 value of 7.5 mu M and also showed antibacterial activity against Escherichia coli and S. aureus. (c) 2006 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Peptide ligation by chemoselective aminonitrile coupling in water
  作者：Pierre Canavelli、Saidul Islam、Matthew W. Powner

  DOI：10.1038/s41586-019-1371-4

  日期：2019.7

  N-to-C peptide ligation. Our model unites prebiotic aminonitrile synthesis and biological α-peptides, suggesting that short N-acyl peptide nitriles were plausible substrates during early evolution.Prebiotic peptide formation is achieved through chemoselective, high-yielding ligation of α-aminonitriles in water, showing selectivity for α-peptide coupling and tolerance of all proteinogenic amino acid residues

  酰胺键的形成是化学和生物学中最重要的反应之一 1-4，但目前还没有化学方法可以在水中实现 α-肽连接，从而耐受肽连接位点的所有 20 种蛋白质氨基酸。通用遗传密码确立了肽的生物学作用早于生命最后一个普遍的共同祖先，并且肽在生命起源中发挥了重要作用5-9。硫在柠檬酸循环、非核糖体肽合成和聚酮化合物生物合成中的重要作用指向在生命进化过程中，硫酯依赖性肽连接先于 RNA 依赖性蛋白质合成 5,9-13。然而，尚未证明氨酰基硫酯形成的稳健机制。在这里，我们报告了一种化学选择性，高产 α-氨基腈连接，仅利用益生元合理的分子——硫化氢、硫代乙酸盐 12,14 和铁氰化物 12,14-17 或氰基乙炔 8,14——在水中产生 α-肽。这种连接对 α-氨基腈偶联具有极高的选择性，并能耐受所有 20 个蛋白质氨基酸残基。两个基本特征使肽能够在水中连接：α-氨基腈的反应性和 pKaH 使它们与中性 pH 值的
• Kinetic analyses and inhibition studies reveal novel features in peptide deformylase 1 from Trypanosoma cruzi
  作者：Carlos A. Rodrígues-Poveda、Guiomar Pérez-Moreno、Antonio E. Vidal、Julio A. Urbina、Dolores González-Pacanowska、Luis M. Ruiz-Pérez

  DOI：10.1016/j.molbiopara.2011.12.003

  日期：2012.3

  In eubacteria and eukaryotic organelles N-terminal methionine excision requires the sequential action of two activities, a peptide deformylase (PDF), which systematically removes the N-formyl group present on all nascent polypeptides and methionine aminopeptidase (MAP), which exscinds methionine specifically and depends on the previous removal of the N-formyl group. In Trypanosoma cruzi two genes encoding bacterial PDF homologues have been identified and referred to as TcPDF-1 and TcPDF-2. Here we report the biochemical characterization of a truncated soluble version of TcPDF-1 lacking the hydrophobic N-terminal domain that is active with the bacterial PDF substrate formyl-methionyl-alanyl-serine but, in contrast to other PDFs, is not inhibited by actinonin. The enzyme is strongly activated by Cu2+ and inhibited by Ni2+. Our results show that T. cruzi PDF exhibits unique features thus providing a new avenue for the design of potential inhibitors for use in the treatment of diseases caused by trypanosomatid parasites. (C) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.

表征谱图