((2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl-14C tetrahydrogen triphosphate | 865805-56-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: ((2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl-14C tetrahydrogen triphosphate
• 英文别名: [5'-¹⁴C]ATP
• CAS: 865805-56-7
• 化学式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃
• 分子量: 509.173
• InChiKey: ZKHQWZAMYRWXGA-JWRPMKDASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.63
• 重原子数：
  31.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  279.13
• 氢给体数：
  7.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ((2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl-14C tetrahydrogen triphosphate 在 class II ribonucleotidetriphosphate reductase 、 adenosylcobalamine 、 2'-脱氧鸟苷 5'-(四氢三磷酸酯) 、 calcium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 反应 2.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  人胸苷磷酸化酶对胸苷水解的过渡态分析

  摘要：

  人胸苷磷酸化酶 (hTP) 负责胸苷 (dT) 稳态，其作用促进血管生成。在没有磷酸盐的情况下，hTP 催化 dT 的缓慢水解脱嘧啶，产生胸腺嘧啶和 2-脱氧核糖 (dRib)。其过渡态使用多重动力学同位素效应 (KIE) 测量进行表征。富含同位素的胸苷由葡萄糖或（脱氧）核糖酶促合成，内在 KIE 用于解释过渡态结构。来自 [1'-(14)C]-、[1-(15)N]-、[1'-(3)H]-、[2'R-(3)H]-、[2'S-( 3)H]-、[4'-(3)H]- 和 [5'-(3)H]dTs 提供的值为 1.033 ± 0.002、1.004 ± 0.002、1.325 ± 0.003、1.101 ± 0.004、± 1.085 、 1.040 ± 0.003 和 1.033 ± 0.003。过渡态分析揭示了一种逐步机制，即早期形成的 2-脱氧核糖化以及水分子对高能中间体的亲核攻击的更高能量

  DOI：

  10.1021/ja105041j
• 作为产物：
  描述：

  [6-14C]D-glucose 、 腺嘌呤 在 glucose-6-phosphate dehydrogenase 、 pyruvate kinase 、 双甘肽 、 磷烯醇丙酮酸 、 adenine phosphoribosyltransferase 、 decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase 、 5’-三磷酸腺苷 、 potassium hydroxide 、 magnesium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 反应 20.0h， 生成 ((2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl)methyl-14C tetrahydrogen triphosphate
  参考文献：
  名称：

  人胸苷磷酸化酶对胸苷水解的过渡态分析

  摘要：

  人胸苷磷酸化酶 (hTP) 负责胸苷 (dT) 稳态，其作用促进血管生成。在没有磷酸盐的情况下，hTP 催化 dT 的缓慢水解脱嘧啶，产生胸腺嘧啶和 2-脱氧核糖 (dRib)。其过渡态使用多重动力学同位素效应 (KIE) 测量进行表征。富含同位素的胸苷由葡萄糖或（脱氧）核糖酶促合成，内在 KIE 用于解释过渡态结构。来自 [1'-(14)C]-、[1-(15)N]-、[1'-(3)H]-、[2'R-(3)H]-、[2'S-( 3)H]-、[4'-(3)H]- 和 [5'-(3)H]dTs 提供的值为 1.033 ± 0.002、1.004 ± 0.002、1.325 ± 0.003、1.101 ± 0.004、± 1.085 、 1.040 ± 0.003 和 1.033 ± 0.003。过渡态分析揭示了一种逐步机制，即早期形成的 2-脱氧核糖化以及水分子对高能中间体的亲核攻击的更高能量

  DOI：

  10.1021/ja105041j

文献信息

• The Transition-State Structure for Human MAT2A from Isotope Effects
  作者：Ross S. Firestone、Vern L. Schramm

  DOI：10.1021/jacs.7b05803

  日期：2017.10.4

  inhibitors. We used kinetic isotope effect (KIE), commitment factor (Cf), and binding isotope effect (BIE) measurements combined with quantum mechanical (QM) calculations to solve the transition state structure of human MAT2A. The reaction is characterized by an advanced SN2 transition state. The bond forming from the nucleophilic methionine sulfur to the 5′-C of ATP is 2.03 Å at the transition state (bond

  人甲硫氨酸S-腺苷基转移酶（MAT2A）催化由ATP和甲硫氨酸形成S-腺苷甲硫氨酸（SAM）。合成致死遗传分析已将MAT2A作为缺乏5'-甲基硫代腺苷磷酸化酶（MTAP）表达的肿瘤细胞的抗癌靶标。大约15％的人类癌症是MTAP – / –。其余的可以呈现MTAP -通过MTAP抑制剂。我们将动力学同位素效应（KIE），承诺因子（C f）和结合同位素效应（BIE）测量与量子力学（QM）计算结合使用，以解决人类MAT2A的过渡态结构。该反应的特征在于先进的S N2过渡状态。从亲核蛋氨酸硫到ATP的5'-C形成的键在过渡态（键序为0.67）为2.03Å。ATP的离去基团三磷酸的离解进展顺利，并在ATP的5'-C与三磷酸的氧之间形成2.32Å键（键序为0.23）。MAT2A及其MAT2B调节亚基的相互作用不会导致内在KIE发生变化，表明相同的过渡态结构。与来自大肠杆菌的蛋氨酸腺苷基转移酶的近对称过