5'-CGACGA-3' | 1177254-66-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: 5'-CGACGA-3'
• CAS: 1177254-66-8
• 化学式: C₅₈H₇₃N₂₆O₃₈P₅
• 分子量: 1897.24
• InChiKey: DJQOZWQUQTWFAE-VFTBAXAWSA-N

物化性质

• 密度：
  2.50±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -8.65
• 重原子数：
  127.0
• 可旋转键数：
  32.0
• 环数：
  16.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  936.26
• 氢给体数：
  21.0
• 氢受体数：
  57.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-CGACGA-3' 在 (Zn⁽²⁺⁾)3(1,3,5-tris[(1,5,9-triazacyclododecan-3-yl)oxymethyl]benzene)⁽⁶⁺⁾ 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 CpAp(3') 、 5'-CGp-3' 、 5'-ACGA-3' 、 5'-CGACp-3' 、 5'-CGACp-3' 、 5'-GACGA-3' 、 5'-CGACGp-3' 、 5'-CGACGp-3' 、 Phosphoric acid (2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-purin-9-yl)-4-hydroxy-2-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-3-yl ester (2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-purin-9-yl)-3,4-dihydroxy-tetrahydro-furan-2-ylmethyl ester 、 腺苷
  参考文献：
  名称：

  氮杂皇冠衍生配体的二核和三核Zn（II）配合物切割短寡核糖核酸的碱基部分的选择性†

  摘要：

  六聚寡核糖核苷酸的双核Zn 2+配合物的切割。1,3-双[（（1,5,9-三氮杂环十二烷-3-基）氧基甲基]苯（L 1）和三核Zn 2+络合物1,3,5-三[[（1,5,9-三氮杂环十二烷-3-基）氧甲基]苯（L 3）已被研究。在足够低的浓度下的双核配合物裂解（[（锌2+）2大号1 ]≤0.1毫摩尔大号-1）的5' NPU 3'和5' UPN 3'键（N = G，C，A）更容易比其他磷酸二酯键，但叶片5' UPU 3'位点不变。三核（锌2+）3大号3复合物，进而，裂解5' UPU 3'键更容易比其他任何联系，甚至快于5' NPU3'和5' UPN 3'的网站。多少有些出人意料，在5' UpNpU 3'网站是由二和三核配都只能慢慢切割。当六核苷酸通过3个额外的2'- O-甲基核糖核苷酸CG对封闭在发夹环上时，碱基部分的选择性在质量上仍然相似，尽管略微不那么明显。双螺旋杆内磷酸二酯键不断裂，甚

  DOI：

  10.1039/b904828f