cyclic Fmoc-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Thr(Bzl)-Dab(2-CIZ)-Dab-Dab(2-CIZ)-D-Phe-Leu-Dab(2-CIZ)-Dab(2-CIZ)-Thr(Bzl), containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁶ and α-COOH of Thr¹² | 1173986-62-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: cyclic Fmoc-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Thr(Bzl)-Dab(2-CIZ)-Dab-Dab(2-CIZ)-D-Phe-Leu-Dab(2-CIZ)-Dab(2-CIZ)-Thr(Bzl), containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁶ and α-COOH of Thr¹²
• 英文别名: Fmoc-Arg(Tos)(Tos)-Arg(Tos)(Tos)-Arg(Tos)(Tos)-Thr(Bn)(Bn)-Dab(Cbz(2-Cl))(Cbz(2-Cl))-Dab(1)-Dab(Cbz(2-Cl))(Cbz(2-Cl))-D-Phe-Leu-Dab(Cbz(2-Cl))(Cbz(2-Cl))-Dab(Cbz(2-Cl))(Cbz(2-Cl))-Thr(Bn)(Bn)-(1)；(2-chlorophenyl)methyl N-[2-[(2S,5R,8S,11S,14S,17S,22S)-5-benzyl-11,14-bis[2-[(2-chlorophenyl)methoxycarbonylamino]ethyl]-22-[[(2S)-4-[(2-chlorophenyl)methoxycarbonylamino]-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-5-[[N-(4-methylphenyl)sulfonylcarbamimidoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[[N-(4-methylphenyl)sulfonylcarbamimidoyl]amino]pentanoyl]amino]-5-[[N-(4-methylphenyl)sulfonylcarbamimidoyl]amino]pentanoyl]amino]-3-phenylmethoxybutanoyl]amino]butanoyl]amino]-8-(2-methylpropyl)-3,6,9,12,15,18,23-heptaoxo-17-[(1R)-1-phenylmethoxyethyl]-1,4,7,10,13,16,19-heptazacyclotricos-2-yl]ethyl]carbamate
• CAS: 1173986-62-3
• 化学式: C₁₄₃H₁₇₀Cl₄N₂₆O₃₀S₃
• 分子量: 2971.09
• InChiKey: JCJNJXQUEHQAIR-WLYUUDDESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  16.1
• 重原子数：
  206
• 可旋转键数：
  74
• 环数：
  14.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  831
• 氢给体数：
  26
• 氢受体数：
  33

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cyclic Fmoc-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Thr(Bzl)-Dab(2-CIZ)-Dab-Dab(2-CIZ)-D-Phe-Leu-Dab(2-CIZ)-Dab(2-CIZ)-Thr(Bzl), containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁶ and α-COOH of Thr¹² 在 哌啶 、 氢氟酸 、 苯甲醚 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.25h， 生成 cyclic Arg-Arg-Arg-Thr-Dab-Dab-Dab-D-Phe-Leu-Dab-Dab-Thr, containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁶ and α-COOH of Thr¹²
  参考文献：
  名称：

  Development of Des-Fatty Acyl-Polymyxin B Decapeptide Analogs with Pseudomonas aeruginosa-Specific Antimicrobial Activity

  摘要：

  合成了 12 个去脂肪酰基多粘菌素 B（Des-FA-[X1]-PMB，X=各种氨基酸或肽）的 N 端类似物，并考察了它们对大肠杆菌（E. coli）、鼠伤寒沙门氏菌（S. Typhimurium）和铜绿假单胞菌（P. aeruginosa）的抗菌活性。研究发现，Des-FA-[Dap1]-、Des-FA-[Ser1]-、Des-FA-[Dab-Dab-Dab1]-和 Des-FA-[Arg-Arg-Arg1]-PMB仅对铜绿假单胞菌具有强效活性，其 MIC 值为 0.5-1 nmol/ml。与先导化合物 Des-FA-[Dab1]-PMB 和多粘菌素 B (PMB) 相比，X 为 Lys、Arg、Leu 或 Ala 的类似物对三种受试细菌的抗菌活性并没有提高。Des-FA-[Trp1]-PMB 和 Des-FA-[Phe1]-PMB 对铜绿假单胞菌的活性降低。结果表明，N-末端的紧密亲水氨基酸（C3）或碱性三肽为铜绿假单胞菌的杀菌活性提供了特异性。在 LPS 结合活性方面，Des-FA-[Dab-Dab-Dab1]-PMB 和 Des-FA-[Arg-Arg-Arg1]-PMB 的活性与 PMB 相当，而 Des-FA-[Ala-Ala-Ala1]-PMB 的活性则非常低。小鼠尾部静脉注射试验表明，Des-FA-[Dap1]-PMB 和 Des-FA-[Trp1]-PMB 的急性毒性较低，半数致死剂量分别为 23.5 和 19.0 μmol/kg，而 PMB 的半数致死剂量为 4.8 μmol/kg。

  DOI：

  10.1248/cpb.57.332
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Thr(Bzl)-Dab(2-ClZ)-Dab-Dab(2-ClZ)-D-Phe-Leu-Dab(2-ClZ)-Dab(2-ClZ)-Thr(BzL)-OH 在 N-甲基吗啉 、 叠氮磷酸二苯酯 作用下， 以 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 cyclic Fmoc-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Arg(Tos)-Thr(Bzl)-Dab(2-CIZ)-Dab-Dab(2-CIZ)-D-Phe-Leu-Dab(2-CIZ)-Dab(2-CIZ)-Thr(Bzl), containing amide bond between γ-NH2 of Dab⁶ and α-COOH of Thr¹²
  参考文献：
  名称：

  Development of Des-Fatty Acyl-Polymyxin B Decapeptide Analogs with Pseudomonas aeruginosa-Specific Antimicrobial Activity

  摘要：

  合成了 12 个去脂肪酰基多粘菌素 B（Des-FA-[X1]-PMB，X=各种氨基酸或肽）的 N 端类似物，并考察了它们对大肠杆菌（E. coli）、鼠伤寒沙门氏菌（S. Typhimurium）和铜绿假单胞菌（P. aeruginosa）的抗菌活性。研究发现，Des-FA-[Dap1]-、Des-FA-[Ser1]-、Des-FA-[Dab-Dab-Dab1]-和 Des-FA-[Arg-Arg-Arg1]-PMB仅对铜绿假单胞菌具有强效活性，其 MIC 值为 0.5-1 nmol/ml。与先导化合物 Des-FA-[Dab1]-PMB 和多粘菌素 B (PMB) 相比，X 为 Lys、Arg、Leu 或 Ala 的类似物对三种受试细菌的抗菌活性并没有提高。Des-FA-[Trp1]-PMB 和 Des-FA-[Phe1]-PMB 对铜绿假单胞菌的活性降低。结果表明，N-末端的紧密亲水氨基酸（C3）或碱性三肽为铜绿假单胞菌的杀菌活性提供了特异性。在 LPS 结合活性方面，Des-FA-[Dab-Dab-Dab1]-PMB 和 Des-FA-[Arg-Arg-Arg1]-PMB 的活性与 PMB 相当，而 Des-FA-[Ala-Ala-Ala1]-PMB 的活性则非常低。小鼠尾部静脉注射试验表明，Des-FA-[Dap1]-PMB 和 Des-FA-[Trp1]-PMB 的急性毒性较低，半数致死剂量分别为 23.5 和 19.0 μmol/kg，而 PMB 的半数致死剂量为 4.8 μmol/kg。

  DOI：

  10.1248/cpb.57.332