L-α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-ω-[2-(3',3'-dimethyl-6-nitro-3'H-spiro[chromene-2,2'-indole]-1'-yl)ethoxycarbonyl]diaminobutyric acid | 863922-39-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: L-α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-ω-[2-(3',3'-dimethyl-6-nitro-3'H-spiro[chromene-2,2'-indole]-1'-yl)ethoxycarbonyl]diaminobutyric acid
• 英文别名: (2S)-4-[2-(3',3'-dimethyl-6-nitrospiro[chromene-2,2'-indole]-1'-yl)ethoxycarbonylamino]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)butanoic acid
• CAS: 863922-39-8
• 化学式: C₄₀H₃₈N₄O₉
• 分子量: 718.763
• InChiKey: VKGIQADPTLKBPR-NTLJKDLGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.3
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  172
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  L-α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-ω-[2-(3',3'-dimethyl-6-nitro-3'H-spiro[chromene-2,2'-indole]-1'-yl)ethoxycarbonyl]diaminobutyric acid 、 Fmoc-甘氨酸 、 Fmoc-L-亮氨酸 、 Fmoc-Pbf-L-精氨酸 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 以3.8%的产率得到Ac-Cys(Acm)-Gly-Dab([2-(3',3'-dimethyl-6-nitro-3'H-spiro[chromene-2,2'-indole]-1'-yl)ethoxycarbonyl])-Gly-Leu-Arg-Arg-Ala-Ser-Leu-Gly-NH2
  参考文献：
  名称：

  A novel fluorescence sensing system using a photochromism-based assay (P-CHROBA) technique for the detection of target proteins

  摘要：

  在后基因组时代，已经开发了许多生物技术来研究复杂的蛋白质功能和网络，包括可以根据荧光强度的变化检测分子相互作用的蛋白质检测微阵列。然而，由于需要固定捕获剂和用发色团标记分析物，此类技术获得可重复和定量结果的能力可能会受到影响。在本研究中，我们首先报告了含螺吡喃光致变色肽的设计和合成，然后展示了一种独特的荧光传感系统，该系统包括基于光致变色的测定（P-CHROBA）技术来区分靶蛋白。肽中的螺吡喃部分在 SP 到 MC 异构化（热着色）和 MC 到 SP 光异构化（光漂白）中表现出特有的物理化学性质，具体取决于微环境的变化，例如溶剂的介电常数和产生的空间位阻通过分子相互作用。我们尝试通过监测肽中 MC 形式的荧光衰减，利用可重复的 MC 到 SP 光异构化特性来检测蛋白质-肽相互作用。这可以减少由过量试剂发射引起的背景荧光信号，并避免将探测分子费力地引入分析物以及将捕获剂固定到固体表面上。基于光异构化特性的蛋白质指纹（PFP）可以成功区分六种不同的模型蛋白质，P-CHROBA 和 PFP 技术的结合将成为分析目标蛋白质的有力工具，并获得可重复且可靠的结果。

  DOI：

  10.1039/b501877n
• 作为产物：
  描述：

  N-羟乙基-3,3-二甲基-6-硝基吲哚啉螺吡喃 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.5h， 生成 L-α-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-ω-[2-(3',3'-dimethyl-6-nitro-3'H-spiro[chromene-2,2'-indole]-1'-yl)ethoxycarbonyl]diaminobutyric acid
  参考文献：
  名称：

  A novel fluorescence sensing system using a photochromism-based assay (P-CHROBA) technique for the detection of target proteins

  摘要：

  在后基因组时代，已经开发了许多生物技术来研究复杂的蛋白质功能和网络，包括可以根据荧光强度的变化检测分子相互作用的蛋白质检测微阵列。然而，由于需要固定捕获剂和用发色团标记分析物，此类技术获得可重复和定量结果的能力可能会受到影响。在本研究中，我们首先报告了含螺吡喃光致变色肽的设计和合成，然后展示了一种独特的荧光传感系统，该系统包括基于光致变色的测定（P-CHROBA）技术来区分靶蛋白。肽中的螺吡喃部分在 SP 到 MC 异构化（热着色）和 MC 到 SP 光异构化（光漂白）中表现出特有的物理化学性质，具体取决于微环境的变化，例如溶剂的介电常数和产生的空间位阻通过分子相互作用。我们尝试通过监测肽中 MC 形式的荧光衰减，利用可重复的 MC 到 SP 光异构化特性来检测蛋白质-肽相互作用。这可以减少由过量试剂发射引起的背景荧光信号，并避免将探测分子费力地引入分析物以及将捕获剂固定到固体表面上。基于光异构化特性的蛋白质指纹（PFP）可以成功区分六种不同的模型蛋白质，P-CHROBA 和 PFP 技术的结合将成为分析目标蛋白质的有力工具，并获得可重复且可靠的结果。

  DOI：

  10.1039/b501877n