(2-[2-[N,N-bis(2-trifluoroacetamidoethyl)]-aminoethyl]carbamoyl-(E)-vinyl)-2'-deoxyuridine | 1056651-20-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: (2-[2-[N,N-bis(2-trifluoroacetamidoethyl)]-aminoethyl]carbamoyl-(E)-vinyl)-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 5-(2-[2-[N,N-bis(2-trifluoroacetamidoethyl)]aminoethyl]carbamoyl-(E)-vinyl)-2'-deoxyuridine
• CAS: 1056651-20-7
• 化学式: C₂₂H₂₈F₆N₆O₈
• 分子量: 618.49
• InChiKey: LBKVHDICPWMIQW-AEOASUMASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.03
• 重原子数：
  42.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.59
• 拓扑面积：
  195.09
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2-[2-[N,N-bis(2-trifluoroacetamidoethyl)]-aminoethyl]carbamoyl-(E)-vinyl)-2'-deoxyuridine 在 吡啶 、 四氮唑 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 5'-O-DMTr-(2-[2-[N,N-bis(2-trifluoroacetamidoethyl)]-aminoethyl]carbamoyl-(E)-vinyl)-2'-deoxyuridine 3'-[(2-cyanoethyl)-(N,N-diisopropyl)]-phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Nucleic acid probe, method for designing nucleic acid probe, and method for detecting target sequence

  摘要：

  本发明提供了一种能够通过PCR方法在突变检测、错配检测等方面实现高检测灵敏度和高特异性的核酸探针，以及设计这种核酸探针的方法和检测目标序列的方法。该核酸探针包括一个核酸分子，该核酸分子包括多个表现出激子效应的荧光染料基团。表现出激子效应的至少两个荧光染料基团与核酸分子中的同一碱基或两个相邻碱基结合，每个荧光染料基团通过连接物（连接原子或连接原子团）结合。核酸分子的延伸端被化学修饰，从而阻止核酸分子的延伸反应。

  公开号：

  US09862989B2
• 作为产物：
  描述：

  碘苷 在 水 、 palladium diacetate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 sodium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 20.17h， 生成 (2-[2-[N,N-bis(2-trifluoroacetamidoethyl)]-aminoethyl]carbamoyl-(E)-vinyl)-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  Nucleic acid probe, method for designing nucleic acid probe, and method for detecting target sequence

  摘要：

  本发明提供了一种能够通过PCR方法在突变检测、错配检测等方面实现高检测灵敏度和高特异性的核酸探针，以及设计这种核酸探针的方法和检测目标序列的方法。该核酸探针包括一个核酸分子，该核酸分子包括多个表现出激子效应的荧光染料基团。表现出激子效应的至少两个荧光染料基团与核酸分子中的同一碱基或两个相邻碱基结合，每个荧光染料基团通过连接物（连接原子或连接原子团）结合。核酸分子的延伸端被化学修饰，从而阻止核酸分子的延伸反应。

  公开号：

  US09862989B2

文献信息

• COMPOUND HAVING STRUCTURE DERIVED FROM MONONUCLEOSIDE OR MONONUCLEOTIDE, NUCLEIC ACID, LABELING SUBSTANCE, AND METHOD AND KIT FOR DETECTION OF NUCLEIC ACID
  申请人：Riken

  公开号：EP2130835B1

  公开（公告）日：2012-05-23