1-ethyl-2-[3-[1-[6-[2-[[4-[(2-iodoacetyl)amino]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-3,3-dimethylindole-5-sulfonate | 1254054-71-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 1-ethyl-2-[3-[1-[6-[2-[[4-[(2-iodoacetyl)amino]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
• CAS: 1254054-71-1
• 化学式: C₄₂H₅₀IN₅O₉S₂
• 分子量: 959.924
• InChiKey: YZWKQMATGUBQJH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  59
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  222
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-ethyl-2-[3-[1-[6-[2-[[4-[(2-iodoacetyl)amino]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-3,3-dimethylindole-5-sulfonate 、 2-[5-[1-[6-[2-[[4-[[2-[3-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]-5-[2-[2-(2-sulfanylethoxy)ethoxy]ethylcarbamoyl]anilino]-2-oxoethoxy]iminomethyl]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate 以 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 以36%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  首个“即用型”苯基异三官能交联剂，可进行多种生物偶联作用†

  摘要：

  描述了带有一组三个不同且正交的生物可共轭基团（氨氧基，叠氮基和硫醇）的第一水溶性苯衍生物的合成和应用。5-氨基间苯二甲酸支架和不寻常的对酸不稳定的保护基团的组合使用，以暂时掩盖氨氧基和硫醇部分，已为开发高收率的方法合成高价的这种三价生物共轭平台提供了可能。通过（1）快速制备具有有价值的光谱特性的三色FRET级联反应，可以说明这种“即用型”交联剂在创建复杂且易碎的三组分（生物）分子系统中的潜在实用性。 （2）肽和肽-寡核苷酸结合物的发光/荧光标记。因此，通过三个步骤过程中或在“一锅”方式，既涉及肟结扎，巯基烷基化（S Ñ 2或迈克尔加成）和铜-催化的叠氮化物-炔烃的1,3-偶极环加成加成（CuAAC）反应。

  DOI：

  10.1039/c3ob40086g
• 作为产物：
  描述：

  2-[3-[1-[6-(2-aminoethylamino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate 、 N-sulfosuccinimidyl-(4-iodoacetyl)-aminobenzoate 反应 3.0h， 以0.5 mg的产率得到1-ethyl-2-[3-[1-[6-[2-[[4-[(2-iodoacetyl)amino]benzoyl]amino]ethylamino]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  一种通用的即用型异三功能交联剂，可轻松合成获得复杂的生物缀合物† ‡

  摘要：

  我们首次描述了带有三个完全相互兼容的生物正交功能基团的原始异三功能交联剂（也称为三脚架）的合成和某些生物缀合应用。与我们最近报道的第一代三脚架相反（Org。生物摩尔。化学 ，2008，6，3065），使用叠氮基取代的亲核试剂敏感的活性氨基甲酸酯分子部分使我们能够达到目标化学正交性，而无需使用临时的氨氧基和硫醇保护基。因此，通过三脚架的连续衍生，通过铜介导的1，3-偶极环加成，肟连接和与水相容的轻度硫醇烷基化反应明显更简单，更方便。化学选择性生物缀合方案是通过基于FRET盒的制备而优化的花青 和/或 an吨荧光染料对以及随后锚定到易碎的生物分子上。该通用交联剂的适用性还通过通过SPIT-FRI方法制备适合检测黄曲霉毒素B1的生物芯片来说明。

  DOI：

  10.1039/c0ob00133c