tert-butyl 2-[[1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-4-oxo-2-sulfanylidenepyrimidin-5-yl]methyl-(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]acetate | 89129-10-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: tert-butyl 2-[[1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-4-oxo-2-sulfanylidenepyrimidin-5-yl]methyl-(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]acetate
• CAS: 89129-10-2
• 化学式: C₂₁H₂₈F₃N₃O₈S
• 分子量: 539.53
• InChiKey: DRDPZVPTYQHFTB-XKVFNRALSA-N

物化性质

• 密度：
  1.47±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.55
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  132.32
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl 2-[[1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-4-oxo-2-sulfanylidenepyrimidin-5-yl]methyl-(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]acetate 在 盐酸 、 barium dihydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 2-[[1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-二羟基-5-(羟基甲基)四氢呋喃-2-基]-4-氧代-2-巯基嘧啶-5-基]甲基氨基]乙酸
  参考文献：
  名称：

  修饰的核苷从tRNA的“摆动位置”开始。5-羧甲基氨基甲基尿苷和5-羧甲基氨基甲基-2-硫尿苷的合成

  摘要：

  已经描述了从tRNA 1 Gly（枯草芽孢杆菌）分离的5-羧甲基氨基甲基尿苷及其从tRNA Lys（枯草芽孢杆菌）的2-硫类似物的合成。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)87878-8
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-O-isopropylidene-5-chloromethyl-2-thiouridine 在 碳酸氢钠 、 三乙胺 作用下， 以 吡啶 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 22.0h， 生成 tert-butyl 2-[[1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-(hydroxymethyl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-4-oxo-2-sulfanylidenepyrimidin-5-yl]methyl-(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]acetate
  参考文献：
  名称：

  修饰的核苷从tRNA的“摆动位置”开始。5-羧甲基氨基甲基尿苷和5-羧甲基氨基甲基-2-硫尿苷的合成

  摘要：

  已经描述了从tRNA 1 Gly（枯草芽孢杆菌）分离的5-羧甲基氨基甲基尿苷及其从tRNA Lys（枯草芽孢杆菌）的2-硫类似物的合成。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)87878-8