[(3aR,5R,6S,6aR)-2,2-dimethyl-6-(naphthalen-2-ylmethoxy)-5-(naphthalen-2-ylmethoxymethyl)-6,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]methanol | 1091608-06-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: [(3aR,5R,6S,6aR)-2,2-dimethyl-6-(naphthalen-2-ylmethoxy)-5-(naphthalen-2-ylmethoxymethyl)-6,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]methanol
• CAS: 1091608-06-8
• 化学式: C₃₁H₃₂O₆
• 分子量: 500.591
• InChiKey: PDFOWCYFFBIAKR-HCEBPPTQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  66.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(3aR,5R,6S,6aR)-2,2-dimethyl-6-(naphthalen-2-ylmethoxy)-5-(naphthalen-2-ylmethoxymethyl)-6,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]methanol 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 草酰氯 、 硫酸 、 氨 、 四氯化锡 、 溶剂黄146 、 二甲基亚砜 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  Substituted 2′-thio-bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom

  摘要：

  本文提供了一种新颖的双环核苷，包括包含这种双环核苷的寡聚化合物以及使用这些寡聚化合物的方法。更具体地说，这种新颖的双环核苷包括一个呋喃糖环系统，其中包括一个桥，该桥包括连接到2'-亚砜或砜基团的4'-亚甲基基团，并且可选地包括连接到4'-亚甲基和/或5'-位置的一个或多个取代基团。在某些实施方式中，本文提供的寡聚化合物预计会与靶RNA的部分杂交，导致靶RNA的正常功能丧失。

  公开号：

  US09029335B2
• 作为产物：
  描述：

  1,2:5,6-二异亚丙基-alpha-D-异呋喃糖 在 sodium periodate 、 水 、 sodium hydride 、 溶剂黄146 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 90.0h， 生成 [(3aR,5R,6S,6aR)-2,2-dimethyl-6-(naphthalen-2-ylmethoxy)-5-(naphthalen-2-ylmethoxymethyl)-6,6a-dihydro-3aH-furo[2,3-d][1,3]dioxol-5-yl]methanol
  参考文献：
  名称：

  Substituted 2′-thio-bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom

  摘要：

  本文提供了一种新颖的双环核苷，包括包含这种双环核苷的寡聚化合物以及使用这些寡聚化合物的方法。更具体地说，这种新颖的双环核苷包括一个呋喃糖环系统，其中包括一个桥，该桥包括连接到2'-亚砜或砜基团的4'-亚甲基基团，并且可选地包括连接到4'-亚甲基和/或5'-位置的一个或多个取代基团。在某些实施方式中，本文提供的寡聚化合物预计会与靶RNA的部分杂交，导致靶RNA的正常功能丧失。

  公开号：

  US09029335B2

文献信息

• Antisense Oligonucleotides Containing Conformationally Constrained 2′,4′-(<i>N</i>-Methoxy)aminomethylene and 2′,4′-Aminooxymethylene and 2′-<i>O</i>,4′-<i>C</i>-Aminomethylene Bridged Nucleoside Analogues Show Improved Potency in Animal Models
  作者：Thazha P. Prakash、Andrew Siwkowski、Charles R. Allerson、Michael T. Migawa、Sam Lee、Hans J. Gaus、Chris Black、Punit P. Seth、Eric E. Swayze、Balkrishen Bhat

  DOI：10.1021/jm9013295

  日期：2010.2.25

  To identify chemistries and strategies to improve the potency of MOE second generation ASOs, we have evaluated gapmer antisense oligonucleotides containing BNAs having N-O bonds. These modifications include N-MeO-amino BNA, N-Me-aminooxy BNA, 2'4'-BNA(NC)[NMe], and 2',4'-BNA(NC) bridged nucleoside analogues. These modifications provided increased thermal stability and improved in vitro activity compared to the corresponding ASO containing the MOE modification. Additionally, ASOs containing N-MeO-amino BNA, N-Me-aminooxy BNA, and 2',4'-BNA(NC)[NMe] modifications showed improved in vivo activity (> 5-fold) compared to MOE ASO. Importantly, toxicity parameters, such as AST, ALT, liver, kidney, and body weights, were found to be normal for N-MeO-amino BNA, N-Me-aminooxy BNA, and 2'4'-BNA(NC)[NMe] ASO treated animals. The data generated in these experiments suggest that N-MeO-amino BNA, N-Me-aminooxy BNA, and 2'4'-BNA(NC)[NMe] are useful modifications for applications in both antisense and other oligonucleotide based drug discovery efforts.
• Substituted 2′-thio-bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
  申请人：Isis Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：US09029335B2

  公开（公告）日：2015-05-12

  Provided herein are novel bicyclic nucleosides, oligomeric compounds that include such bicyclic nucleosides and methods of using the oligomeric compounds. More particularly, the novel bicyclic nucleosides comprise a furanose ring system having a bridge comprising a 4′-methylene group attached to a 2′-sulfoxide or sulfone group and optionally including one or more substituent groups attached to the 4′-methylene and or the 5′-position. In certain embodiments, the oligomeric compounds provided herein are expected to hybridize to a portion of a target RNA resulting in loss of normal function of the target RNA.

  本文提供了一种新颖的双环核苷，包括包含这种双环核苷的寡聚化合物以及使用这些寡聚化合物的方法。更具体地说，这种新颖的双环核苷包括一个呋喃糖环系统，其中包括一个桥，该桥包括连接到2'-亚砜或砜基团的4'-亚甲基基团，并且可选地包括连接到4'-亚甲基和/或5'-位置的一个或多个取代基团。在某些实施方式中，本文提供的寡聚化合物预计会与靶RNA的部分杂交，导致靶RNA的正常功能丧失。