(2S,3S,3aS,9aR)-2-Biphenyl-4-yl-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-ol | 851787-49-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (2S,3S,3aS,9aR)-2-Biphenyl-4-yl-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-ol
• CAS: 851787-49-0
• 化学式: C₂₉H₄₄O₅Si₂
• 分子量: 528.836
• InChiKey: OOXORUSSXZUTFO-GIFPIDKJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.11
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.59
• 拓扑面积：
  57.15
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,3S,3aS,9aR)-2-Biphenyl-4-yl-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-ol 在 吡啶 、 偶氮二异丁腈 、 三正丁基氢锡 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 45.5h， 生成 3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(4-phenylphenyl)oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
  参考文献：
  名称：

  联吡啶-和联苯-DNA：基于链间芳族堆积的识别基序。

  摘要：

  描述了含有两个芳香族，无氢键的核碱基取代基联苯（I）和联吡啶基（Y）的C-核苷的合成及其掺入寡核苷酸。然后通过紫外熔解曲线分析，凝胶迁移率测定，CD和NMR光谱研究了它们在不同顺序排列中的同种和异种识别特性。中心含有一个联苯对的十二聚体双链的NMR分析，以及具有多个插入的双链的CD数据，为我们先前基于分子建模提出的拉链状链间堆积基序提供了进一步的证据。包含一到七个I-或Y碱基对的双链体的UV-热熔实验表明，在I的情况下T（m）恒定增加，而Y的常数减小。I / Y混合碱基对导致同系之间的稳定性。插入交替的I /碱基对或Y /碱基对会大大降低双链体的热稳定性。在这种情况下，还研究了I-或Y残基在双链体任一条链上的不对称分布。在两端均具有三个天然碱基对且在中心的I对的50％仍很容易形成双链体，而末端平整的I对则具有非特异性聚集的双链体。II碱基对末端带有一个自然突出端的双链体可以聚集或形成有序的

  DOI：

  10.1002/chem.200400858
• 作为产物：
  描述：

  2,3,5-三苄氧基-D-核糖酸-1,4-内酯 在 吡啶 、 三乙基硅烷 、 正丁基锂 、 三氟化硼乙醚 、 三溴化硼 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 (2S,3S,3aS,9aR)-2-Biphenyl-4-yl-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-3-ol
  参考文献：
  名称：

  联吡啶-和联苯-DNA：基于链间芳族堆积的识别基序。

  摘要：

  描述了含有两个芳香族，无氢键的核碱基取代基联苯（I）和联吡啶基（Y）的C-核苷的合成及其掺入寡核苷酸。然后通过紫外熔解曲线分析，凝胶迁移率测定，CD和NMR光谱研究了它们在不同顺序排列中的同种和异种识别特性。中心含有一个联苯对的十二聚体双链的NMR分析，以及具有多个插入的双链的CD数据，为我们先前基于分子建模提出的拉链状链间堆积基序提供了进一步的证据。包含一到七个I-或Y碱基对的双链体的UV-热熔实验表明，在I的情况下T（m）恒定增加，而Y的常数减小。I / Y混合碱基对导致同系之间的稳定性。插入交替的I /碱基对或Y /碱基对会大大降低双链体的热稳定性。在这种情况下，还研究了I-或Y残基在双链体任一条链上的不对称分布。在两端均具有三个天然碱基对且在中心的I对的50％仍很容易形成双链体，而末端平整的I对则具有非特异性聚集的双链体。II碱基对末端带有一个自然突出端的双链体可以聚集或形成有序的

  DOI：

  10.1002/chem.200400858

文献信息

• RNA duplexes with biphenyl substituents as base replacements are less stable than DNA duplexes
  作者：Christine Brotschi、Christian J. Leumann

  DOI：10.1039/b419278h

  日期：——

  Introduction of a hydrophobic biphenyl-C-nucleotide pair into a 11-mer RNA duplex is associated with a net penalty in the free energy of duplex formation of 2.0 kcal mol(-1) or 10 degrees C in Tm, relative to DNA. These differential stabilities are of relevance with respect to the transcriptional and translational aspects of hydrophobic base-pairs.

  将疏水性联苯-C-核苷酸对引入11-mer RNA双链体与相对于DNA的2.0 kcal mol（-1）或Tm 10°C的双链体形成的自由能中的净罚分相关。这些不同的稳定性与疏水性碱基对的转录和翻译方面有关。