1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-(1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)-2,5,8,11-tetraoxatetradec-13-yn-14-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 1242261-40-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-(1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)-2,5,8,11-tetraoxatetradec-13-yn-14-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• CAS: 1242261-40-0
• 化学式: C₃₉H₅₉F₃N₄O₉Si₂
• 分子量: 841.085
• InChiKey: BSTOWCDMZQJXHD-WIHCDAFUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.04
• 重原子数：
  57.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  144.19
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-(1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)-2,5,8,11-tetraoxatetradec-13-yn-14-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 以100%的产率得到1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-(1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)-2,5,8,11-tetraoxatetradec-13-yn-14-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  DNA光亲和探针的开发，用于分析人类蛋白质组中的8-OxodG结合蛋白。

  摘要：

  寻找DNA修复因子：一项对含有8-oxodG且带有不同光交联部分的DNA探针的比较研究发现，三甘醇-三氟甲基-苯基二氮嗪系统非常适合标记DNA修复因子。该探针用于人类HCT-116核蛋白质组中不同DNA修复因子的基于活性的选择性标记。

  DOI：

  10.1002/cbic.201000244
• 作为产物：
  描述：

  2'-deoxy-3',5'-bis(O-tert-butyldimethylsilyl)-5-iodouridine 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 sodium hydride 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.5h， 生成 1-((2R,4S,5R)-4-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)-5-(1-(4-(3-(trifluoromethyl)-3H-diazirin-3-yl)phenyl)-2,5,8,11-tetraoxatetradec-13-yn-14-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  DNA光亲和探针的开发，用于分析人类蛋白质组中的8-OxodG结合蛋白。

  摘要：

  寻找DNA修复因子：一项对含有8-oxodG且带有不同光交联部分的DNA探针的比较研究发现，三甘醇-三氟甲基-苯基二氮嗪系统非常适合标记DNA修复因子。该探针用于人类HCT-116核蛋白质组中不同DNA修复因子的基于活性的选择性标记。

  DOI：

  10.1002/cbic.201000244