N-(2-(((R)-3-methyl-1-((3aS,4S,6S,7aR)-3a,5,5-trimethylhexahydro-4,6-methanobenzo[d][1,3,2]dioxaborol-2-yl)butyl)amino)-2-oxoethyl)pyrazine-2-carboxamide | 1360140-34-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(2-(((R)-3-methyl-1-((3aS,4S,6S,7aR)-3a,5,5-trimethylhexahydro-4,6-methanobenzo[d][1,3,2]dioxaborol-2-yl)butyl)amino)-2-oxoethyl)pyrazine-2-carboxamide
• 英文别名: N-[2-[[(1R)-3-methyl-1-[(1S,2S,6R,8S)-2,9,9-trimethyl-3,5-dioxa-4-boratricyclo[6.1.1.02,6]decan-4-yl]butyl]amino]-2-oxoethyl]pyrazine-2-carboxamide
• CAS: 1360140-34-6
• 化学式: C₂₂H₃₃BN₄O₄
• 分子量: 428.339
• InChiKey: NYWIXVVKDJECBE-VGZCRSJVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.0
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(2-(((R)-3-methyl-1-((3aS,4S,6S,7aR)-3a,5,5-trimethylhexahydro-4,6-methanobenzo[d][1,3,2]dioxaborol-2-yl)butyl)amino)-2-oxoethyl)pyrazine-2-carboxamide 在 盐酸 、 异丁基硼酸 作用下， 以 甲醇 、 正己烷 、 水 为溶剂， 反应 22.0h， 以73.4%的产率得到(R)-(3-methyl-1-(2-(pyrazine-2-carboxamido)acetamido)butyl)boronic acid
  参考文献：
  名称：

  新型二肽基硼酸蛋白酶体抑制剂作为口服抗癌药用于治疗多发性骨髓瘤的设计，合成，体外和体内评价以及构效关系（SAR）讨论

  摘要：

  设计并合成了一系列新型的20S蛋白酶体二肽基硼酸抑制剂。首次设计R 1位置的脂族基团以充分了解SAR（结构-活性关系）。在筛选的化合物中，新型抑制剂5c抑制CT-L（胰凝乳蛋白酶样）活性，IC 50为8.21 nM，而MM（多发性骨髓瘤）细胞RPMI8226，U266B和ARH77增殖，IC 50为8.99、6.75和9.10 nM。与化合物MLN2238（市售MLN9708的生物活性形式）相比，它们分别显示出相似的体外活性。为了研究口服药物的可用性，化合物5c用酶促IC 50为6.74 nM酯化其前药6a，RPMI8226，U266B和ARH77细胞增殖IC 50分别为2.59、4.32和3.68 nM。此外，前药6a表现出良好的药代动力学特性，口服生物利用度为24.9％，与MLN9708相似（27.8％）。此外，在人ARH77异种移植小鼠模型中，化合物6a显示出良好的微粒体稳定性，并比

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2018.06.020
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl [2-({(1R)-3-methyl-1-[(3aS,4S,6S,7aR)-3a,5,5-trimethylhexahydro-4,6-methano-1,3,2-benzodioxaborol-2-yl]butyl}amino)-2-oxoethyl]carbamate 在 1-羟基苯并三唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 2.17h， 生成 N-(2-(((R)-3-methyl-1-((3aS,4S,6S,7aR)-3a,5,5-trimethylhexahydro-4,6-methanobenzo[d][1,3,2]dioxaborol-2-yl)butyl)amino)-2-oxoethyl)pyrazine-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  新型二肽基硼酸蛋白酶体抑制剂作为口服抗癌药用于治疗多发性骨髓瘤的设计，合成，体外和体内评价以及构效关系（SAR）讨论

  摘要：

  设计并合成了一系列新型的20S蛋白酶体二肽基硼酸抑制剂。首次设计R 1位置的脂族基团以充分了解SAR（结构-活性关系）。在筛选的化合物中，新型抑制剂5c抑制CT-L（胰凝乳蛋白酶样）活性，IC 50为8.21 nM，而MM（多发性骨髓瘤）细胞RPMI8226，U266B和ARH77增殖，IC 50为8.99、6.75和9.10 nM。与化合物MLN2238（市售MLN9708的生物活性形式）相比，它们分别显示出相似的体外活性。为了研究口服药物的可用性，化合物5c用酶促IC 50为6.74 nM酯化其前药6a，RPMI8226，U266B和ARH77细胞增殖IC 50分别为2.59、4.32和3.68 nM。此外，前药6a表现出良好的药代动力学特性，口服生物利用度为24.9％，与MLN9708相似（27.8％）。此外，在人ARH77异种移植小鼠模型中，化合物6a显示出良好的微粒体稳定性，并比

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2018.06.020

文献信息

• Chemical and Biological Evaluation of Dipeptidyl Boronic Acid Proteasome Inhibitors for Use in Prodrugs and Pro-Soft Drugs Targeting Solid Tumors
  作者：Lawrence J. Milo、Jack H. Lai、Wengen Wu、Yuxin Liu、Hlaing Maw、Youhua Li、Zhiping Jin、Ying Shu、Sarah E. Poplawski、Yong Wu、David G. Sanford、James L. Sudmeier、William W. Bachovchin

  DOI：10.1021/jm200460q

  日期：2011.7.14

  Bortezomib, a dipeptidyl boronic acid and potent inhibitor of the 26S proteasome, is remarkably effective against multiple myeloma (MM) but not against solid tumors. Dose-limiting adverse effects from "on target" inhibition of the proteasome in normal cells and tissues appear to be a key obstacle. Achieving efficacy against solid tumors therefore is likely to require making the inhibitor more selective for tumor tissue over normal tissues. The simplest strategy that might provide such tissue specificity would be to employ a tumor specific protease to release an inhibitor from a larger, noninhibitory structure. However, such release would necessarily generate an inhibitor with a free N-terminal amino group, raising a key question: Can short peptide boronic acids with N-terminal amino groups have the requisite properties to serve as warheads in prodrugs? Here we show that dipeptides of boroLeu, the smallest plausible candidates for the task, can indeed be sufficiently potent, cell-penetrating, cytotoxic, and stable to degradation by cellular peptidases to serve in this capacity.
• Design, synthesis, in vitro and in vivo evaluation, and structure-activity relationship (SAR) discussion of novel dipeptidyl boronic acid proteasome inhibitors as orally available anti-cancer agents for the treatment of multiple myeloma and mechanism studies
  作者：Meng Lei、Huayun Feng、Enhe Bai、Hui Zhou、Jia Wang、Jingmiao Shi、Xueyuan Wang、Shihe Hu、Zhaogang Liu、Yongqiang Zhu

  DOI：10.1016/j.bmc.2018.06.020

  日期：2018.8

  A series of novel dipeptidyl boronic acid inhibitors of 20S proteasome were designed and synthesized. Aliphatic groups at R1 position were designed for the first time to fully understand the SAR (structure–activity relationship). Among the screened compounds, novel inhibitor 5c inhibited the CT-L (chymotrypsin-like) activity with IC50 of 8.21 nM and the MM (multiple myeloma) cells RPMI8226, U266B and

  设计并合成了一系列新型的20S蛋白酶体二肽基硼酸抑制剂。首次设计R 1位置的脂族基团以充分了解SAR（结构-活性关系）。在筛选的化合物中，新型抑制剂5c抑制CT-L（胰凝乳蛋白酶样）活性，IC 50为8.21 nM，而MM（多发性骨髓瘤）细胞RPMI8226，U266B和ARH77增殖，IC 50为8.99、6.75和9.10 nM。与化合物MLN2238（市售MLN9708的生物活性形式）相比，它们分别显示出相似的体外活性。为了研究口服药物的可用性，化合物5c用酶促IC 50为6.74 nM酯化其前药6a，RPMI8226，U266B和ARH77细胞增殖IC 50分别为2.59、4.32和3.68 nM。此外，前药6a表现出良好的药代动力学特性，口服生物利用度为24.9％，与MLN9708相似（27.8％）。此外，在人ARH77异种移植小鼠模型中，化合物6a显示出良好的微粒体稳定性，并比