(R)-1,4-anhydro-2-O-(2,4-dimethoxybenzoyl)-3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-4-sulfinyl-D-ribitol | 291758-13-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (R)-1,4-anhydro-2-O-(2,4-dimethoxybenzoyl)-3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-4-sulfinyl-D-ribitol
• CAS: 291758-13-9
• 化学式: C₂₆H₄₄O₈SSi₂
• 分子量: 572.868
• InChiKey: UYCAHTZWRNMZKI-XLYBNKOLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.32
• 重原子数：
  37.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  89.52
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-1,4-anhydro-2-O-(2,4-dimethoxybenzoyl)-3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-4-sulfinyl-D-ribitol 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 三乙胺 、 甲胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 12.25h， 生成 N⁴-benzoyl-1-[3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-4-thio-β-D-ribofuranosyl]cytosine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and structural elucidation of 1-(3-C-ethynyl-4-thio-β-D-ribofuranosyl)cytosine (4′-thioECyd)

  摘要：

  1,4-脱水-4-硫代-D-核糖醇的实用合成 (5) 描述了1,4-二溴-1,4-二脱氧-2,3,5-三-O-苄基-L-来木糖醇(12)。该方法将我们之前从 D-核糖开始的十一个步骤减少了三个步骤。 1,4-脱水-2-O-(2,4-二甲氧基苯甲酰基)-3,5-O-(1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷-1,3-二基)-4-亚磺酰基-的Pummerer反应D-核糖醇 (6) 在 N4-苯甲酰胞嘧啶存在下大规模提供 4α-硫胞苷衍生物 7b。从所得的 7b 开始，1-(3-C-乙炔基-4-硫代-β-D-呋喃核糖基)胞嘧啶 (4; 4-thioECyd)，其中 4-oxo 同系物 ECyd (3) 是我们课题组开发的一种新型强效抗肿瘤核苷，是通过精心的保护和脱保护程序，以及与三甲基甲硅烷基乙酰化铈的连续反应合成的。本文介绍了 4-thioECyd (4) 和 ECyd (3) 的 X 射线晶体结构。尽管在 C1-2-S4-2 和 C4-2-S4-2 以及 C4-2-S4-S4-C1-2 中观察到键长和角度的显着差异，但每种化合物的整体结构，包括糖褶皱模式和糖基键周围的顺式/反式构象，都是相似的。

  DOI：

  10.1039/b204993g
• 作为产物：
  描述：

  1,4-anhydro-2,3,5-tri-O-benzyl-4-thio-D-ribitol 在 吡啶 、 三氯化硼 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 25.5h， 生成 (R)-1,4-anhydro-2-O-(2,4-dimethoxybenzoyl)-3,5-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-4-sulfinyl-D-ribitol
  参考文献：
  名称：

  通过 Pummerer 反应立体选择性合成 4'-β-硫核糖核苷†

  摘要：

  描述了使用 Pummerer 反应作为关键步骤的 4'-β-硫代核糖核苷 14、15、27 和 30 的有效立体选择性合成。1,4-脱水-2-O-(2,4-二甲氧基苯甲酰基)-3,5-O-(1,1,3,3-四异丙基二硅氧烷-1,3-二基)-4-亚磺酰基-的Pummerer反应d-核糖醇 (R-10:S-10 = 2.7:1) 在甲硅烷基化尿嘧啶的存在下以 66% 的收率提供所需的 4'-硫尿苷衍生物 11 的 β-端基异构体，而没有形成其 α-端基异构体。与 R-10 的反应以 87% 的产率得到 11，而与 S-10 的反应导致所需产物 11 的产量减少 27%，同时 3,6-O-(1,1,3 ,3-四异丙基二硅氧烷-1,3-二基)-3-羟基-2-羟基甲基噻吩(12)。观察到的 R-10 和 S-10 反应差异的一个可能解释是反应通过 E2 型途径进行，它更喜欢抗消除。因此，在反应条件下，R-10

  DOI：

  10.1021/ja000541o

文献信息

• Improving RNA Interference in Mammalian Cells by 4‘-Thio-Modified Small Interfering RNA (siRNA):  Effect on siRNA Activity and Nuclease Stability When Used in Combination with 2‘-<i>O</i>-Alkyl Modifications
  作者：Prasad Dande、Thazha P. Prakash、Namir Sioufi、Hans Gaus、Russell Jarres、Andreas Berdeja、Eric E. Swayze、Richard H. Griffey、Balkrishen Bhat

  DOI：10.1021/jm050822c

  日期：2006.3.1

  A systematic structure-activity relationship study of 4'-thioribose containing small interfering RNAs (siRNAs) has led to the identification of highly potent and stable antisense constructs. To enable this optimization effort for both in vitro and in vivo applications, we have significantly improved the yields of 4'-thioribonucleosides by using a chirally pure (R)-sulfoxide precursor. siRNA duplexes containing strategically placed regions of 4'-thio-RNA were synthesized and evaluated for RNA interference activity and plasma stability. Stretches of 4'-thio-RNA were well tolerated in both the antisense and sense strands. However, optimization of both the number and placement of X-thioribonucleosides was necessary for maximal potency. These optimized siRNAs were generally equipotent or superior to native siRNAs and exhibited increased thermal and plasma stability. Furthermore, significant improvements in siRNA activity and plasma stability were achieved by judicious combination of 4'-thioribose with 2'-O-methyl and 2'-O-methoxyethyl modifications. These optimized 4'-thio-siRNAs may be valuable for developing stable siRNAs for therapeutic applications.