2-amino-6-chloro-9-(β-D-2’-deoxyribofuranosyl)-7-[(S)-1-(4-iodo-5-methoxy-2-nitrophenyl)-2,2-dimethylpropyloxy]methyl-7-deazapurine | 1427311-58-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2-amino-6-chloro-9-(β-D-2’-deoxyribofuranosyl)-7-[(S)-1-(4-iodo-5-methoxy-2-nitrophenyl)-2,2-dimethylpropyloxy]methyl-7-deazapurine
• CAS: 1427311-58-7
• 化学式: C₂₄H₂₉ClIN₅O₇
• 分子量: 661.881
• InChiKey: IVAPDSRCXLWSSG-ZCDKGFTFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.13
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  168.02
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-amino-6-chloro-9-(β-D-2’-deoxyribofuranosyl)-7-[(S)-1-(4-iodo-5-methoxy-2-nitrophenyl)-2,2-dimethylpropyloxy]methyl-7-deazapurine 在 2-吡啶甲醛肟 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三乙胺 、 四甲基胍 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 7-{(S)-1-[5-methoxy-4-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-2-nitrophenyl]-2,2-dimethylpropyloxy}methyl-7-deaza-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  [EN] 5-METHOXY. 3'-OH UNBLOCKED, FAST PHOTOCLEAVABLE TERMINATING NUCLEOTIDES AND METHODS FOR NUCLEIC ACID SEQUENCING
  [FR] 5-MÉTHOXY-NUCLÉOTIDES À TERMINAISON RAPIDEMENT PHOTOCLIVABLE NON BLOQUÉS EN 3'OH ET PROCÉDÉS DE SÉQUENÇAGE D'ACIDE NUCLÉIQUE

  摘要：

  本发明通常涉及用于DNA和RNA测序和分析方法及系统中的3'-OH未阻断核苷酸和核苷的标记和未标记的5-甲氧基取代硝基苯基光致裂解终止基团。这些化合物可用作可逆终止剂，因为它们表现出快速的核苷酸结合动力学、单碱基终止、高核苷酸选择性和快速的终止基团裂解，导致自然发生的核苷酸。

  公开号：

  WO2013040257A1
• 作为产物：
  描述：

  9-[β-D-3’,5’-O-bis-(tert-butyldimethylsilyl)-2’-deoxyribofuranosyl]-2-(tert-butyldimethylsilyl)amino-6-chloro-7-iodo-7-deazapurine 在 甲醇 、 4-二甲氨基吡啶 、 锂硼氢 、 cis-dichlorobis(benzonitrile)palladium(II) 、 四丁基氟化铵 、 甲基磺酰氯 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 37.92h， 生成 2-amino-6-chloro-9-(β-D-2’-deoxyribofuranosyl)-7-[(S)-1-(4-iodo-5-methoxy-2-nitrophenyl)-2,2-dimethylpropyloxy]methyl-7-deazapurine
  参考文献：
  名称：

  [EN] 5-METHOXY. 3'-OH UNBLOCKED, FAST PHOTOCLEAVABLE TERMINATING NUCLEOTIDES AND METHODS FOR NUCLEIC ACID SEQUENCING
  [FR] 5-MÉTHOXY-NUCLÉOTIDES À TERMINAISON RAPIDEMENT PHOTOCLIVABLE NON BLOQUÉS EN 3'OH ET PROCÉDÉS DE SÉQUENÇAGE D'ACIDE NUCLÉIQUE

  摘要：

  本发明通常涉及用于DNA和RNA测序和分析方法及系统中的3'-OH未阻断核苷酸和核苷的标记和未标记的5-甲氧基取代硝基苯基光致裂解终止基团。这些化合物可用作可逆终止剂，因为它们表现出快速的核苷酸结合动力学、单碱基终止、高核苷酸选择性和快速的终止基团裂解，导致自然发生的核苷酸。

  公开号：

  WO2013040257A1