methyl 8-[5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-2-[[5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-3-(8-methoxy-8-oxooctyl)-4-methyl-1H-pyrrol-2-yl]methyl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl]octanoate | 192191-87-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 四吡咯及其衍生物
• 英文名称: methyl 8-[5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-2-[[5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-3-(8-methoxy-8-oxooctyl)-4-methyl-1H-pyrrol-2-yl]methyl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl]octanoate
• CAS: 192191-87-0
• 化学式: C₄₅H₆₄N₄O₆
• 分子量: 757.026
• InChiKey: HIDCTNXLAPYENP-MTBITLQYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.6
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  142
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 8-[5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-2-[[5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-3-(8-methoxy-8-oxooctyl)-4-methyl-1H-pyrrol-2-yl]methyl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl]octanoate 在 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 3.0h， 以23%的产率得到8-[2-[[3-(7-carboxyheptyl)-5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-4-methyl-1H-pyrrol-2-yl]methyl]-5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl]octanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Conformational analysis of symmetric bilirubin analogues with varying length alkanoic acids. Enantioselectivity by human serum albumin

  摘要：

  对称的美索胆红素-XIIIα类似物，其丙酸基团缩短至醋酸或延长至十一酸，显示出在pH 7.5缓冲的水溶液中（含1-5%二甲基亚硫酰胺（DMSO）共溶剂）在存在人血清白蛋白（HSA）时的诱导圆二色性（ICD）。CD光谱显示出双标志的Cotton效应，具体为： ωÎεmax434 = +87，ωÎεmax389 = -54（醋酸），ωÎεmax436 = +37，ωÎεmax388 = -42（丙酸），ωÎεmax420 = -15，ωÎεmax370 = +8（丁酸），[ωÎεmax433 = -97，ωÎεmax388 = +89（30%水-混合DMSO）]，ωÎεmax449 = +6，ωÎεmax397 = -46（戊酸），ωÎεmax440 = +57，ωÎεmax392 = -96（癸酸），ωÎεmax440 = +15，ωÎεmax393 = -21（辛酸）以及ωÎεmax448 = +18，ωÎεmax385 = -31（十一酸）。这些值源于色素体构象（即激子耦合）和蛋白质的手性选择性（即对特定胆红素对映体的偏好）。醋酸到丁酸、辛酸和十一酸复合物的UV-VIS光谱形状相似，除了主带外还有一个肩带，类似于胆红素-IXα与HSA复合物的特征，表明所有复合物具有类似的折叠构象。而戊酸和癸酸复合物的光谱则更对称且红移，暗示出更扩展的构象。在这两系列中观察到的实验CD值被解释为蛋白质的不同手性选择性，其中右手的醋酸和癸酸对映体最适合蛋白质结合位点（ωωε约为150），而蛋白质对右手的丙酸对映体的偏好较低（ωωε约为80），对右手的戊酸、辛酸和十一酸对映体的偏好更低（ωωε约为50），但对左手的丁酸对映体的偏好则是最低的（ωωε约为24）。 在水缓冲液中复合（与未复合的色素在甲醇中比较）各复合物在UV-VIS光谱上观察到的差异， 即谱移（醋酸到丁酸和十一酸为7-11 nm，戊酸为12 nm，癸酸和辛酸为16-18 nm）和形状（戊酸和癸酸由两个跃迁减少为一个——而其他则没有）反映了蛋白质诱导的色素构象变化。这些变化在癸酸和辛酸的类似物中尤为明显。综合来看，本研究结果表明，C8和C12的烷基酸链长度对于确定色素构象以及蛋白质的手性选择性（通过特定的色素-蛋白质相互作用）至关重要，并且与先前的建议一致，即这些相互作用可能涉及至少一个盐桥和氢键。 还研究了诸如在溶液中作为载体使用的DMSO百分比和缓冲液性质等其他参数对每个红素-HSA复合物ICD的影响。令人惊讶的是，DMSO的含量从3%增加到30%时，观察到的丁酸和（在较小程度上）丙酸、十一酸复合物的CD发生了剧烈变化。这被解释为蛋白质三级结构的选择性变化。

  DOI：

  10.1039/a604897h
• 作为产物：
  描述：

  甲基8-氯-8-氧代辛酸 在 sodium tetrahydroborate 、 三氯化铝 、 甲酸 、 三氟化硼乙醚 、 四氯苯醌 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 异丙醇 为溶剂， 反应 53.0h， 生成 methyl 8-[5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-2-[[5-[(Z)-(3-ethyl-4-methyl-5-oxopyrrol-2-ylidene)methyl]-3-(8-methoxy-8-oxooctyl)-4-methyl-1H-pyrrol-2-yl]methyl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl]octanoate
  参考文献：
  名称：

  Conformational analysis of symmetric bilirubin analogues with varying length alkanoic acids. Enantioselectivity by human serum albumin

  摘要：

  对称的美索胆红素-XIIIα类似物，其丙酸基团缩短至醋酸或延长至十一酸，显示出在pH 7.5缓冲的水溶液中（含1-5%二甲基亚硫酰胺（DMSO）共溶剂）在存在人血清白蛋白（HSA）时的诱导圆二色性（ICD）。CD光谱显示出双标志的Cotton效应，具体为： ωÎεmax434 = +87，ωÎεmax389 = -54（醋酸），ωÎεmax436 = +37，ωÎεmax388 = -42（丙酸），ωÎεmax420 = -15，ωÎεmax370 = +8（丁酸），[ωÎεmax433 = -97，ωÎεmax388 = +89（30%水-混合DMSO）]，ωÎεmax449 = +6，ωÎεmax397 = -46（戊酸），ωÎεmax440 = +57，ωÎεmax392 = -96（癸酸），ωÎεmax440 = +15，ωÎεmax393 = -21（辛酸）以及ωÎεmax448 = +18，ωÎεmax385 = -31（十一酸）。这些值源于色素体构象（即激子耦合）和蛋白质的手性选择性（即对特定胆红素对映体的偏好）。醋酸到丁酸、辛酸和十一酸复合物的UV-VIS光谱形状相似，除了主带外还有一个肩带，类似于胆红素-IXα与HSA复合物的特征，表明所有复合物具有类似的折叠构象。而戊酸和癸酸复合物的光谱则更对称且红移，暗示出更扩展的构象。在这两系列中观察到的实验CD值被解释为蛋白质的不同手性选择性，其中右手的醋酸和癸酸对映体最适合蛋白质结合位点（ωωε约为150），而蛋白质对右手的丙酸对映体的偏好较低（ωωε约为80），对右手的戊酸、辛酸和十一酸对映体的偏好更低（ωωε约为50），但对左手的丁酸对映体的偏好则是最低的（ωωε约为24）。 在水缓冲液中复合（与未复合的色素在甲醇中比较）各复合物在UV-VIS光谱上观察到的差异， 即谱移（醋酸到丁酸和十一酸为7-11 nm，戊酸为12 nm，癸酸和辛酸为16-18 nm）和形状（戊酸和癸酸由两个跃迁减少为一个——而其他则没有）反映了蛋白质诱导的色素构象变化。这些变化在癸酸和辛酸的类似物中尤为明显。综合来看，本研究结果表明，C8和C12的烷基酸链长度对于确定色素构象以及蛋白质的手性选择性（通过特定的色素-蛋白质相互作用）至关重要，并且与先前的建议一致，即这些相互作用可能涉及至少一个盐桥和氢键。 还研究了诸如在溶液中作为载体使用的DMSO百分比和缓冲液性质等其他参数对每个红素-HSA复合物ICD的影响。令人惊讶的是，DMSO的含量从3%增加到30%时，观察到的丁酸和（在较小程度上）丙酸、十一酸复合物的CD发生了剧烈变化。这被解释为蛋白质三级结构的选择性变化。

  DOI：

  10.1039/a604897h