4-(1H-Indol-3-yl)-6-oxo-2-prop-2-ynylsulfanyl-1,6-dihydro-pyrimidine-5-carbonitrile | 124362-63-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 4-(1H-Indol-3-yl)-6-oxo-2-prop-2-ynylsulfanyl-1,6-dihydro-pyrimidine-5-carbonitrile
• 英文别名: 6-(1H-indol-3-yl)-4-oxo-2-prop-2-ynylsulfanyl-1H-pyrimidine-5-carbonitrile
• CAS: 124362-63-6
• 化学式: C₁₆H₁₀N₄OS
• 分子量: 306.348
• InChiKey: OHKSWCXDDLSUNS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.52
• 重原子数：
  22.0
• 可旋转键数：
  3.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.06
• 拓扑面积：
  85.33
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(1H-Indol-3-yl)-6-oxo-2-prop-2-ynylsulfanyl-1,6-dihydro-pyrimidine-5-carbonitrile 在 三氯氧磷 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 4-(1H-indol-3-yl)-6-((1-methyl-1H-tetrazol-5-yl)thio)-2-(prop-2-yn-1-ylthio)pyrimidine-5-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  针对 DCN1-UBE2M 相互作用的强效 5-Cyano-6-phenyl-pyrimidin-based 衍生物。

  摘要：

  Cullin-RING E3 连接酶 (CRL) 的 Neddylation 调节大约 20% 的细胞蛋白的稳态。cullin neddylation 1 (DCN1) 缺陷作为一种 co-E3 连接酶，与 UBE2M 相互作用以增强 CRL 的激活，这种相互作用正在成为人类疾病的治疗靶点。在这里，我们提出了一系列针对 DCN1-UBE2M 相互作用的基于嘧啶的小分子抑制剂。在找到 IC50 = 1.2 μM 的新型抑制剂 DC-1 后，我们进行了一系列化学优化，最终发现了一种含有 5-氰基-6-苯基嘧啶基抑制剂 DC-2 (IC50 = 15) 的强效噻唑纳米）。接下来，使用蛋白质和细胞热位移分析、免疫共沉淀、分子对接和位点特异性突变实验，我们进一步证明 DC-2 在分子和细胞水平上特异性抑制 UBE2M 和 DCN1 的相互作用，导致 cullin3 的 neddylation 减少和其底物

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b00003
• 作为产物：
  描述：

  3-吲哚甲醛 在 potassium carbonate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 为溶剂， 反应 10.0h， 生成 4-(1H-Indol-3-yl)-6-oxo-2-prop-2-ynylsulfanyl-1,6-dihydro-pyrimidine-5-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  针对 DCN1-UBE2M 相互作用的强效 5-Cyano-6-phenyl-pyrimidin-based 衍生物。

  摘要：

  Cullin-RING E3 连接酶 (CRL) 的 Neddylation 调节大约 20% 的细胞蛋白的稳态。cullin neddylation 1 (DCN1) 缺陷作为一种 co-E3 连接酶，与 UBE2M 相互作用以增强 CRL 的激活，这种相互作用正在成为人类疾病的治疗靶点。在这里，我们提出了一系列针对 DCN1-UBE2M 相互作用的基于嘧啶的小分子抑制剂。在找到 IC50 = 1.2 μM 的新型抑制剂 DC-1 后，我们进行了一系列化学优化，最终发现了一种含有 5-氰基-6-苯基嘧啶基抑制剂 DC-2 (IC50 = 15) 的强效噻唑纳米）。接下来，使用蛋白质和细胞热位移分析、免疫共沉淀、分子对接和位点特异性突变实验，我们进一步证明 DC-2 在分子和细胞水平上特异性抑制 UBE2M 和 DCN1 的相互作用，导致 cullin3 的 neddylation 减少和其底物

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b00003

文献信息

• Ram, Indian Journal of Chemistry - Section B Organic and Medicinal Chemistry, 1989, vol. 28, # 2, p. 159 - 162
  作者：Ram

  DOI：——

  日期：——
• RAM, VISHNU J., INDIAN J. CHEM. B , 28,(1989) N, C. 159-162
  作者：RAM, VISHNU J.

  DOI：——

  日期：——