基于
配体的NMR技术研究蛋白质-
配体之间的相互作用是药物设计中的有效工具。饱和转移差异(STD)NMR光谱学是最通用的技术之一,它可以筛选片段文库并提供有关结合模式的结构信息。最近,研究表明,多频STD NMR方法(差异表位作图(D
EEP)-STD NMR)可以提供有关结合口袋中小
配体取向的其他信息。在这里,该方法扩展到了所谓的DEE
P-STD NMR指纹技术,以探索霍乱毒素亚基B(CTB)的结合亚位。为此,提出了一组新的
配体的合成,通过弱亲和色谱(WAC)和NMR光谱对它们与CTB的相互作用进行了深入研究。值得注意的是,DEE
P-STD NMR指纹图谱和汉密尔顿副本交换分子动力学的结合已被证明是探索多位点结合口袋的几何形状,柔性和配位体占据的极佳方法。在CTB的特殊情况下,它可以揭示与GM1结合袋相邻的迄今未知的结合亚位点的存在,为抑制这种相关毒素的新型引物的设计铺平了道路。