I 类组蛋白脱乙酰酶 (H
DAC) 酶 1、2 和 3 将染色质组织为七种不同的多蛋白辅阻遏物复合物中的催化亚基,并且是既定的药物靶标。我们报告了基于苯甲酰胺的 Von Hippel–Lindau (VHL) E3 连接酶蛋白
水解靶向嵌合体 (PROTAC) 的优化研究,并首次描述了由这些降解剂引起的转录组扰动。通过修饰接头和 VHL
配体,我们鉴定了具有亚微摩尔 DC 50的 PROTAC 7、9和22HCT116 细胞中 H
DAC1 和/或 H
DAC3 的值。观察到 H
DAC3 的钩状效应,可以通过修改 VHL
配体与接头的连接位置来消除这种效应。更有效的 H
DAC1/2 降解剂与更大的总差异表达
基因和增强的 HCT116 细胞凋亡相关。我们证明 PROTAC 对 H
DAC1/2 的降解与增强的全局
基因表达和细胞凋亡相关,这对于开发更有效且副作用更少的 H
DAC 疗法非常重要。