N³,2',3'-O-tribenzoyluridine | 55798-09-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N³,2',3'-O-tribenzoyluridine
• 英文别名: 2',3'-O,N³-tribenzoyluridine；3-N-benzoyl-2',3'-di-O-benzoyl uridine；[(2R,3R,4R,5R)-5-(3-benzoyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-benzoyloxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] benzoate
• CAS: 55798-09-9
• 化学式: C₃₀H₂₄N₂O₉
• 分子量: 556.529
• InChiKey: WMNMPVYTSMJHGV-LYPBTDJXSA-N

物化性质

• 熔点：
  182-183 °C
• 沸点：
  722.5±70.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.48±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  140
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N³,2',3'-O-tribenzoyluridine 在 1H-1,2,4-三唑 、 三乙胺 、 三氯化磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 17.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  3'-硫尿苷-（3'→5'）-尿苷的制备及裂解反应

  摘要：

  3'-硫代水基-（3'→5'）-尿苷[（Us）pU] 3是通过将二硫化物 14和5'-H-膦酸酯18，然后除去保护基。（Us）pU 3易于在0.05 mol dm -3中裂解 甘氨酸钠 缓冲 （pH 10.06）在50°C的情况下，首先得到 尿苷 4和3'-硫尿苷2'，3'-环硫代磷酸酯21 ; 在冰醋酸在30°C时，它基本上以相同的方式迅速裂解。在相同的碱性和酸性反应条件下，将（Us）pU 3的行为与尿嘧啶-（3'→5'）-尿苷（UpU）1a的行为进行了比较。（Us）pU 3和3'-硫尿苷2'，3'-环硫代磷酸酯21均为核糖核酸酶A的底物；（Us）pU 3是Crotalus adamanteus蛇毒磷酸二酯酶的底物，而不是小牛脾脏磷酸二酯酶的底物。

  DOI：

  10.1039/b002155p
• 作为产物：
  描述：

  3-N-2',3'-O-tribenzoyl-5'-O-triphenylmethyluridine 在 水 作用下， 以 溶剂黄146 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 N³,2',3'-O-tribenzoyluridine
  参考文献：
  名称：

  3'-硫尿苷-（3'→5'）-尿苷的制备及裂解反应

  摘要：

  3'-硫代水基-（3'→5'）-尿苷[（Us）pU] 3是通过将二硫化物 14和5'-H-膦酸酯18，然后除去保护基。（Us）pU 3易于在0.05 mol dm -3中裂解 甘氨酸钠 缓冲 （pH 10.06）在50°C的情况下，首先得到 尿苷 4和3'-硫尿苷2'，3'-环硫代磷酸酯21 ; 在冰醋酸在30°C时，它基本上以相同的方式迅速裂解。在相同的碱性和酸性反应条件下，将（Us）pU 3的行为与尿嘧啶-（3'→5'）-尿苷（UpU）1a的行为进行了比较。（Us）pU 3和3'-硫尿苷2'，3'-环硫代磷酸酯21均为核糖核酸酶A的底物；（Us）pU 3是Crotalus adamanteus蛇毒磷酸二酯酶的底物，而不是小牛脾脏磷酸二酯酶的底物。

  DOI：

  10.1039/b002155p

文献信息

• Novel Synthetic Approach to Multibenzoylated Nucleosides
  作者：Xue‐Feng Zhu、A. Ian Scott

  DOI：10.1080/00397910801916280

  日期：2008.4

  Abstract An improved and highly efficient synthetic approach to multibenzoylated nucleosides bearing free 5′‐hydroxyl groups is described here. By employing t-butyldimethylsilyl (TBDMS) rather than the more commonly used dimethoxytrityl (DMTr) as a temporary 5′‐OH protecting group of the starting nucleoside, this methodology provides the expected products in nearly quantitative yields, thereby substantially

  摘要 这里描述了一种改进的、高效的带有游离 5'-羟基的多苯甲酰化核苷的合成方法。通过使用叔丁基二甲基甲硅烷基 (TBDMS) 而不是更常用的二甲氧基三苯甲基 (DMTr) 作为起始核苷的临时 5'-OH 保护基团，该方法以接近定量的产率提供了预期的产品，从而大大降低了成本和工作量的合成。
• AN IMPROVED SYNTHESIS OF THE DINUCLEOTIDES pdCpA AND pdCpdA
  作者：Xue-Feng Zhu、A. Ian Scott

  DOI：10.1081/ncn-100002081

  日期：2001.2.28

  preparation of the dinucleotide hybrid 5'-O-phosphoryl-2'-deoxycytidylyl-(3'--> 5')adenosine (pdCpA) 7. This simple and concise synthesis involves the successive coupling of 2-cyanoethyl N, N, N', N'-tetra- isopropylphosphorodiamidite with 4-N-benzoyl-5'-O-(4, 4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxy-cytidine 1 and 6-N,6-N,2'-O,3'-O-tetrabenzoyladenosine 2 as the key step. Some dinucleotide derivatives bearing

  为制备二核苷酸杂合体5'-O-磷酰基-2'-脱氧胞嘧啶-（3'-> 5'）腺苷（pdCpA）7开发了一条改进的途径。这种简单而简明的合成方法涉及2的连续偶联-氰基乙基N，N，N'，N'-四异丙基亚磷酰胺基与4-N-苯甲酰基-5'-O-（4，4'-二甲氧基三苯甲基）-2'-脱氧胞苷1和6-N，6- N，2'-O，3'-O-四苯甲酰腺苷2是关键步骤。还合成了一些带有不同保护基的二核苷酸衍生物，并详细研究了选择性脱保护条件。该方法在合成总DNA二核苷酸pdCpdA 17和总RNA二核苷酸21中的应用进一步证明了该方法的实用性和效率。
• A Novel Galactosyltransferase Inhibitor with Diamino Sugar as a Pyrophosphate Mimic
  作者：Nobuyuki Mitsuhashi、Hideya Yuasa

  DOI：10.1002/ejoc.200801285

  日期：2009.4

  4-diamino sugars and uridine have been synthesized as galactosyltransferase inhibitors. The relationship between inhibitory activity and the chelation abilility of the hinge-like diamino sugar towards a metal ion was studied by NMR spectroscopy. One of the conjugates exhibited a moderate inhibition that ranks between those of UDP and UMP probably through the chelation of the hinge-like diamino sugar to MnII

  已经合成了 2,4-二氨基糖和尿苷的结合物作为半乳糖基转移酶抑制剂。通过核磁共振光谱研究了铰链状二氨基糖对金属离子的抑制活性和螯合能力之间的关系。其中一种缀合物表现出中等抑制作用，其作用介于 UDP 和 UMP 之间，可能是通过将铰链状二氨基糖螯合到 MnII 来实现的。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2009)
• Formation of Interribonucleoside Phosphate Bond by the Use of Reagent Formed by the Reaction of 2-Chlorophenyl Phosphorodichloridate with 5-Nitrobenzotriazole and Preparation of Anticodon Triplet of Yeast tRNA^Lys
  作者：Hiroshi Seki、Oyo Mitsunobu

  DOI：10.1246/cl.1987.775

  日期：1987.5.5

  The reagent formed by the reaction of 2-chlorophenyl phosphorodichloridate with an equimolar amount of 5-nitrobenzotriazole was treated with protected ribonucleosides having free 3′-OH, followed by protected ribonucleosides having free 5′-OH in pyridine for 8 h (the second step), the corresponding dinucleoside phosphates being obtained in 55–84% yields. When the second step was carried out in the presence of 2,6-lutidine, the yields were increased to 80–90% within 2h. By this procedure, the anticodon triplet of yeast tRNALys was prepared in 71% yield.

  由2-氯苯基磷酸二氯酯与等摩尔量的5-硝基苯并三唑反应生成的试剂，经过处理带有游离3′-OH的保护核糖核苷，然后再处理带有游离5′-OH的保护核糖核苷，在吡啶中反应8小时（第二步），获得相应的二核苷酸磷酸盐，产率为55–84%。当第二步在2,6-路丁啶存在下进行时，产率在2小时内提高至80–90%。通过此步骤，酵母tRNALys的反密码子三联体以71%的产率制备成功。
• 3′- Thiouridylyl - (3′→5′) - uridine
  作者：Xiaohai Liu、Colin B. Reese

  DOI：10.1016/0040-4039(95)02281-3

  日期：1996.2

  3′-Thiouridylyl-(3′→5′)-uridine 3 undergoes base-catalysed hydrolysis more rapidly than UpU 1a; it also undergoes cleavage more rapidly than UpU in glacial acetic acid solution, but shows much less (if any) tendency to isomerize.

  3'-硫代水基-（3'→5'）-尿苷3比UpU 1a更快地进行碱催化水解；它在冰醋酸溶液中的裂解速度也比UpU快，但异构化的趋势要小得多（如果有的话）。