3'-O-tert-butyldiphenylsilyl-5'-hydroxy-5'-C(S)-tosyloxyethyl-thymidine | 494798-47-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 3'-O-tert-butyldiphenylsilyl-5'-hydroxy-5'-C(S)-tosyloxyethyl-thymidine
• 英文别名: 3'-O-tert-butyldiphenylsilyl-5'-C(S)-(2''-tosyloxyethyl)thymidine；3'-O-tert-butyldiphenylsilyl-5'-C(S)-(tosyloxyethyl)thymidine；5′-C(S)-tosyloxyethyl-3′-O-(tert-butyldiphenylsilyl)thymidine；TBDPS(-3)[Tos(-7)]2,6-deoxy-L-lyxHeptf(a)-thymin-1-yl；[(3S)-3-[(2R,3S,5R)-3-[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]-3-hydroxypropyl] 4-methylbenzenesulfonate
• CAS: 494798-47-9
• 化学式: C₃₅H₄₂N₂O₈SSi
• 分子量: 678.879
• InChiKey: SJKAPTMFTXYZHL-GASGPIRDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.54
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  140
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-tert-butyldiphenylsilyl-5'-hydroxy-5'-C(S)-tosyloxyethyl-thymidine 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 、 三甲基乙酰氯 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 13.75h， 生成
  参考文献：
  名称：

  可转换和构象受限的核酸（C2NA）。

  摘要：

  我们介绍可转换和约束核酸（C2NAs）的概念。通过合成立体控制的N-炔丙基二氧杂-1,3,2-氧杂氮杂-膦环烷作为核苷酸间的键合，扭转角α和β可以采用能够增加的规范值（g-，t）当安装在环部分中时，DNA双链体稳定性或非典型（g +，t）组可稳定发夹结构。通过在六元环的氮原子上附加炔丙基官能团，铜催化的惠斯根环加成反应（CuAAC点击化学反应）可在核酸链上任何位置引入新功能，同时保持几何约束带来的特性和中性的核苷酸间连接。

  DOI：

  10.1039/c9ob01150a
• 作为产物：
  描述：

  1-(2-deoxy-3-O-tert-butyldiphenylsilyl-β-D-erythro-pentadialdo-1,4-furanosyl)-5-methyluracil 在 吡啶 、 bismuth(III) chloride 、 sodium tetrahydroborate 、 zinc(II) iodide 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 为溶剂， 生成 3'-O-tert-butyldiphenylsilyl-5'-hydroxy-5'-C(S)-tosyloxyethyl-thymidine
  参考文献：
  名称：

  核糖二氧杂膦烷限制核酸二核苷酸 (ribo-α,β-D-CNA) 的合成与结构研究

  摘要：

  随着对控制核酸构象以定义活性核糖开关或 siRNA 的兴趣日益浓厚，我们在此展示了我们对核二核苷酸的立体控制合成和构象分析的努力，其中 a 和 β 扭转角被限制在二氧杂磷烷结构（ribo-a ,β-D-CNA)。一个 a,beta-D-CNA TU 二聚体的晶体结构分析证明了新创建的不对称中心的绝对立体化学。NMR 和 CD 分析允许完全分配和确定 a,beta-D-CNA UU 非对映异构体中的扭转角。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201101353

文献信息

• Diastereoselective Synthesis of Conformationally Restricted Dinucleotides Featuring Canonical and Noncanonical α/β Torsion Angle Combinations(α,β-D-CNA)
  作者：Christelle Dupouy、Ingrid Le Clézio、Pierre Lavedan、Heinz Gornitzka、Jean-Marc Escudier、Alain Vigroux

  DOI：10.1002/ejoc.200600593

  日期：2006.12

  The synthesis of the four possible diastereoisomers of α,β-D-CNA 5′-XT (X = A, T, G and C) building units of nucleic acids, in which the α and β torsional angles are stereocontrolled by a dioxaphosphorinane ring structure (D-CNA family) is described. The crystal structure analysis of the (RC5′,SP)-configured α,β-D-CNA TT dimer demonstrates that the α and β torsional angles are restricted to the canonical

  α,β-D-CNA 5'-XT（X = A、T、G 和 C）构建核酸单元的四种可能非对映异构体的合成，其中 α 和 β 扭转角由二氧杂膦环立体控制结构（D-CNA 家族）进行了描述。(RC5',SP) 配置的 α,β-D-CNA TT 二聚体的晶体结构分析表明，α 和 β 扭转角仅限于典型的 gauche(-),trans} 构象，通常在 DNA 双链体中观察到. (© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2006)
• Diastereoselective and Regioselective Synthesis of Conformationally Restricted Thio-dioxa- and Oxo-oxathiaphosphorinane Dinucleotides Featuring Noncanonical α/β Torsion Angle Combinations (α,β-CNAs)
  作者：Ingrid Le Clézio、Alain Vigroux、Jean-Marc Escudier

  DOI：10.1002/ejoc.200601030

  日期：2007.4

  conformationally restricted dinucleotides of either thio-dioxa- or oxo-oxathiaphosphorinane types is described. NMR structural analysis of the newly synthesized building units showed the α and β torsional angles to be constrained to noncanonical values gauche(+), trans} or anticlinal(–), trans}.(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007)

  描述了对立体定义的 5'-C-甲苯磺酰氧基硫代磷酸酯二核苷酸单元的区域选择性环化的控制，以提供硫代-二氧杂-或氧代-氧硫杂磷烷类型的构象限制性二核苷酸。新合成的建筑单元的 NMR 结构分析表明，α 和 β 扭转角被限制为非规范值 gauche(+), trans} 或 anticlinal(–), trans}。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA，69451 魏因海姆，德国，2007）
• Diastereoselective Synthesis of a Conformationally Restricted Dinucleotide with Predefined α and β Torsional Angles for the Construction of α,β-Constrained Nucleic Acids (α,β-CNA)
  作者：Ingrid Le Clézio、Jean-Marc Escudier、Alain Vigroux

  DOI：10.1021/ol027222h

  日期：2003.1.1

  [GRAPHICS]The synthesis of a diastereopure 1,3,2-dioxaphosphorinane linkage in which two, alpha and beta, out of six torsion angles of the natural phosphodiester backbone are constrained with predefined values of ca. +60degrees (g+) and 180degrees (t), respectively, is described. The stable and unstrained six-membered cyclic phosphotriester structure represents the smallest possible ring allowing the conformational locking of the alpha torsion angle at a significant positive value that is typical of many bulged regions of nucleic acids.
• Synthesis and Structural Study of ribo-Dioxaphosphorinane-Constrained Nucleic Acid Dinucleotides (ribo-α,β-D-CNA)
  作者：Marie Maturano、Dan-Andrei Catana、Pierre Lavedan、Nathalie Tarrat、Nathalie Saffon、Corinne Payrastre、Jean-Marc Escudier

  DOI：10.1002/ejoc.201101353

  日期：2012.2

  With increasing interest in the control of the conformations of nucleic acids to define active riboswitch or siRNA, we present herein our efforts towards the stereocontrolled synthesis and conformational analysis of ribodinucleotides in which a and beta torsional angles are constrained within a dioxaphosphorinane structure (ribo-a,beta-D-CNA). The crystal structure analysis of one a,beta-D-CNA TU dimer

  随着对控制核酸构象以定义活性核糖开关或 siRNA 的兴趣日益浓厚，我们在此展示了我们对核二核苷酸的立体控制合成和构象分析的努力，其中 a 和 β 扭转角被限制在二氧杂磷烷结构（ribo-a ,β-D-CNA)。一个 a,beta-D-CNA TU 二聚体的晶体结构分析证明了新创建的不对称中心的绝对立体化学。NMR 和 CD 分析允许完全分配和确定 a,beta-D-CNA UU 非对映异构体中的扭转角。
• Convertible and conformationally constrained nucleic acids (C₂NAs)
  作者：Jean-Marc Escudier、Corinne Payrastre、Béatrice Gerland、Nathalie Tarrat

  DOI：10.1039/c9ob01150a

  日期：——

  Constrained Nucleic Acids (C2NAs). By means of the synthesis of a stereocontrolled N-propargyl dioxo-1,3,2-oxaza-phosphorinane as an internucleotidic linkage, the torsional angles α and β can adopt either the canonical (g-, t) set of values able to increase DNA duplex stability or the non-canonical (g+, t) set that stabilized the hairpin structure when installed within the loop moiety. With an appended propargyl

  我们介绍可转换和约束核酸（C2NAs）的概念。通过合成立体控制的N-炔丙基二氧杂-1,3,2-氧杂氮杂-膦环烷作为核苷酸间的键合，扭转角α和β可以采用能够增加的规范值（g-，t）当安装在环部分中时，DNA双链体稳定性或非典型（g +，t）组可稳定发夹结构。通过在六元环的氮原子上附加炔丙基官能团，铜催化的惠斯根环加成反应（CuAAC点击化学反应）可在核酸链上任何位置引入新功能，同时保持几何约束带来的特性和中性的核苷酸间连接。