1-butyl-2-(2-(3-(2-(1-butyl-3,3-dimethylindolin-2-ylidene)ethylidene)-2-chlorocyclohex-1-en-1-yl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium iodide | 868248-05-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 1-butyl-2-(2-(3-(2-(1-butyl-3,3-dimethylindolin-2-ylidene)ethylidene)-2-chlorocyclohex-1-en-1-yl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium iodide
• CAS: 868248-05-9
• 化学式: C₃₈H₄₈ClN₂*I
• 分子量: 695.17
• InChiKey: FSCNYGIRQPRWEP-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.51
• 重原子数：
  42.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  6.25
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  1.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,4-苯二硫醇 、 1-butyl-2-(2-(3-(2-(1-butyl-3,3-dimethylindolin-2-ylidene)ethylidene)-2-chlorocyclohex-1-en-1-yl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium iodide 在 potassium carbonate 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  在中间位置含有接头的二聚七甲炔花青染料的简便合成

  摘要：

  合成的染料含有 l-丁基-3,3-二甲基-3//-吲哚鎓或苯并[e] 类似物作为末端亚基和连接各个发色团中心中间位置的不同链。二聚体染料在红色 (> 600 nm) 或近红外 (> 700 nm) 区域显示出吸收。

  DOI：

  10.1515/hc.2009.15.2.123
• 作为产物：
  描述：

  [3-(Anilinomethylidene)-2-chlorocyclohexen-1-yl]methylidene-phenylazanium 、 N-butyl-2,3,3-trimethylindoleninium iodide 在 sodium acetate 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 1-butyl-2-(2-(3-(2-(1-butyl-3,3-dimethylindolin-2-ylidene)ethylidene)-2-chlorocyclohex-1-en-1-yl)vinyl)-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium iodide
  参考文献：
  名称：

  在中间位置含有接头的二聚七甲炔花青染料的简便合成

  摘要：

  合成的染料含有 l-丁基-3,3-二甲基-3//-吲哚鎓或苯并[e] 类似物作为末端亚基和连接各个发色团中心中间位置的不同链。二聚体染料在红色 (> 600 nm) 或近红外 (> 700 nm) 区域显示出吸收。

  DOI：

  10.1515/hc.2009.15.2.123

文献信息

• Spectroscopic Study of a Novel Bis(Heptamethine Cyanine) Dye and its Interaction with Human Serum Albumin
  作者：Gabor Patonay、Jun Seok Kim、Ravikumar Kodagahally、Lucjan Strekowski

  DOI：10.1366/0003702053945976

  日期：2005.5

  coefficient and low fluorescence quantum yield. In aqueous solution, in the absence of human serum albumin (HSA), dye 7 has characteristic absorption bands at 792 and 435 nm, and its fluorescent emission is significantly diminished in comparison to that in methanol or when compared to its monomeric equivalent 5. Dye 7 seems to be more advantageous than its monomeric counterpart 5 as a non-covalent label

  评估了一种新合成的近红外 (NIR) 双（七次甲基花青）染料 7 作为蛋白质非共价标记的效用。这种染料在极性溶剂中形成分子间和分子内 H-聚集体，即使在非常低的浓度下也是如此。染料的分子内二聚体形式可以描述为具有两个相互作用的疏水碳菁部分的蛤壳复合物。在这种分子内 H 聚集体中，发色团具有低消光系数和低荧光量子产率。在水溶液中，在没有人血清白蛋白 (HSA) 的情况下，染料 7 在 792 和 435 nm 处具有特征吸收带，与甲醇中的荧光发射相比，或与其单体等效物 5 相比，其荧光发射显着减弱。作为生物分子的非共价标记，染料 7 似乎比其单体对应物 5 更有利。添加 HSA 后，H 和 D 带减少，单体带增加，同时荧光强度增加，表明蛤壳 H 聚集体在与 HSA 的复合物中打开。结合化学计量比为 1:1。这种二聚体染料作为非共价标记的主要优点是游离染料的荧光可忽略不计。