申请人:Manstein Dietmar
公开号:US20110105554A1
公开(公告)日:2011-05-05
The present invention provides a method of designing a modulator of a myosin, the method comprising molecular modeling of a compound such that the modeled compound interacts with at least three amino acid residues of said myosin, said residues being selected from (a) ranges K265-V268, V411-L441, N588-Q593, D614-T629, and V630-E646 of SEQ ID NO: 2, said myosin comprising or consisting of (i) the sequence of SEQ ID NO: 2; (ii) the sequence encoded by the sequence of SEQ ID NO: 1; (iii) a sequence being at least 40% identical to the sequence of SEQ ID NO: 2 or to the sequence encoded by the sequence of SEQ ID NO: 1; or (iv) a sequence encoded by a sequence being at least 40% identical to the sequence of SEQ ID NO: 1; wherein said sequence of (iii) or (iv) comprises said three amino acid residues, and wherein said residues comprise K265; or (b) ranges of any one of SEQ ID NOs: 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 102, 104, 106 or 108, respectively, said ranges aligning with the ranges of SEQ ID NO: 2 as defined in (a), said myosin comprising or consisting of (i) the sequence of any one of SEQ ID NO: 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 102, 104, 106 or 108, respectively; (ii) the sequence encoded by the sequence of any one of SEQ ID NO: 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31, 33, 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 61, 63, 65, 67, 69, 71, 73, 75, 77, 79, 81, 83, 85, 87, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 101, 103, 105, 107 or 109; respectively; (iii) a sequence being at least 40% identical to the sequence of any one of SEQ ID NO: 4, 6, 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 30, 32, 34, 36, 38, 40, 42, 44, 46, 48, 50, 52, 54, 56, 58, 60, 62, 64, 66, 68, 70, 72, 74, 76, 78, 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98, 100, 102, 104, 106 or 108, respectively, or to the sequence encoded by the sequence of any one of SEQ ID NO: 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31, 33, 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 61, 63, 65, 67, 69, 71, 73, 75, 77, 79, 81, 83, 85, 87, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 101, 103, 105, 107 or 109, respectively; or (iv) a sequence encoded by a sequence being at least 40% identical to the sequence of any one of SEQ ID NO: 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29, 31, 33, 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, 57, 59, 61, 63, 65, 67, 69, 71, 73, 75, 77, 79, 81, 83, 85, 87, 89, 91, 93, 95, 97, 99, 101, 103, 105, 107 or 109, respectively; wherein said sequence of (iii) or (iv) comprises said three amino acid residues, and wherein said residues comprise the residue aligning with K265 of SEQ ID NO: 2; thereby obtaining said modulator of a myosin. Furthermore provided are a method of identifying a modulator of a myosin, pharmaceutical compositions and methods of treating cardiovascular diseases, cancer, diseases of the central nervous system, viral infections, and infections by parasites of the Apicomplexa family.
本发明提供了一种设计肌球蛋白调制器的方法,该方法包括对化合物进行分子建模,使建模化合物与所述肌球蛋白的至少三个氨基酸残基相互作用,所述残基被选自序列ID号为2的范围K265-V268、V411-L441、N588-Q593、D614-T629和V630-E646,所述肌球蛋白包括或仅包括:(i)序列ID号为2的序列;(ii)由序列ID号为1的序列编码的序列;(iii)与序列ID号为2的序列或与由序列ID号为1的序列编码的序列至少40%相同的序列;或(iv)由与序列ID号为1的序列至少40%相同的序列编码的序列;其中所述(iii)或(iv)的序列包括所述三个氨基酸残基,且所述残基包括K265;或(b)序列ID号为4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106或108的任一范围,该范围与(a)中定义的序列ID号为2的范围对齐,所述肌球蛋白包括或仅包括:(i)任一序列ID号为4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106或108的序列;(ii)由任一序列ID号为3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107或109编码的序列;(iii)与任一序列ID号为4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106或108的序列或与由任一序列ID号为3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107或109编码的序列至少40%相同的序列;或(iv)由与任一序列ID号为3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107或109的序列至少40%相同的序列编码;其中所述(iii)或(iv)的序列包括所述三个氨基酸残基,且所述残基包括与序列ID号为2的K265对齐的残基;从而获得所述肌球蛋白的调制器。此外,还提供了一种识别肌球蛋白调制器的方法、制药组合物以及治疗心血管疾病、癌症、中枢神经系统疾病、病毒感染和Apicomplexa家族寄生虫感染的方法。