尽管弱相互作用在决定蛋白质结构方面起着微妙但重要的作用,但它们的实验检测并不简单。从 NOE 实验中,我们为 CH…π 相互作用的存在提供了直接证据,在具有一般序列的肽系列中,第一个 Pro 的 C(α)-H 和 Xaa 的芳族 (Aro) 侧链之间可操作Ac-Pro-Pro-Xaa-NH(2)。CH…π相互作用的间接证据来自Pro(1) C(α)-H
化学位移的环电流诱导的高场位移和Xaa侧链(χ1)旋转的限制。这种相互作用的结果是当 Xaa 是芳香族时,Ac-Pro-Pro-Xaa-NH(2) 中 Pro-cisPro 构象异构体的稳定性增强。当 Xaa 为 Tyr、Trp、Phe 时,与 Pro-Pro 部分的反式到顺式转化相关的自由能分别为 0.35、0.59、0.64 和 0.82 kcal/mol,和 His(pH 值为 8.4),分别。相比之下,当 Xaa 为非芳香族时,相应的自由能约为