1-O-methyl-2-deoxy-5-O-benzoyl-β-D-ribofuranose | 144072-00-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 1-O-methyl-2-deoxy-5-O-benzoyl-β-D-ribofuranose
• 英文别名: 1-methyl-5-O-benzoyl-2-deoxy-β-D-ribofuranoside；methyl 5-O-benzoyl-2-deoxy-β-D-ribofuranoside；[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-methoxyoxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 144072-00-4
• 化学式: C₁₃H₁₆O₅
• 分子量: 252.267
• InChiKey: YFTZNPWFVRTMSZ-QJPTWQEYSA-N

物化性质

• 沸点：
  397.9±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.25±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  65
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-O-methyl-2-deoxy-5-O-benzoyl-β-D-ribofuranose 在 chromium(VI) oxide 、 乙酸酐 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 生成 Methyl-5-O-benzoyl-2-desoxy-β-D-glycero-pentofuranosid-3-ulose
  参考文献：
  名称：

  2',3'-Dideoxy- and 3'-Azido-2',3'-dideoxynucleosides of 5-Phenyl-2(1H)-pyrimidinone. Preparation of 2',3'-Dideoxypentofuranoses

  摘要：

  本文描述了从甲基2-去氧-D-核糖呋喃苷（1）合成甲基3-叠氮基-5-苯甲酰基-2,3-二去氧-β-D-核糖呋喃苷（10）并用于制备3'-叠氮基-2',3'-二去氧-β-D-核糖呋喃苷的方法。将甲基葡萄糖苷1与苯甲酰氯在吡啶中反应得到5-O-苯甲酰衍生物2，然后在铬酸三氧化物、吡啶和乙酸酐的复合物的氧化下得到3-酮衍生物3。用乙醇中的硼氢化钠还原3，得到α-D-核糖和β-D-木糖构型的甲基2-去氧葡萄糖苷的混合物4和5。它们的甲磺酰衍生物6和7被色谱分离。化合物7在热二甲基甲酰胺中与叠氮化钠反应，得到甲基3-叠氮基-5-O-苯甲酰基-2,3-二去氧-β-D-核糖呋喃苷（10）。将5-苯基-2（1H）-嘧啶酮转化为硅烷衍生物11，通过六甲基二硅氮烷的处理。化合物11与叠氮糖10在三甲基硅基三氟甲磺酸催化下反应，随后进行甲醇解，得到异构体3'-叠氮基-2',3'-二去氧核苷14和15的混合物。甲基5-O-苯甲酰基-2,3-二去氧-α-D-核糖呋喃苷（17）由甲基-α-糖苷4与硫酰氯反应，然后用三丁基锡还原所得的3-氯衍生物16制备而成。硅烷衍生物11与2,3-二去氧糖17在三甲基硅基三氟甲磺酸催化下反应，主要得到1-(5-O-苯甲酰基-2,3-二去氧-α-D-巨环糖基)-5-苯基-2（1H）-嘧啶酮（19）和少量的β-异构体18。它们的甲醇解得到二去氧核苷20和21。

  DOI：

  10.1135/cccc19960478
• 作为产物：
  描述：

  2-deoxy-D-ribose 在 吡啶 、 乙酰氯 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 生成 1-O-methyl-2-deoxy-5-O-benzoyl-β-D-ribofuranose
  参考文献：
  名称：

  3'-C支链2'-脱氧-5-甲基尿苷：合成，酶抑制和抗病毒特性。

  摘要：

  已经提出了以2-脱氧核糖为原料的3'-C-甲基-2'-脱氧核苷和3'-C-亚甲基-2'，3'-二脱氧-5-甲基尿苷的合成方案。将5-O-苯甲酰基-2-脱氧核糖呋喃糖甲基氧化，并将3'-酮衍生物的混合物分离为α-和β-端基异构体。通过与MeMgBr反应，与胸腺嘧啶反应并随后脱保护1-（3'-C-甲基-2'-α-脱氧-α-D-苏-五氟呋喃糖基）胸腺嘧啶及其β-获得了异头物。与α-酮糖的相同反应得到1-（3'-C-甲基-2'-脱氧-α-D-赤型五呋喃糖基）胸腺嘧啶及其β-异头物。将1-（5-O-苯甲酰基-3'-C-甲基-2'-脱氧-α-D-苏-五氟呋喃糖基）胸腺嘧啶转化为3'-C-亚甲基-2'，3'的混合物 分离了-二脱氧-5-甲基尿苷和3'-C-甲基-2'，3'-二脱氧-2'，3'-二氢-5-甲基尿苷。格氏试剂与2-脱氧呋喃糖3-核苷的连接的立体选择性由Cl处的取代构型决定。此外，还研究了C3

  DOI：

  10.1021/jm00102a009

文献信息

• Synthesis, structure and certain biochemical properties of 31-branched thymidines and their 51-phosphate derivatives
  作者：I. I. Fedorov、E. M. Kaz'mina、N. A. Novikov、G. V. Gurskaya、A. V. Bochkarev、M. V. Yas'ko、L. S. Viktorova、M. K. Kukhanova、A. A. Kraevskii、Ya. Bal'zarini、E. De Clerk

  DOI：10.1007/bf00772900

  日期：1992.5

  the cell and inhibition of the synthesis of the viral RNA [30]. It was shown that 3'-C-methyluridine 5'-triphosphate is a terminating substrate for the RNApolymerase of E. coli [i]. In the present work a general scheme of a synthesis of 3'-branched 2'-deoxythymidines is presented. Previously the Grignard reaction was used with 3'-keto-2'deoxynucleosides [33] and with 2'-O-tosylribonucleosides [5, 6]

  对于具有潜在抗逆转录病毒活性的化合物的合成，优先采用常规方法。该方法基于 2'-脱氧核苷 3'-位的羟基被其他官能团取代，同时保留 3'-位的氢原子 [14]。将烷基取代基引入 3'-位代替氢原子同时保留 3'-羟基也很有趣，这可能在 DNA 合成过程中参与多核苷酸链的延伸。这些脱氧核苷在形成磷酸酯键时的亲核性因此显着降低，这可以赋予底物新的性质。通过这种方式，先前已在 3' 中建立了抗病毒活性 -C 甲基核糖核苷与天花疫苗病毒相关，因为它们可能在细胞中发生 5 三磷酸化并抑制病毒 RNA 的合成 [30]。结果表明，3'-C-甲基尿苷 5'-三磷酸是大肠杆菌 [i] 的 RNA 聚合酶的终止底物。在目前的工作中，提出了合成 3'-支链 2'-脱氧胸苷的一般方案。以前，格氏反应与 3'-酮-2'脱氧核苷 [33] 和 2'-O-甲苯磺酰基核糖核苷 [5, 6] 一起用于制备，这使得获得 3'-C-甲基-2'
• 3'-C-Branched 2'-deoxy-5-methyluridines: synthesis, enzyme inhibition, and antiviral properties
  作者：I. I. Fedorov、E. M. Kaz'mina、N. A. Novicov、G. V. Gurskaya、A. V. Bochkarev、M. V. Yas'ko、L. S. Viktorova、M. K. Kukhanova、Jan Balzarini

  DOI：10.1021/jm00102a009

  日期：1992.11

  of a number of DNA polymerases, including the reverse transcriptases of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) and avian myeloblastosis virus (AMV). None of the DNA polymerases examined were able to incorporate this compound into the growing DNA chain. In contrast, 3'-C-methylidene-2',3'-dideoxy-5-methyluridine 5'-triphosphate was found to be incorporated at the 3'-end of the DNA chain by HIV-1

  已经提出了以2-脱氧核糖为原料的3'-C-甲基-2'-脱氧核苷和3'-C-亚甲基-2'，3'-二脱氧-5-甲基尿苷的合成方案。将5-O-苯甲酰基-2-脱氧核糖呋喃糖甲基氧化，并将3'-酮衍生物的混合物分离为α-和β-端基异构体。通过与MeMgBr反应，与胸腺嘧啶反应并随后脱保护1-（3'-C-甲基-2'-α-脱氧-α-D-苏-五氟呋喃糖基）胸腺嘧啶及其β-获得了异头物。与α-酮糖的相同反应得到1-（3'-C-甲基-2'-脱氧-α-D-赤型五呋喃糖基）胸腺嘧啶及其β-异头物。将1-（5-O-苯甲酰基-3'-C-甲基-2'-脱氧-α-D-苏-五氟呋喃糖基）胸腺嘧啶转化为3'-C-亚甲基-2'，3'的混合物 分离了-二脱氧-5-甲基尿苷和3'-C-甲基-2'，3'-二脱氧-2'，3'-二氢-5-甲基尿苷。格氏试剂与2-脱氧呋喃糖3-核苷的连接的立体选择性由Cl处的取代构型决定。此外，还研究了C3
• 3′-C-phosphonates as nucleotides analogues synthesis starting from original C-phosphonosugars (in ribo- and deoxyribo- series)
  作者：Corine Serra、Georges Dewynter、Jean-Louis Montero、Jean-Louis Imbach

  DOI：10.1016/s0040-4020(01)85564-2

  日期：1994.1

  3-C-phosphonosugars were synthetised starting from 2-deoxy-D-ribose and alpha-D-xylofuranose via the Pudovic reaction followed by reduction. Their condensation with nucleobases (thymine and adenine) gave original 3'-C-phosphononucleosides in ribo- and 2-deoxyribo- series, with a stereocontrol of the reactions.
• 2',3'-Dideoxy- and 3'-Azido-2',3'-dideoxynucleosides of 5-Phenyl-2(1H)-pyrimidinone. Preparation of 2',3'-Dideoxypentofuranoses
  作者：Marcela Krečmerová、Hubert Hřebabecký、Milena Masojídková、Antonín Holý

  DOI：10.1135/cccc19960478

  日期：——

  The synthesis of methyl 3-azido-5-benzoyl-2,3-dideoxy-β-D-ribofuranoside (10) from methyl 2-deoxy-D-ribofuranoside (1) and its use for the preparation of 3'-azido-2',3'-dideoxy-β-D-ribofuranosides is described. Reaction of methylglucoside 1 with benzoyl chloride in pyridine afforded 5-O-benzoyl derivative 2, which on oxidation with complex of chromium trioxide, pyridine and acetic anhydride afforded 3-keto derivative 3. This was reduced with sodium borohydride in ethanol to give a mixture of methyl 2-deoxyglycosides of α-D-ribo- (4) and β-D-xylo- (5) configuration. Their mesyl derivatives 6 and 7 were chromatographically separated. Compound 7 reacted with sodium azide in hot dimethylformamide to afford methyl 3-azido-5-O-benzoyl-2,3-dideoxy-β-D-ribofuranoside (10). 5-Phenyl-2(1H)-pyrimidinone was converted into silyl derivative 11 by treatment with hexamethyldisilazane. Reaction of compound 11 with the azido sugar 10, catalyzed by trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate, and subsequent methanolysis, furnished a mixture of anomeric 3'-azido-2',3'-dideoxynucleosides 14 and 15. Methyl 5-O-benzoyl-2,3-dideoxy-α-D-ribofuranoside (17) was prepared from methyl-α-glycoside 4 by reaction with thionyl chloride and subsequent reduction of the obtained 3-chloro derivative 16 with tributylstannane. Silyl derivative 11 reacted with 2,3-dideoxy sugar 17 under catalysis with trimethylsilyl triflate to give mainly 1-(5-O-benzoyl-2,3-dideoxy-α-D-glycero-pentofuranosyl)-5-phenyl-2(1H)-pyrimidinone (19) and minor amount of the β-anomer 18. Their methanolysis afforded dideoxynucleosides 20 and 21.

  本文描述了从甲基2-去氧-D-核糖呋喃苷（1）合成甲基3-叠氮基-5-苯甲酰基-2,3-二去氧-β-D-核糖呋喃苷（10）并用于制备3'-叠氮基-2',3'-二去氧-β-D-核糖呋喃苷的方法。将甲基葡萄糖苷1与苯甲酰氯在吡啶中反应得到5-O-苯甲酰衍生物2，然后在铬酸三氧化物、吡啶和乙酸酐的复合物的氧化下得到3-酮衍生物3。用乙醇中的硼氢化钠还原3，得到α-D-核糖和β-D-木糖构型的甲基2-去氧葡萄糖苷的混合物4和5。它们的甲磺酰衍生物6和7被色谱分离。化合物7在热二甲基甲酰胺中与叠氮化钠反应，得到甲基3-叠氮基-5-O-苯甲酰基-2,3-二去氧-β-D-核糖呋喃苷（10）。将5-苯基-2（1H）-嘧啶酮转化为硅烷衍生物11，通过六甲基二硅氮烷的处理。化合物11与叠氮糖10在三甲基硅基三氟甲磺酸催化下反应，随后进行甲醇解，得到异构体3'-叠氮基-2',3'-二去氧核苷14和15的混合物。甲基5-O-苯甲酰基-2,3-二去氧-α-D-核糖呋喃苷（17）由甲基-α-糖苷4与硫酰氯反应，然后用三丁基锡还原所得的3-氯衍生物16制备而成。硅烷衍生物11与2,3-二去氧糖17在三甲基硅基三氟甲磺酸催化下反应，主要得到1-(5-O-苯甲酰基-2,3-二去氧-α-D-巨环糖基)-5-苯基-2（1H）-嘧啶酮（19）和少量的β-异构体18。它们的甲醇解得到二去氧核苷20和21。