benzyl N-[(2S)-1-[3-hydroxy-4-[[(2S)-4-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]piperidin-1-yl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-N-methylcarbamate | 203501-32-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: benzyl N-[(2S)-1-[3-hydroxy-4-[[(2S)-4-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]piperidin-1-yl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-N-methylcarbamate
• CAS: 203501-32-0
• 化学式: C₃₄H₄₈N₄O₇
• 分子量: 624.778
• InChiKey: PUYKIRKLXAMOGM-WKWNBGBUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.7
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  138
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl N-[(2S)-1-[3-hydroxy-4-[[(2S)-4-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]piperidin-1-yl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-N-methylcarbamate 在 草酰氯 、 二甲基亚砜 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以54%的产率得到benzyl N-[(1S)-1-({1-[(2S)-2-{[(benzyloxy)carbonyl](methyl)amino}-4-methylpentanoyl]-3-oxopiperidin-4-yl}carbamoyl)-3-methylbutyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  半胱氨酸蛋白酶组织蛋白酶K的环酮抑制剂。

  摘要：

  组织蛋白酶K（EC 3.4.22.38）是木瓜蛋白酶超家族的半胱氨酸蛋白酶，主要在破骨细胞中表达，并被假定为治疗骨质疏松症的靶标。对组织蛋白酶K的一系列基于无环酮的抑制剂的晶体学和结构活性研究导致了两种系列环酮抑制剂的设计和鉴定。讨论并比较了这四种环状和非环状抑制剂与组织蛋白酶K的结合方式。所有的结构都与将活性位点硫醇加到抑制剂的酮上并形成半缩酮相一致。C-3非对映异构体3-酰胺基四氢呋喃-4-酮类似物16与组织蛋白酶K的共结晶显示，该抑制剂占据了活性位点的未涂底漆的一侧，优选3S非对映异构体。这种C-3立体化学偏好与3-酰胺基吡咯烷酮-4-酮抑制剂29和33的X射线共晶体结构相反，后者显示这些抑制剂更喜欢结合3R非对映异构体。3-amidopyrrolidin-4-1抑制剂在两个方向交替绑定在酶的活性位点。尽管在这两个系列化合物中均显示出有希望的药代动力学，但已证明与这些抑制剂中包含的不

  DOI：

  10.1021/jm000320t
• 作为产物：
  描述：

  N-苄氧羰基-L-亮氨酸 在 盐酸 、 1-羟基苯并三唑 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 为溶剂， 生成 benzyl N-[(2S)-1-[3-hydroxy-4-[[(2S)-4-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]piperidin-1-yl]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-N-methylcarbamate
  参考文献：
  名称：

  半胱氨酸蛋白酶组织蛋白酶K的环酮抑制剂。

  摘要：

  组织蛋白酶K（EC 3.4.22.38）是木瓜蛋白酶超家族的半胱氨酸蛋白酶，主要在破骨细胞中表达，并被假定为治疗骨质疏松症的靶标。对组织蛋白酶K的一系列基于无环酮的抑制剂的晶体学和结构活性研究导致了两种系列环酮抑制剂的设计和鉴定。讨论并比较了这四种环状和非环状抑制剂与组织蛋白酶K的结合方式。所有的结构都与将活性位点硫醇加到抑制剂的酮上并形成半缩酮相一致。C-3非对映异构体3-酰胺基四氢呋喃-4-酮类似物16与组织蛋白酶K的共结晶显示，该抑制剂占据了活性位点的未涂底漆的一侧，优选3S非对映异构体。这种C-3立体化学偏好与3-酰胺基吡咯烷酮-4-酮抑制剂29和33的X射线共晶体结构相反，后者显示这些抑制剂更喜欢结合3R非对映异构体。3-amidopyrrolidin-4-1抑制剂在两个方向交替绑定在酶的活性位点。尽管在这两个系列化合物中均显示出有希望的药代动力学，但已证明与这些抑制剂中包含的不

  DOI：

  10.1021/jm000320t

文献信息

• Cyclic Ketone Inhibitors of the Cysteine Protease Cathepsin K
  作者：Robert W. Marquis、Yu Ru、Jin Zeng、Robert E. Lee Trout、Stephen M. LoCastro、Andrew D. Gribble、Jason Witherington、Ashley E. Fenwick、Benedicte Garnier、Thaddeus Tomaszek、David Tew、Mark E. Hemling、Chad J. Quinn、Ward W. Smith、Baoguang Zhao、Michael S. McQueney、Cheryl A. Janson、Karla D'Alessio、Daniel F. Veber

  DOI：10.1021/jm000320t

  日期：2001.3.1

  Cathepsin K (EC 3.4.22.38), a cysteine protease of the papain superfamily, is predominantly expressed in osteoclasts and has been postulated as a target for the treatment of osteoporosis. Crystallographic and structure--activity studies on a series of acyclic ketone-based inhibitors of cathepsin K have led to the design and identification of two series of cyclic ketone inhibitors. The mode of binding

  组织蛋白酶K（EC 3.4.22.38）是木瓜蛋白酶超家族的半胱氨酸蛋白酶，主要在破骨细胞中表达，并被假定为治疗骨质疏松症的靶标。对组织蛋白酶K的一系列基于无环酮的抑制剂的晶体学和结构活性研究导致了两种系列环酮抑制剂的设计和鉴定。讨论并比较了这四种环状和非环状抑制剂与组织蛋白酶K的结合方式。所有的结构都与将活性位点硫醇加到抑制剂的酮上并形成半缩酮相一致。C-3非对映异构体3-酰胺基四氢呋喃-4-酮类似物16与组织蛋白酶K的共结晶显示，该抑制剂占据了活性位点的未涂底漆的一侧，优选3S非对映异构体。这种C-3立体化学偏好与3-酰胺基吡咯烷酮-4-酮抑制剂29和33的X射线共晶体结构相反，后者显示这些抑制剂更喜欢结合3R非对映异构体。3-amidopyrrolidin-4-1抑制剂在两个方向交替绑定在酶的活性位点。尽管在这两个系列化合物中均显示出有希望的药代动力学，但已证明与这些抑制剂中包含的不