[4-Oxo-4-(2-phenylethylamino)butyl]carbamic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: [4-Oxo-4-(2-phenylethylamino)butyl]carbamic acid
• 英文别名: [4-oxo-4-(2-phenylethylamino)butyl]carbamic acid
• 化学式: C₁₃H₁₈N₂O₃
• 分子量: 250.298
• InChiKey: QDIDELHWJXIEAM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.2
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  78.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-溴-2-氟乙烷 、 [4-Oxo-4-(2-phenylethylamino)butyl]carbamic acid 以 乙腈 为溶剂， 反应 24.0h， 以172 mg的产率得到2-fluoroethyl (4-oxo-4-(phenethylamino)butyl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis, Enzyme Assays and Molecular Docking Studies of Fluorina ted Bioisosteres of Santacruzamate A as Potential HDAC Tracers

  摘要：

  背景：组蛋白去乙酰化酶（HDACs）作为基因表达的重要表观遗传调控因子出现。 方法：为了鉴定潜在的正电子发射断层扫描（PET）示踪剂用于成像HDACs，我们评估了一些被报道为高效选择性HDAC2抑制剂的化合物在体外和细胞内的活性。我们观察到对于某些化合物，其报道的活动值与我们实验得到的值之间存在显著差异。为了理解其中一些抑制剂活性的结构基础，我们还进行了分子对接研究，以了解它们与HDAC2的相互作用模式和结合方式。 结果与结论：我们观察到低亲和性化合物4、6和7在比较中没有表现出与高亲和性化合物相同数量的关键π-π相互作用和氢键，这可能是其在体外实验中显示抑制作用较差的可能原因。这些初步的实验和计算结果将有助于谨慎解读这些关键化合物的HDAC亲和值。

  DOI：

  10.2174/1570180813666161101152943
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl (4-oxo-4-(phenethylamino)butyl)carbamate 在 三氟乙酸 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 [4-Oxo-4-(2-phenylethylamino)butyl]carbamic acid
  参考文献：
  名称：

  Synthesis, Enzyme Assays and Molecular Docking Studies of Fluorina ted Bioisosteres of Santacruzamate A as Potential HDAC Tracers

  摘要：

  背景：组蛋白去乙酰化酶（HDACs）作为基因表达的重要表观遗传调控因子出现。 方法：为了鉴定潜在的正电子发射断层扫描（PET）示踪剂用于成像HDACs，我们评估了一些被报道为高效选择性HDAC2抑制剂的化合物在体外和细胞内的活性。我们观察到对于某些化合物，其报道的活动值与我们实验得到的值之间存在显著差异。为了理解其中一些抑制剂活性的结构基础，我们还进行了分子对接研究，以了解它们与HDAC2的相互作用模式和结合方式。 结果与结论：我们观察到低亲和性化合物4、6和7在比较中没有表现出与高亲和性化合物相同数量的关键π-π相互作用和氢键，这可能是其在体外实验中显示抑制作用较差的可能原因。这些初步的实验和计算结果将有助于谨慎解读这些关键化合物的HDAC亲和值。

  DOI：

  10.2174/1570180813666161101152943

文献信息

• [EN] SANTACRUZAMATE A COMPOSITIONS AND ANALOGS AND METHODS OF USE<br/>[FR] COMPOSITIONS DE SANTACRUZAMATE A ET ANALOGUES ET PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：UNIV CONNECTICUT

  公开号：WO2014018913A2

  公开（公告）日：2014-01-30

  The compositions and methods described herein relate generally to Santacruzamate A compositions and analogs, which, among other features, are useful as histone deacetylase (HDAC) inhibitors.
• Synthesis, Enzyme Assays and Molecular Docking Studies of Fluorina ted Bioisosteres of Santacruzamate A as Potential HDAC Tracers
  作者：Muneer Ahamed、Koen Vermeulen、Michael Schnekenburger、Lise Roman Moltzau、Finn Olav Levy、Janos Marton、Mathy Froeyen、Dag Erlend Olberg、Marc Diederich、Guy Bormans

  DOI：10.2174/1570180813666161101152943

  日期：2017.6.30

  Background: Histone deacetylases (HDACs) emerged as important epigenetic regulators of gene expression. Method: In order to identify potential positron emission tomography (PET) tracers for imaging HDACs, we evaluated in vitro and in cellulo activities of some compounds that were reported as potent HDAC2-selective inhibitors. We observed marked differences between reported activity values and the values obtained in our assays for some of the compounds. To understand the structural basis of the activity of some of these inhibitors, we also performed molecular docking studies to understand their interaction patterns and binding modes with HDAC2. Results and Conclusion: We observed the low affinity compounds 4, 6 and 7 did not showed equal number of key π-π interactions and hydrogen bonding when compared to high affinity compounds, and could be the possible reason for poor inhibition as reflected in in vitro assays. These preliminary experimental and computational results will help to interpret the HDAC affinity values of these key compounds with caution.

  背景：组蛋白去乙酰化酶（HDACs）作为基因表达的重要表观遗传调控因子出现。 方法：为了鉴定潜在的正电子发射断层扫描（PET）示踪剂用于成像HDACs，我们评估了一些被报道为高效选择性HDAC2抑制剂的化合物在体外和细胞内的活性。我们观察到对于某些化合物，其报道的活动值与我们实验得到的值之间存在显著差异。为了理解其中一些抑制剂活性的结构基础，我们还进行了分子对接研究，以了解它们与HDAC2的相互作用模式和结合方式。 结果与结论：我们观察到低亲和性化合物4、6和7在比较中没有表现出与高亲和性化合物相同数量的关键π-π相互作用和氢键，这可能是其在体外实验中显示抑制作用较差的可能原因。这些初步的实验和计算结果将有助于谨慎解读这些关键化合物的HDAC亲和值。