N-[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]-3-[(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)amino]-L-alanine | 350671-20-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]-3-[(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)amino]-L-alanine
• 英文别名: (S)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)-3-((7-nitrobenzo[c][1,2,5]oxadiazol-4-yl)amino)propanoic acid；Boc-Dap(NBD)-OH；(2S)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-3-[(4-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-7-yl)amino]propanoic acid
• CAS: 350671-20-4
• 化学式: C₁₄H₁₇N₅O₇
• 分子量: 367.318
• InChiKey: ILEUVONIVKGFMZ-QMMMGPOBSA-N

物化性质

• 密度：
  1.487±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  172
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]-3-[(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)amino]-L-alanine 在 盐酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 3-[(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)amino]-L-alanine
  参考文献：
  名称：

  用荧光 D-氨基酸原位探测活细菌中新合成的肽聚糖

  摘要：

  追踪虫子的生命：通过利用细胞对不同非天然D-氨基酸的耐受性来标记不同细菌的肽聚糖 (PG) 。这些无毒的D-氨基酸优选标记活性 PG 合成的位点，从而能够在系统发育和形态多样的细菌中对细胞壁动力学进行精细的时空跟踪。HCC=7-羟基香豆素，NBD=7-硝基苯并呋喃，TAMRA=羧基四甲基罗丹明。

  DOI：

  10.1002/anie.201206749
• 作为产物：
  描述：

  (S)-3-amino-2-tert-butoxycarbonylaminopropionic acid 、 4-氯-7-硝基苯并-2-氧杂-1,3-二唑 在 碳酸氢钠 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 N-[(1,1-dimethylethoxy)carbonyl]-3-[(7-nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)amino]-L-alanine
  参考文献：
  名称：

  用荧光 D-氨基酸原位探测活细菌中新合成的肽聚糖

  摘要：

  追踪虫子的生命：通过利用细胞对不同非天然D-氨基酸的耐受性来标记不同细菌的肽聚糖 (PG) 。这些无毒的D-氨基酸优选标记活性 PG 合成的位点，从而能够在系统发育和形态多样的细菌中对细胞壁动力学进行精细的时空跟踪。HCC=7-羟基香豆素，NBD=7-硝基苯并呋喃，TAMRA=羧基四甲基罗丹明。

  DOI：

  10.1002/anie.201206749

文献信息

• HIGH-SENSITIVE FLUORESCENT ENERGY TRANSFER ASSAY USING FLUORESCENT AMINO ACIDS AND FLUORESENT PROTEINS
  申请人：The Regents of the University of California

  公开号：US20150369800A1

  公开（公告）日：2015-12-24

  The disclosure provides method and composition utilizing fluorescent amino acids and fluorescent proteins comprising a moiety capable of undergoing FRET. The methods and compositions of the disclosure are useful in analyzing protein structure and function, and screening molecular inhibitors.

  该公开提供了一种利用荧光氨基酸和含有能够进行FRET的荧光蛋白的方法和组合物。该公开的方法和组合物在分析蛋白质结构和功能，以及筛选分子抑制剂方面具有实用性。
• Ribosome-mediated incorporation of fluorescent amino acids into peptides <i>in vitro</i>
  作者：Joongoo Lee、Kevin J. Schwarz、Hao Yu、Antje Krüger、Eric V. Anslyn、Andrew D. Ellington、Jeffrey S. Moore、Michael C. Jewett

  DOI：10.1039/d0cc07740b

  日期：——

  fluorescent groups include pyrene, coumarin, nitrobenzoxadiazole, and fluorescein variants. We further demonstrate site-specific incorporation of the FAAs into peptides by the ribosome in vitro through genetic code reprogramming.

  我们报告了各种荧光氨基酸（FAA）的设计，化学合成和弹性酶催化的转移RNA（tRNA）酰化。荧光基团包括pyr，香豆素，硝基苯并恶二唑和荧光素变体。我们进一步证明通过遗传密码重编程在体外通过核糖体将FAA特异掺入肽中。
• A fluorescent amino acid probe to monitor efficiency of peptide conjugation to glass surfaces for high density microarrays
  作者：Yongfeng Zhao、Michael C. Pirrung、Jiayu Liao

  DOI：10.1039/c2mb05471j

  日期：——

  Using a fluorescent NBD amino acid, new protease substrates were developed that are attractive because of the excellent chemical stability and long wavelength of excitation (480 nm) of the NBD fluorophore. The fluorescent peptides are synthesized by Fmoc solid-phase peptide synthesis. An example peptide was efficiently immobilized onto a microarray surface using click chemistry, and its proteolysis was monitored by fluorescence imaging. Excellent site specificity was achieved for the protease. Fluorescent peptides are also used to monitor the conjugation efficiency onto a surface using a standard microarray scanner.

  使用一种荧光NBD氨基酸，开发了新的蛋白酶底物，这些底物因其出色的化学稳定性和长的激发波长（480 nm）而具有吸引力。通过Fmoc固相肽合成法合成了荧光肽。通过点击化学法有效地将一种肽固定在微阵列表面上，并通过荧光成像监测其蛋白水解过程。对该蛋白酶实现了极佳的位点特异性。荧光肽还被用于使用标准微阵列扫描仪监测表面上的偶联效率。
• In Situ Probing of Newly Synthesized Peptidoglycan in Live Bacteria with Fluorescent<scp>D</scp>-Amino Acids
  作者：Erkin Kuru、H. Velocity Hughes、Pamela J. Brown、Edward Hall、Srinivas Tekkam、Felipe Cava、Miguel A. de Pedro、Yves V. Brun、Michael S. VanNieuwenhze

  DOI：10.1002/anie.201206749

  日期：2012.12.7

  Tracking a bug's life: Peptidoglycan (PG) of diverse bacteria is labeled by exploiting the tolerance of cells for incorporating different non‐natural D‐amino acids. These nontoxic D‐amino acids preferably label the sites of active PG synthesis, thereby enabling fine spatiotemporal tracking of cell‐wall dynamics in phylogenetically and morphologically diverse bacteria. HCC=7‐hydroxycoumarin, NBD=7‐nitrobenzofurazan

  追踪虫子的生命：通过利用细胞对不同非天然D-氨基酸的耐受性来标记不同细菌的肽聚糖 (PG) 。这些无毒的D-氨基酸优选标记活性 PG 合成的位点，从而能够在系统发育和形态多样的细菌中对细胞壁动力学进行精细的时空跟踪。HCC=7-羟基香豆素，NBD=7-硝基苯并呋喃，TAMRA=羧基四甲基罗丹明。
• HIGH-SENSITIVE FLUORESCENT ENERGY TRANSFER ASSAY USING FLUORESCENT AMINO ACIDS AND FLUORESCENT PROTEINS
  申请人：The Regents of the University of California

  公开号：US20170370916A1

  公开（公告）日：2017-12-28

  The disclosure provides method and composition utilizing fluorescent amino acids and fluorescent proteins comprising a moiety capable of undergoing FRET. The methods and compositions of the disclosure are useful in analyzing protein structure and function, and screening molecular inhibitors.