methyl N-{2-[N-Fmoc-N-(6-N-Boc-aminohexyl)]aminoethyl}glycinate | 1160163-42-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: methyl N-{2-[N-Fmoc-N-(6-N-Boc-aminohexyl)]aminoethyl}glycinate
• 英文别名: Methyl N-{2-[N-Fmoc-N-(6-N-Boc-aminohexyl)]aminoethyl}glycinate；methyl 2-[2-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl-[6-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]hexyl]amino]ethylamino]acetate
• CAS: 1160163-42-7
• 化学式: C₃₁H₄₃N₃O₆
• 分子量: 553.699
• InChiKey: WLJLODDHFYZGLL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  106
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl N-{2-[N-Fmoc-N-(6-N-Boc-aminohexyl)]aminoethyl}glycinate 、 9H-嘌呤-9-乙酸,6-(苯甲酰氨基)- 在 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以88%的产率得到methyl 12-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)-15-(2-(6-benzamido-9H-purin-9-yl)acetyl)-2,2-dimethyl-4-oxo-3-oxa-5,12,15-triazaheptadecan-17-oate
  参考文献：
  名称：

  用类肽样侧链调节PNA的杂交特性

  摘要：

  对PNA主链的γ-N进行修饰，得到具有类肽侧链的PNA类似物。我们发现，侧链的长度在影响修饰的PNA的杂交亲和力中很重要。

  DOI：

  10.1021/ol900587b
• 作为产物：
  描述：

  甘氨酸甲酯盐酸盐 在 sodium periodate 、 sodium cyanoborohydride 、 溶剂黄146 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 tetrahydrofuran-water 、 水 为溶剂， 生成 methyl N-{2-[N-Fmoc-N-(6-N-Boc-aminohexyl)]aminoethyl}glycinate
  参考文献：
  名称：

  PEPTIDE NUCLEIC ACID MONOMERS AND OLIGOMERS

  摘要：

  揭示了一种肽核酸单体以及相应的肽核酸分子。该单体包括一个末端氨基团和一个末端基团A。末端氨基团和末端基团A由一个脂肪族基团连接。该脂肪族基团的主链在生理条件下不带电。末端基团A是以下之一：—COOH、—COOR3、—COX、—COSR3、—CN、—CONH2、—CONHR3、—CONR3、R4，其中R3和R4为H或脂肪族、脂环、芳香、芳香脂肪或芳香脂环基团，X为卤素原子。末端氨基团被一个至少有两个碳原子的脂肪族基团取代，可选地含有0到大约2个来自N、O、S、Se和Si组的杂原子。主链具有一个极性头基团Z。

  公开号：

  US20110245458A1

文献信息

• US8859490B2
  申请人：——

  公开号：US8859490B2

  公开（公告）日：2014-10-14
• Modulating the Hybridization Property of PNA with a Peptoid-Like Side Chain
  作者：Xiao-Wei Lu、Yun Zeng、Chuan-Fa Liu

  DOI：10.1021/ol900587b

  日期：2009.6.4

  Modification on the γ-N of the PNA backbone yielded a PNA analogue with a peptoid-like side chain. We found that the length of the side chain was important in influencing the hybridization affinity of the modified PNA.

  对PNA主链的γ-N进行修饰，得到具有类肽侧链的PNA类似物。我们发现，侧链的长度在影响修饰的PNA的杂交亲和力中很重要。
• PEPTIDE NUCLEIC ACID MONOMERS AND OLIGOMERS
  申请人：Liu Chuan Fa

  公开号：US20110245458A1

  公开（公告）日：2011-10-06

  Disclosed is a peptide nucleic acid monomer as well as a corresponding peptide nucleic acid molecule. The monomer comprises a terminal amino group and a terminal group A. The terminal amino group and the terminal group A are connected by an aliphatic moiety. The main chain of this aliphatic moiety is free of groups that are charged under physiological conditions. The terminal group A is one of —COOH, —COOR 3 , —COX, —COSR 3 , —CN, —CONH 2 , —CONHR 3 , —CONR 3 , R 4 , with R 3 and R4 being H or an aliphatic, alicyclic, aromatic, arylaliphatic or arylalicyclic group, and X being a halogen atom. The terminal amino group is substituted by an aliphatic group with a main chain of at least two carbon atoms and optionally 0 to a bout 2 heteroatoms selected from the group N, O, S, Se and Si. The main chain has a polar head group Z.

  揭示了一种肽核酸单体以及相应的肽核酸分子。该单体包括一个末端氨基团和一个末端基团A。末端氨基团和末端基团A由一个脂肪族基团连接。该脂肪族基团的主链在生理条件下不带电。末端基团A是以下之一：—COOH、—COOR3、—COX、—COSR3、—CN、—CONH2、—CONHR3、—CONR3、R4，其中R3和R4为H或脂肪族、脂环、芳香、芳香脂肪或芳香脂环基团，X为卤素原子。末端氨基团被一个至少有两个碳原子的脂肪族基团取代，可选地含有0到大约2个来自N、O、S、Se和Si组的杂原子。主链具有一个极性头基团Z。