1-(3,4-dichlorophenyl)-2-{2-imino-3-[(2-methylphenyl)methyl]-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-1-yl}ethan-1-ol

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 1-(3,4-dichlorophenyl)-2-{2-imino-3-[(2-methylphenyl)methyl]-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-1-yl}ethan-1-ol
• 英文别名: (1R)-1-(3,4-dichlorophenyl)-2-[2-imino-3-[(2-methylphenyl)methyl]benzimidazol-1-yl]ethanol
• 化学式: C₂₃H₂₁Cl₂N₃O
• 分子量: 426.345
• InChiKey: BEKCHDAUQRKKOP-QFIPXVFZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  50.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-溴-3',4'-二氯苯乙酮 在 sodium tetrahydroborate 、 二乙胺 作用下， 以 甲醇 、 正己烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 异丙醇 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 1-(3,4-dichlorophenyl)-2-{2-imino-3-[(2-methylphenyl)methyl]-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-1-yl}ethan-1-ol 、 1-(3,4-dichlorophenyl)-2-{2-imino-3-[(2-methylphenyl)methyl]-2,3-dihydro-1H-1,3-benzodiazol-1-yl}ethan-1-ol
  参考文献：
  名称：

  结构引导的多梳抑制蛋白CBX7的染色体结构域的选择性拮抗剂的发现。

  摘要：

  聚梳阻遏复合物1（PRC1）的染色体框7（CBX7）蛋白通过长的非编码RNA，ANRIL（INK4基因座中的反义非编码RNA）定向的染色体结构域（ChD）结合三甲基化赖氨酸27来抑制肿瘤抑制因子p16 INK4a的转录。H3（H3K27me3）的合成，导致INK4a / ARF处的染色质紧实轨迹。在这项研究中，我们报告了两种不同类型的CBX7ChD小分子拮抗剂的结构指导发现。我们的A类化合物（包括以前报道的MS452的类似物）通过占据H3K27me3肽结合位点来抑制CBX7ChD /甲基赖氨酸结合，而我们的B类化合物（新发现的MS351）在结合CBX7ChD时似乎抑制了H3K27me3结合。 RNA。我们的CBX7ChD / MS351配合物的晶体结构揭示了通常通过甲基赖氨酸结合作用的芳香族笼状残基识别配体的分子细节。我们进一步证明，MS351有效诱导CBX7目标基因（包括p16 INK4

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.6b00042

文献信息

• Structure-Guided Discovery of Selective Antagonists for the Chromodomain of Polycomb Repressive Protein CBX7
  作者：Chunyan Ren、Steven G. Smith、Kyoko Yap、SiDe Li、Jiaojie Li、Mihaly Mezei、Yoel Rodriguez、Adam Vincek、Francesca Aguilo、Martin J. Walsh、Ming-Ming Zhou

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.6b00042

  日期：2016.6.9

  transcription of tumor suppressor p16INK4a through long noncoding RNA, ANRIL (antisense noncoding RNA in the INK4 locus) directed chromodomain (ChD) binding to trimethylated lysine 27 of histone H3 (H3K27me3), resulting in chromatin compaction at the INK4a/ARF locus. In this study, we report structure-guided discovery of two distinct classes of small-molecule antagonists for the CBX7ChD. Our Class A

  聚梳阻遏复合物1（PRC1）的染色体框7（CBX7）蛋白通过长的非编码RNA，ANRIL（INK4基因座中的反义非编码RNA）定向的染色体结构域（ChD）结合三甲基化赖氨酸27来抑制肿瘤抑制因子p16 INK4a的转录。H3（H3K27me3）的合成，导致INK4a / ARF处的染色质紧实轨迹。在这项研究中，我们报告了两种不同类型的CBX7ChD小分子拮抗剂的结构指导发现。我们的A类化合物（包括以前报道的MS452的类似物）通过占据H3K27me3肽结合位点来抑制CBX7ChD /甲基赖氨酸结合，而我们的B类化合物（新发现的MS351）在结合CBX7ChD时似乎抑制了H3K27me3结合。 RNA。我们的CBX7ChD / MS351配合物的晶体结构揭示了通常通过甲基赖氨酸结合作用的芳香族笼状残基识别配体的分子细节。我们进一步证明，MS351有效诱导CBX7目标基因（包括p16 INK4